MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Choleraesuis str. SC-B67 chromosome

Total Repeats: 16682

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_006905	TGCC	2	8	1430225	1430232	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5002	NC_006905	TTAT	2	8	1430239	1430246	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5003	NC_006905	ATT	2	6	1430255	1430260	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5004	NC_006905	G	7	7	1430275	1430281	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5005	NC_006905	GA	3	6	1430299	1430304	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5006	NC_006905	CGG	2	6	1430333	1430338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5007	NC_006905	A	6	6	1430369	1430374	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5008	NC_006905	GCG	2	6	1430425	1430430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5009	NC_006905	T	6	6	1430794	1430799	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5010	NC_006905	ATGCC	2	10	1432250	1432259	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
5011	NC_006905	GCG	2	6	1435745	1435750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5012	NC_006905	T	6	6	1435766	1435771	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5013	NC_006905	TCA	2	6	1438048	1438053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5014	NC_006905	GTA	2	6	1438068	1438073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5015	NC_006905	CG	3	6	1438160	1438165	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5016	NC_006905	GC	3	6	1438274	1438279	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5017	NC_006905	GTA	2	6	1438298	1438303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5018	NC_006905	A	7	7	1438638	1438644	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5019	NC_006905	GACA	2	8	1438679	1438686	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5020	NC_006905	T	7	7	1440145	1440151	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5021	NC_006905	AATGG	2	10	1440225	1440234	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
5022	NC_006905	GTG	2	6	1440914	1440919	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5023	NC_006905	A	6	6	1441695	1441700	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5024	NC_006905	ACG	2	6	1441794	1441799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5025	NC_006905	TC	3	6	1443265	1443270	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5026	NC_006905	A	6	6	1443316	1443321	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5027	NC_006905	CGC	2	6	1443347	1443352	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5028	NC_006905	GCG	2	6	1443693	1443698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5029	NC_006905	GCC	2	6	1443704	1443709	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5030	NC_006905	CCT	2	6	1444692	1444697	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5031	NC_006905	TTTA	2	8	1444768	1444775	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5032	NC_006905	AAG	2	6	1444776	1444781	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5033	NC_006905	TA	3	6	1444795	1444800	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5034	NC_006905	AATG	2	8	1444805	1444812	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5035	NC_006905	A	6	6	1444833	1444838	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5036	NC_006905	ATTG	2	8	1444849	1444856	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5037	NC_006905	CTT	2	6	1444872	1444877	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5038	NC_006905	CGT	2	6	1444936	1444941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5039	NC_006905	T	6	6	1444948	1444953	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5040	NC_006905	TA	3	6	1444968	1444973	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5041	NC_006905	GTTAC	2	10	1445745	1445754	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
5042	NC_006905	GTG	2	6	1445771	1445776	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5043	NC_006905	TAA	2	6	1446787	1446792	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5044	NC_006905	ATG	2	6	1446803	1446808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5047	NC_006905	ATT	2	6	1446920	1446925	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5048	NC_006905	ATT	2	6	1446963	1446968	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5049	NC_006905	ATA	2	6	1446987	1446992	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5050	NC_006905	T	6	6	1446998	1447003	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5051	NC_006905	ATG	2	6	1447050	1447055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5052	NC_006905	TTA	2	6	1447073	1447078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5053	NC_006905	ATT	2	6	1447146	1447151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5054	NC_006905	ATT	2	6	1447161	1447166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5055	NC_006905	TTA	3	9	1447174	1447182	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5056	NC_006905	GAA	2	6	1447185	1447190	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5057	NC_006905	T	7	7	1448130	1448136	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5058	NC_006905	CAC	2	6	1448284	1448289	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5059	NC_006905	CG	3	6	1450297	1450302	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5060	NC_006905	AAG	2	6	1450304	1450309	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5061	NC_006905	AGC	2	6	1450334	1450339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5062	NC_006905	TTA	2	6	1450847	1450852	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5063	NC_006905	TTA	2	6	1450870	1450875	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5064	NC_006905	GGCT	2	8	1451500	1451507	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5065	NC_006905	CT	3	6	1451510	1451515	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5066	NC_006905	TTTA	2	8	1451516	1451523	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5067	NC_006905	GCT	2	6	1451609	1451614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5068	NC_006905	T	7	7	1451627	1451633	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5071	NC_006905	A	6	6	1451691	1451696	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5072	NC_006905	CCT	2	6	1451698	1451703	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5073	NC_006905	T	7	7	1451713	1451719	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5074	NC_006905	GA	3	6	1451732	1451737	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5075	NC_006905	CATC	2	8	1455491	1455498	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5076	NC_006905	T	6	6	1455610	1455615	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5079	NC_006905	TTG	2	6	1458116	1458121	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5081	NC_006905	CAT	2	6	1458661	1458666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5083	NC_006905	TTA	2	6	1458704	1458709	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5084	NC_006905	A	7	7	1458777	1458783	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5087	NC_006905	AGG	2	6	1459669	1459674	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5094	NC_006905	CG	4	8	1461437	1461444	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5095	NC_006905	GGGT	2	8	1461454	1461461	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
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5098	NC_006905	CTG	2	6	1462625	1462630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5099	NC_006905	GCAG	2	8	1462659	1462666	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5100	NC_006905	AACC	2	8	1462684	1462691	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5101	NC_006905	TAAT	2	8	1463646	1463653	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5102	NC_006905	GT	3	6	1463659	1463664	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5103	NC_006905	A	6	6	1463753	1463758	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5104	NC_006905	A	6	6	1463761	1463766	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5105	NC_006905	T	7	7	1463791	1463797	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5106	NC_006905	GGC	2	6	1466269	1466274	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5109	NC_006905	CGA	2	6	1469629	1469634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5110	NC_006905	CTG	2	6	1471437	1471442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5112	NC_006905	AAT	2	6	1471573	1471578	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5113	NC_006905	ATC	2	6	1471592	1471597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5114	NC_006905	T	6	6	1471599	1471604	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5115	NC_006905	TGT	2	6	1471621	1471626	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5116	NC_006905	ATA	2	6	1471682	1471687	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5117	NC_006905	ATA	2	6	1471726	1471731	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5118	NC_006905	AAT	2	6	1471748	1471753	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5119	NC_006905	ACA	2	6	1471783	1471788	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5120	NC_006905	CGCT	2	8	1471793	1471800	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5121	NC_006905	AT	3	6	1472742	1472747	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5122	NC_006905	TAT	2	6	1475582	1475587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5124	NC_006905	TATT	2	8	1475674	1475681	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5127	NC_006905	TTA	2	6	1478739	1478744	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5128	NC_006905	TAC	2	6	1478751	1478756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5129	NC_006905	CATTT	2	10	1478849	1478858	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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5131	NC_006905	TGT	2	6	1478892	1478897	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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