MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Choleraesuis str. SC-B67 chromosome

Total Repeats: 16682

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_006905	CCA	2	6	2264714	2264719	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8002	NC_006905	AC	3	6	2264731	2264736	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8003	NC_006905	T	6	6	2265132	2265137	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8004	NC_006905	TTG	2	6	2265177	2265182	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8005	NC_006905	TTA	2	6	2265280	2265285	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8006	NC_006905	TTCA	2	8	2265303	2265310	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8007	NC_006905	AT	3	6	2265322	2265327	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8008	NC_006905	TTA	2	6	2270184	2270189	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8009	NC_006905	AGG	2	6	2270217	2270222	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8010	NC_006905	TTG	2	6	2270247	2270252	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8011	NC_006905	CAA	2	6	2270286	2270291	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8012	NC_006905	ATT	2	6	2270308	2270313	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8013	NC_006905	TTA	2	6	2270322	2270327	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8014	NC_006905	TAAATA	2	12	2270349	2270360	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8015	NC_006905	CAA	2	6	2270361	2270366	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8016	NC_006905	A	6	6	2270369	2270374	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8017	NC_006905	TAA	2	6	2270414	2270419	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8018	NC_006905	TGA	2	6	2270754	2270759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8019	NC_006905	A	6	6	2270795	2270800	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8020	NC_006905	AAT	2	6	2270831	2270836	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8021	NC_006905	ATT	2	6	2270847	2270852	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8022	NC_006905	CTGT	2	8	2270865	2270872	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8023	NC_006905	TAT	2	6	2270900	2270905	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8024	NC_006905	TTA	2	6	2270907	2270912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8025	NC_006905	AT	4	8	2270930	2270937	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8026	NC_006905	AGG	2	6	2270975	2270980	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8027	NC_006905	ATT	2	6	2272156	2272161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8028	NC_006905	T	6	6	2272226	2272231	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8029	NC_006905	ACA	2	6	2272232	2272237	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8030	NC_006905	GAA	2	6	2272238	2272243	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8031	NC_006905	CAA	2	6	2274291	2274296	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8032	NC_006905	T	6	6	2274315	2274320	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8033	NC_006905	CCT	2	6	2274348	2274353	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8034	NC_006905	CG	3	6	2274355	2274360	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8035	NC_006905	TAA	2	6	2274376	2274381	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8036	NC_006905	TC	3	6	2274441	2274446	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8037	NC_006905	AATT	2	8	2274473	2274480	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8038	NC_006905	ATT	2	6	2274488	2274493	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8039	NC_006905	TA	3	6	2274510	2274515	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8040	NC_006905	GGCA	2	8	2274991	2274998	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
8041	NC_006905	GCT	2	6	2275035	2275040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8042	NC_006905	TCTTT	2	10	2275050	2275059	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
8043	NC_006905	A	6	6	2275070	2275075	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8044	NC_006905	CT	4	8	2275199	2275206	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8045	NC_006905	AAG	2	6	2275283	2275288	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8046	NC_006905	TAC	2	6	2275367	2275372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8047	NC_006905	ACT	2	6	2275411	2275416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8048	NC_006905	AAT	2	6	2275434	2275439	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8049	NC_006905	AGA	2	6	2275442	2275447	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8050	NC_006905	TAA	2	6	2275691	2275696	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8051	NC_006905	CTG	2	6	2278622	2278627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8052	NC_006905	AGC	3	9	2278629	2278637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8053	NC_006905	ACAT	2	8	2278694	2278701	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8054	NC_006905	CTTT	2	8	2278715	2278722	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
8055	NC_006905	CGC	2	6	2278768	2278773	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8056	NC_006905	A	6	6	2278806	2278811	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8057	NC_006905	CAG	2	6	2279616	2279621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8058	NC_006905	TTA	2	6	2279652	2279657	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8059	NC_006905	A	6	6	2283551	2283556	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8060	NC_006905	GGCA	2	8	2283612	2283619	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
8061	NC_006905	G	6	6	2283626	2283631	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
8062	NC_006905	TC	3	6	2285992	2285997	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8063	NC_006905	TTTATC	2	12	2285998	2286009	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8064	NC_006905	CGA	2	6	2286011	2286016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8065	NC_006905	GAG	2	6	2286067	2286072	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8066	NC_006905	GGC	2	6	2286142	2286147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8067	NC_006905	ACC	2	6	2286156	2286161	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8068	NC_006905	CAC	2	6	2286234	2286239	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8069	NC_006905	CGG	2	6	2288007	2288012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8070	NC_006905	TGCC	2	8	2288018	2288025	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
8071	NC_006905	GCG	2	6	2288032	2288037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8072	NC_006905	CG	3	6	2289012	2289017	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8073	NC_006905	CAT	2	6	2289066	2289071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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8075	NC_006905	TGC	2	6	2289115	2289120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8076	NC_006905	A	6	6	2289716	2289721	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8077	NC_006905	CTG	2	6	2289752	2289757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8078	NC_006905	GGT	2	6	2289887	2289892	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8079	NC_006905	CGC	2	6	2290494	2290499	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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8081	NC_006905	ATC	2	6	2291329	2291334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8082	NC_006905	A	7	7	2292794	2292800	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8083	NC_006905	AG	3	6	2292808	2292813	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8084	NC_006905	GAT	2	6	2293168	2293173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8085	NC_006905	A	7	7	2294192	2294198	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8086	NC_006905	CT	3	6	2294217	2294222	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8087	NC_006905	GGC	2	6	2294249	2294254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8088	NC_006905	TC	4	8	2296850	2296857	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8089	NC_006905	TGT	2	6	2299299	2299304	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8092	NC_006905	ATG	2	6	2300367	2300372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8093	NC_006905	CTCTC	2	10	2302610	2302619	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
8094	NC_006905	CGG	2	6	2302668	2302673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8095	NC_006905	TATT	2	8	2303705	2303712	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8096	NC_006905	TTA	3	9	2303735	2303743	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8097	NC_006905	T	7	7	2303783	2303789	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8098	NC_006905	CTT	2	6	2303812	2303817	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8099	NC_006905	GC	3	6	2306396	2306401	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8100	NC_006905	AAG	2	6	2307489	2307494	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8101	NC_006905	GTT	3	9	2307518	2307526	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8102	NC_006905	TCA	2	6	2307561	2307566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8103	NC_006905	AGA	2	6	2307607	2307612	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8104	NC_006905	ATG	2	6	2307617	2307622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8105	NC_006905	T	6	6	2307634	2307639	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8106	NC_006905	GCC	2	6	2307769	2307774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8107	NC_006905	TGCG	2	8	2307791	2307798	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
8108	NC_006905	ACG	2	6	2307955	2307960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8109	NC_006905	TTCG	2	8	2307997	2308004	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8110	NC_006905	ATT	2	6	2308012	2308017	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8111	NC_006905	GAC	2	6	2308049	2308054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8112	NC_006905	CGA	2	6	2308080	2308085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8113	NC_006905	CAT	2	6	2308263	2308268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8114	NC_006905	TATCCA	2	12	2308280	2308291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8115	NC_006905	TTC	2	6	2308365	2308370	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8116	NC_006905	AAT	2	6	2308422	2308427	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8117	NC_006905	GAT	2	6	2308436	2308441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8118	NC_006905	ATA	2	6	2308480	2308485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8119	NC_006905	ATC	2	6	2308525	2308530	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8120	NC_006905	CG	6	12	2308559	2308570	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8121	NC_006905	TCA	2	6	2308591	2308596	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8122	NC_006905	TGG	2	6	2308649	2308654	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8123	NC_006905	CTT	2	6	2308745	2308750	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8124	NC_006905	CTT	2	6	2308769	2308774	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8125	NC_006905	TGC	2	6	2308790	2308795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8126	NC_006905	TAA	2	6	2308830	2308835	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8127	NC_006905	CAA	2	6	2308956	2308961	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8128	NC_006905	CGA	2	6	2308971	2308976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8129	NC_006905	TGC	2	6	2308988	2308993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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8131	NC_006905	CAA	2	6	2309102	2309107	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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8259	NC_006905	AACA	2	8	2352492	2352499	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
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