MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Choleraesuis str. SC-B67 chromosome

Total Repeats: 16682

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_006905	CAG	2	6	3280848	3280853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11502	NC_006905	TACAA	2	10	3280870	3280879	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
11503	NC_006905	TAA	2	6	3280884	3280889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11504	NC_006905	CAT	2	6	3280900	3280905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11505	NC_006905	TTG	2	6	3280922	3280927	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11506	NC_006905	GCC	2	6	3280940	3280945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11507	NC_006905	CTG	2	6	3280978	3280983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11508	NC_006905	AT	3	6	3282961	3282966	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11509	NC_006905	TTG	2	6	3282996	3283001	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11510	NC_006905	GA	3	6	3284813	3284818	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11511	NC_006905	ATG	2	6	3284838	3284843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11512	NC_006905	GCC	2	6	3284859	3284864	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11513	NC_006905	T	6	6	3286064	3286069	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11514	NC_006905	CGA	2	6	3287019	3287024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11515	NC_006905	GTC	2	6	3287026	3287031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11516	NC_006905	T	7	7	3287036	3287042	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11517	NC_006905	CA	4	8	3287094	3287101	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11518	NC_006905	ATT	2	6	3287110	3287115	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11519	NC_006905	ATT	2	6	3287141	3287146	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11520	NC_006905	TA	3	6	3287163	3287168	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11521	NC_006905	TG	3	6	3287182	3287187	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11522	NC_006905	AGCGC	2	10	3289223	3289232	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
11523	NC_006905	TA	3	6	3289255	3289260	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11524	NC_006905	CTT	2	6	3289261	3289266	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11525	NC_006905	AT	3	6	3289277	3289282	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11526	NC_006905	AAC	2	6	3289444	3289449	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11527	NC_006905	TAT	2	6	3289453	3289458	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11528	NC_006905	AAT	3	9	3289480	3289488	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11529	NC_006905	CTC	2	6	3289506	3289511	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11530	NC_006905	CAT	2	6	3289528	3289533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11531	NC_006905	AT	3	6	3289552	3289557	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11532	NC_006905	AATT	2	8	3289558	3289565	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11533	NC_006905	CAAT	2	8	3289570	3289577	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11534	NC_006905	TAAA	2	8	3289584	3289591	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11535	NC_006905	AT	3	6	3289636	3289641	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11536	NC_006905	A	7	7	3291893	3291899	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11537	NC_006905	AAC	2	6	3291986	3291991	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11538	NC_006905	GGCCT	2	10	3291999	3292008	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
11539	NC_006905	AATT	2	8	3292054	3292061	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11540	NC_006905	AAC	2	6	3292093	3292098	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11541	NC_006905	A	7	7	3292106	3292112	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11542	NC_006905	AT	3	6	3292129	3292134	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11543	NC_006905	A	7	7	3292135	3292141	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11544	NC_006905	TCT	2	6	3292182	3292187	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11545	NC_006905	TCTT	2	8	3292200	3292207	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
11546	NC_006905	ATTAA	2	10	3292218	3292227	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
11547	NC_006905	CAC	2	6	3292264	3292269	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11548	NC_006905	CAG	2	6	3292299	3292304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11549	NC_006905	TTA	2	6	3292306	3292311	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11550	NC_006905	A	6	6	3296680	3296685	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11551	NC_006905	AAC	2	6	3297453	3297458	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11552	NC_006905	CT	3	6	3297527	3297532	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11553	NC_006905	AAC	2	6	3297567	3297572	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11554	NC_006905	CGT	2	6	3297636	3297641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11555	NC_006905	GGC	2	6	3297668	3297673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11556	NC_006905	ATA	2	6	3300023	3300028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11557	NC_006905	CCT	2	6	3300950	3300955	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11558	NC_006905	GGC	2	6	3300977	3300982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11559	NC_006905	CACCG	2	10	3303615	3303624	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
11560	NC_006905	CAG	2	6	3303641	3303646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11561	NC_006905	TTA	2	6	3304601	3304606	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11562	NC_006905	GATGC	2	10	3304627	3304636	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
11563	NC_006905	GCG	2	6	3304657	3304662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11564	NC_006905	CAA	2	6	3304715	3304720	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11565	NC_006905	ATTG	2	8	3306636	3306643	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
11566	NC_006905	ACG	2	6	3308071	3308076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11567	NC_006905	TGC	2	6	3309131	3309136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11568	NC_006905	AAT	2	6	3309146	3309151	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11569	NC_006905	ATG	2	6	3309158	3309163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11570	NC_006905	GGT	2	6	3309173	3309178	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11571	NC_006905	CTG	2	6	3309182	3309187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11572	NC_006905	ATT	2	6	3309281	3309286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11573	NC_006905	CAA	2	6	3309320	3309325	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11574	NC_006905	GCGCT	2	10	3310819	3310828	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
11575	NC_006905	GCG	2	6	3310862	3310867	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11576	NC_006905	CCG	2	6	3310922	3310927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11577	NC_006905	TGT	2	6	3310983	3310988	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11578	NC_006905	TTC	2	6	3313755	3313760	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11580	NC_006905	ATG	2	6	3313784	3313789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11581	NC_006905	ATC	2	6	3313793	3313798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11582	NC_006905	AAAT	2	8	3314963	3314970	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11583	NC_006905	GTG	2	6	3314991	3314996	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11584	NC_006905	AAT	2	6	3315003	3315008	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11585	NC_006905	CTA	2	6	3315089	3315094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11586	NC_006905	ACTC	2	8	3315098	3315105	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
11587	NC_006905	A	6	6	3315114	3315119	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11588	NC_006905	CAT	2	6	3315155	3315160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11589	NC_006905	TAT	2	6	3315195	3315200	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11590	NC_006905	TAT	2	6	3315227	3315232	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11591	NC_006905	TA	3	6	3315245	3315250	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11592	NC_006905	AT	3	6	3315256	3315261	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11593	NC_006905	GGAA	2	8	3317067	3317074	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11594	NC_006905	AAT	2	6	3318498	3318503	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11595	NC_006905	TCG	2	6	3318521	3318526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11596	NC_006905	A	6	6	3318564	3318569	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11597	NC_006905	T	6	6	3318590	3318595	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11598	NC_006905	CAG	2	6	3319090	3319095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11599	NC_006905	TACAA	2	10	3319112	3319121	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
11600	NC_006905	TAA	2	6	3319126	3319131	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11601	NC_006905	CAT	2	6	3319142	3319147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11602	NC_006905	TTG	2	6	3319164	3319169	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11603	NC_006905	GCC	2	6	3319182	3319187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11604	NC_006905	CTG	2	6	3319220	3319225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11606	NC_006905	A	7	7	3320651	3320657	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11607	NC_006905	AAT	2	6	3321356	3321361	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11608	NC_006905	CGG	2	6	3321667	3321672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11609	NC_006905	T	7	7	3324217	3324223	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11610	NC_006905	T	6	6	3324227	3324232	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11611	NC_006905	CAG	2	6	3324261	3324266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11612	NC_006905	CGG	2	6	3324301	3324306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11613	NC_006905	CAA	2	6	3324339	3324344	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11614	NC_006905	TAA	2	6	3324399	3324404	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11615	NC_006905	ATG	2	6	3324415	3324420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11616	NC_006905	TCA	2	6	3324428	3324433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11617	NC_006905	G	6	6	3324487	3324492	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
11618	NC_006905	CTTTA	2	10	3324517	3324526	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
11619	NC_006905	A	8	8	3324532	3324539	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11620	NC_006905	CGC	2	6	3324603	3324608	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11621	NC_006905	GA	3	6	3326079	3326084	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11622	NC_006905	GC	3	6	3326095	3326100	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11623	NC_006905	ATA	2	6	3326102	3326107	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11624	NC_006905	AAT	2	6	3328976	3328981	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11625	NC_006905	GGC	2	6	3328989	3328994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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