MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Choleraesuis str. SC-B67 chromosome

Total Repeats: 16682

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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11002	NC_006905	T	7	7	3123928	3123934	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11003	NC_006905	CCG	2	6	3124680	3124685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11004	NC_006905	TCT	2	6	3124713	3124718	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11005	NC_006905	TGC	2	6	3124734	3124739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11006	NC_006905	TTA	2	6	3124762	3124767	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11007	NC_006905	TAT	2	6	3124774	3124779	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11008	NC_006905	TAT	2	6	3124800	3124805	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11009	NC_006905	CGC	2	6	3125141	3125146	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11010	NC_006905	ATA	2	6	3125223	3125228	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11011	NC_006905	CG	3	6	3126343	3126348	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11012	NC_006905	CGC	2	6	3126351	3126356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11013	NC_006905	A	8	8	3129815	3129822	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11014	NC_006905	AAT	2	6	3129874	3129879	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11015	NC_006905	CAAT	2	8	3129885	3129892	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11016	NC_006905	CG	3	6	3129919	3129924	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11017	NC_006905	A	8	8	3130016	3130023	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11018	NC_006905	CAA	2	6	3130063	3130068	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11019	NC_006905	CAC	2	6	3130103	3130108	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11020	NC_006905	CAG	2	6	3130135	3130140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11021	NC_006905	CGG	2	6	3130234	3130239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11022	NC_006905	TAT	2	6	3130309	3130314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11023	NC_006905	AGAA	2	8	3133693	3133700	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
11024	NC_006905	A	6	6	3133702	3133707	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11025	NC_006905	C	7	7	3135355	3135361	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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11028	NC_006905	T	6	6	3137070	3137075	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11030	NC_006905	TAT	2	6	3137118	3137123	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11031	NC_006905	AT	3	6	3137130	3137135	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11032	NC_006905	A	7	7	3137180	3137186	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11033	NC_006905	ATCG	2	8	3138938	3138945	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11034	NC_006905	ATTT	2	8	3138975	3138982	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11035	NC_006905	CAT	2	6	3138988	3138993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11037	NC_006905	TAAA	2	8	3139021	3139028	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11039	NC_006905	GAATT	2	10	3139193	3139202	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
11040	NC_006905	TGGC	2	8	3139335	3139342	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
11041	NC_006905	ACC	2	6	3140529	3140534	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11042	NC_006905	TAG	2	6	3140557	3140562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11043	NC_006905	ATT	2	6	3140566	3140571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11044	NC_006905	A	7	7	3140595	3140601	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11045	NC_006905	T	6	6	3141290	3141295	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11046	NC_006905	CTC	3	9	3141320	3141328	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11047	NC_006905	CATC	2	8	3141334	3141341	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
11048	NC_006905	CTT	2	6	3141385	3141390	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11049	NC_006905	TG	3	6	3141393	3141398	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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11051	NC_006905	G	6	6	3143009	3143014	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
11052	NC_006905	G	7	7	3143029	3143035	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
11053	NC_006905	AAC	2	6	3143057	3143062	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11054	NC_006905	CTT	2	6	3143095	3143100	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11055	NC_006905	TTC	2	6	3143119	3143124	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11056	NC_006905	TTA	2	6	3143140	3143145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11057	NC_006905	ATG	2	6	3143185	3143190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11059	NC_006905	TGGG	2	8	3143291	3143298	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
11060	NC_006905	ATT	3	9	3143362	3143370	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11061	NC_006905	GGCGA	2	10	3143405	3143414	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
11062	NC_006905	GCA	2	6	3143415	3143420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11063	NC_006905	TGGC	2	8	3143422	3143429	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
11064	NC_006905	ACC	2	6	3143435	3143440	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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11066	NC_006905	CACGAC	9	54	3143479	3143532	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
11067	NC_006905	CAT	2	6	3143533	3143538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11069	NC_006905	GCG	2	6	3143801	3143806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11070	NC_006905	GCA	2	6	3143822	3143827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11071	NC_006905	CGG	2	6	3143858	3143863	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11072	NC_006905	TGGTC	2	10	3143890	3143899	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
11073	NC_006905	CCACCG	2	12	3144094	3144105	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
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11075	NC_006905	GAA	2	6	3145439	3145444	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11077	NC_006905	TTAA	2	8	3145478	3145485	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11078	NC_006905	TAT	2	6	3145733	3145738	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11079	NC_006905	GTC	2	6	3149871	3149876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11081	NC_006905	CGAT	2	8	3150777	3150784	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11082	NC_006905	AAT	2	6	3150805	3150810	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11083	NC_006905	ACAG	2	8	3150858	3150865	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
11084	NC_006905	AT	3	6	3150896	3150901	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11085	NC_006905	ATGT	2	8	3150910	3150917	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
11086	NC_006905	ATA	2	6	3150952	3150957	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11087	NC_006905	AT	3	6	3150964	3150969	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11088	NC_006905	A	6	6	3150993	3150998	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11092	NC_006905	A	6	6	3151082	3151087	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11093	NC_006905	TAA	2	6	3151088	3151093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11094	NC_006905	TTC	2	6	3151105	3151110	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11095	NC_006905	TGC	2	6	3151236	3151241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11096	NC_006905	CTG	2	6	3151242	3151247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11097	NC_006905	CAG	2	6	3151257	3151262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11098	NC_006905	CAT	2	6	3151911	3151916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11099	NC_006905	T	6	6	3151932	3151937	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11100	NC_006905	GAGT	2	8	3152765	3152772	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
11101	NC_006905	CGA	2	6	3152846	3152851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11102	NC_006905	ATGG	2	8	3152870	3152877	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
11103	NC_006905	TA	3	6	3152925	3152930	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11104	NC_006905	AAG	2	6	3152937	3152942	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11105	NC_006905	G	7	7	3153002	3153008	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
11106	NC_006905	A	7	7	3153058	3153064	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11107	NC_006905	TATT	2	8	3153122	3153129	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11108	NC_006905	A	7	7	3153177	3153183	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11109	NC_006905	ACC	2	6	3153185	3153190	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11110	NC_006905	ACC	2	6	3153210	3153215	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11111	NC_006905	CGA	2	6	3154388	3154393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11112	NC_006905	CCA	2	6	3154394	3154399	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11113	NC_006905	AGCC	2	8	3154462	3154469	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
11114	NC_006905	A	6	6	3154501	3154506	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11115	NC_006905	ATG	2	6	3154526	3154531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11117	NC_006905	GGTAAA	2	12	3154619	3154630	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11118	NC_006905	A	6	6	3154628	3154633	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11119	NC_006905	GAT	2	6	3154654	3154659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11120	NC_006905	A	6	6	3154767	3154772	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11121	NC_006905	ATA	2	6	3155490	3155495	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11124	NC_006905	GAT	3	9	3156588	3156596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11125	NC_006905	ATA	2	6	3156621	3156626	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11126	NC_006905	CTTT	2	8	3156685	3156692	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
11127	NC_006905	TGGCC	2	10	3156725	3156734	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
11128	NC_006905	TGC	2	6	3156736	3156741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11261	NC_006905	AG	3	6	3200625	3200630	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11262	NC_006905	TTG	2	6	3200658	3200663	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11264	NC_006905	CTTAA	2	10	3200720	3200729	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
11265	NC_006905	TCA	2	6	3200757	3200762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11276	NC_006905	CTTT	2	8	3201302	3201309	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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