MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Staphylococcus epidermidis RP62A plasmid pSERP

Total Repeats: 159

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006663	ATTT	2	8	32	39	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_006663	AATG	2	8	817	824	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_006663	ATC	2	6	889	894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_006663	TAT	2	6	895	900	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_006663	TAG	2	6	917	922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_006663	TATAA	2	10	976	985	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_006663	AGA	2	6	1635	1640	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_006663	ATTAT	2	10	1656	1665	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_006663	TAA	2	6	2584	2589	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_006663	TAT	2	6	2621	2626	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_006663	AAT	2	6	2628	2633	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_006663	AAG	2	6	2637	2642	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_006663	ATA	2	6	4798	4803	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_006663	TTA	2	6	4827	4832	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_006663	TAA	2	6	4845	4850	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_006663	TTA	2	6	4864	4869	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_006663	T	6	6	4914	4919	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_006663	TAAG	2	8	4927	4934	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_006663	CAA	2	6	4964	4969	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_006663	A	6	6	4968	4973	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_006663	TA	3	6	5023	5028	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_006663	CTA	2	6	5650	5655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_006663	AAT	2	6	5656	5661	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_006663	TA	3	6	5664	5669	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_006663	ATA	2	6	5743	5748	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_006663	TAA	3	9	5768	5776	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_006663	A	6	6	5783	5788	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_006663	T	6	6	5807	5812	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_006663	ATA	2	6	5816	5821	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_006663	TCA	2	6	5853	5858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_006663	TAA	2	6	5875	5880	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_006663	CAA	2	6	5888	5893	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_006663	ATT	2	6	6106	6111	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_006663	TAA	2	6	6201	6206	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_006663	TCA	2	6	6247	6252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_006663	AC	3	6	6254	6259	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_006663	AGA	2	6	6294	6299	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_006663	TCT	2	6	6353	6358	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_006663	TCC	2	6	7420	7425	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_006663	AGCT	2	8	7465	7472	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_006663	TAT	2	6	8484	8489	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_006663	TTCC	2	8	8490	8497	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_006663	AAG	2	6	8526	8531	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_006663	CTG	2	6	11665	11670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_006663	T	7	7	11718	11724	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_006663	CTG	2	6	11772	11777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_006663	CATT	2	8	11813	11820	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_006663	CA	3	6	11884	11889	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_006663	CT	3	6	11981	11986	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_006663	ATG	2	6	12002	12007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_006663	TCC	2	6	14513	14518	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_006663	CACT	2	8	14541	14548	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_006663	TA	3	6	14554	14559	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_006663	T	8	8	14564	14571	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_006663	A	6	6	14587	14592	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_006663	AG	3	6	14596	14601	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_006663	ATTTT	2	10	14607	14616	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_006663	CAA	2	6	14643	14648	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_006663	TA	3	6	14709	14714	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_006663	TCT	2	6	15685	15690	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_006663	T	6	6	16404	16409	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_006663	AT	3	6	17055	17060	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_006663	T	6	6	17076	17081	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_006663	T	6	6	17098	17103	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_006663	TAA	2	6	17112	17117	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_006663	GAG	2	6	17158	17163	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_006663	ATT	2	6	17180	17185	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_006663	ATC	2	6	17186	17191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_006663	TAT	2	6	17934	17939	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_006663	CAAAG	2	10	17969	17978	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
71	NC_006663	T	7	7	17984	17990	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_006663	TATC	2	8	17994	18001	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NC_006663	GATAA	2	10	18045	18054	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
74	NC_006663	CAA	2	6	18061	18066	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_006663	CCT	2	6	18096	18101	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_006663	TATAA	2	10	18126	18135	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_006663	A	6	6	18168	18173	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_006663	ATG	2	6	18299	18304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_006663	AGTT	2	8	18377	18384	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_006663	TAGT	2	8	18406	18413	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_006663	TA	3	6	18450	18455	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_006663	TAA	2	6	18486	18491	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_006663	TCT	3	9	18506	18514	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_006663	TAT	2	6	18517	18522	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_006663	ATT	2	6	18532	18537	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_006663	CAA	2	6	18583	18588	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_006663	A	6	6	18594	18599	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_006663	AAT	2	6	18602	18607	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_006663	TTCT	2	8	18661	18668	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
90	NC_006663	TAA	2	6	18680	18685	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_006663	AAT	2	6	18707	18712	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_006663	AAT	2	6	18727	18732	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_006663	ATC	2	6	18743	18748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_006663	AGT	2	6	18879	18884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_006663	TTCT	2	8	18909	18916	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
96	NC_006663	AATAG	2	10	18947	18956	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
97	NC_006663	AT	3	6	18964	18969	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_006663	TCCA	2	8	18990	18997	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_006663	AT	3	6	19007	19012	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_006663	TCA	2	6	19013	19018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_006663	TGC	2	6	19024	19029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_006663	AGA	2	6	19056	19061	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_006663	AATA	2	8	19078	19085	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_006663	ATA	2	6	19099	19104	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_006663	TAAAA	2	10	19137	19146	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_006663	TTTA	2	8	21071	21078	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_006663	GTG	2	6	21157	21162	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_006663	TGA	2	6	21717	21722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_006663	GTT	2	6	21725	21730	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_006663	AAG	2	6	21769	21774	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_006663	TAA	2	6	22039	22044	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_006663	TTTTGA	2	12	22102	22113	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_006663	T	6	6	22155	22160	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_006663	CAA	2	6	22198	22203	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_006663	TGA	2	6	22266	22271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_006663	TAT	2	6	24575	24580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_006663	AAT	2	6	24647	24652	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_006663	TAA	2	6	24664	24669	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_006663	TAAA	2	8	24684	24691	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_006663	A	6	6	24689	24694	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_006663	TATAA	2	10	24880	24889	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_006663	TCT	2	6	24906	24911	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_006663	CTA	2	6	24970	24975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_006663	AT	3	6	25002	25007	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_006663	GTG	2	6	25026	25031	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
126	NC_006663	TCA	2	6	25039	25044	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_006663	GAA	2	6	25099	25104	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_006663	A	6	6	25112	25117	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_006663	TTA	2	6	25120	25125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_006663	TGA	2	6	25138	25143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_006663	ACAT	2	8	25204	25211	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
132	NC_006663	GCA	2	6	25331	25336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_006663	TTAAAC	2	12	25359	25370	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
134	NC_006663	AAGA	2	8	25438	25445	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
135	NC_006663	TA	3	6	25509	25514	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_006663	CAT	2	6	25570	25575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_006663	AT	3	6	25604	25609	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_006663	T	6	6	25625	25630	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_006663	ATTTT	2	10	25656	25665	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_006663	ATT	2	6	25691	25696	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_006663	AATATA	2	12	25702	25713	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_006663	A	7	7	25720	25726	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_006663	TGCT	2	8	25759	25766	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
144	NC_006663	TTA	2	6	25870	25875	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_006663	TCC	2	6	25887	25892	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
146	NC_006663	CTT	2	6	25893	25898	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_006663	AGC	2	6	25903	25908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_006663	TGT	2	6	25915	25920	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
149	NC_006663	GGT	2	6	25974	25979	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
150	NC_006663	AG	3	6	26008	26013	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
151	NC_006663	TTG	2	6	27091	27096	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
152	NC_006663	TA	3	6	27097	27102	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_006663	AT	3	6	27107	27112	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_006663	TTA	2	6	27143	27148	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_006663	AGT	2	6	27168	27173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
156	NC_006663	TAT	2	6	27187	27192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_006663	A	6	6	27208	27213	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_006663	ATC	2	6	27270	27275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
159	NC_006663	T	6	6	27295	27300	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.