MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Synechococcus elongatus PCC 6301 chromosome

Total Repeats: 5889

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_006576	CAGC	2	8	183086	183093	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
502	NC_006576	CCCTTT	2	12	186329	186340	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
503	NC_006576	ATCG	2	8	186378	186385	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
504	NC_006576	CTC	2	6	186388	186393	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
505	NC_006576	AGA	2	6	186394	186399	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
506	NC_006576	TGA	2	6	190215	190220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
507	NC_006576	TCT	2	6	190235	190240	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
508	NC_006576	GGC	2	6	190258	190263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
509	NC_006576	CTG	2	6	190333	190338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
510	NC_006576	CG	3	6	190362	190367	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
511	NC_006576	AAC	2	6	191017	191022	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
512	NC_006576	AGCC	2	8	191032	191039	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
513	NC_006576	AAG	2	6	193267	193272	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
514	NC_006576	CCA	2	6	193273	193278	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
515	NC_006576	CAA	2	6	193292	193297	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
516	NC_006576	AGAC	2	8	193327	193334	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
517	NC_006576	TGA	2	6	193357	193362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
518	NC_006576	T	6	6	193364	193369	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
519	NC_006576	CGC	2	6	193390	193395	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
520	NC_006576	CGC	2	6	193413	193418	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
521	NC_006576	AGC	2	6	193518	193523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
522	NC_006576	GCT	2	6	193567	193572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
523	NC_006576	CTG	2	6	193583	193588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
524	NC_006576	G	6	6	193614	193619	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
525	NC_006576	AGG	2	6	193742	193747	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
526	NC_006576	TTAA	2	8	194030	194037	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
527	NC_006576	GTA	2	6	194052	194057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
528	NC_006576	CAA	2	6	194164	194169	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
529	NC_006576	CCGGA	2	10	196124	196133	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
530	NC_006576	CTT	2	6	197927	197932	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
531	NC_006576	GCA	2	6	197958	197963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
532	NC_006576	AGC	2	6	199329	199334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
533	NC_006576	GCA	2	6	199356	199361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
534	NC_006576	CGG	2	6	199365	199370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
535	NC_006576	CCG	2	6	199430	199435	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
536	NC_006576	TGG	2	6	199488	199493	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
537	NC_006576	T	6	6	199604	199609	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
538	NC_006576	TGG	2	6	199617	199622	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
539	NC_006576	GCA	2	6	203298	203303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
540	NC_006576	G	6	6	203363	203368	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
541	NC_006576	TGG	2	6	203458	203463	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
542	NC_006576	AGCT	2	8	203474	203481	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
543	NC_006576	GATG	2	8	203493	203500	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
544	NC_006576	ATG	2	6	203504	203509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
545	NC_006576	CCAGT	2	10	203572	203581	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
546	NC_006576	CTGG	2	8	204165	204172	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
547	NC_006576	GGCT	2	8	204190	204197	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
548	NC_006576	GCC	2	6	204250	204255	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
549	NC_006576	CAG	2	6	204842	204847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
550	NC_006576	GCC	2	6	204867	204872	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
551	NC_006576	A	6	6	206555	206560	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
552	NC_006576	ATT	2	6	206565	206570	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
553	NC_006576	TA	3	6	206651	206656	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
554	NC_006576	GCT	2	6	206688	206693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
555	NC_006576	GA	3	6	207553	207558	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
556	NC_006576	TGAC	2	8	207650	207657	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
557	NC_006576	AAG	2	6	212618	212623	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
558	NC_006576	AGT	2	6	212674	212679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
559	NC_006576	GCGG	2	8	212713	212720	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
560	NC_006576	GCT	2	6	212747	212752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
561	NC_006576	GCT	2	6	212852	212857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
562	NC_006576	TCTG	2	8	212904	212911	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
563	NC_006576	TGC	2	6	212943	212948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
564	NC_006576	CAC	2	6	213651	213656	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
565	NC_006576	TCG	2	6	213767	213772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
566	NC_006576	CAG	2	6	213781	213786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
567	NC_006576	GCC	2	6	216538	216543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
568	NC_006576	CTG	2	6	216554	216559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
569	NC_006576	GGA	3	9	216606	216614	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
570	NC_006576	GAA	2	6	217640	217645	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
571	NC_006576	CGAT	2	8	217687	217694	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
572	NC_006576	CAA	2	6	218257	218262	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
573	NC_006576	GCC	2	6	218265	218270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
574	NC_006576	TCC	2	6	218272	218277	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
575	NC_006576	TGA	2	6	218285	218290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
576	NC_006576	TTC	2	6	218353	218358	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
577	NC_006576	CGTG	2	8	218368	218375	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
578	NC_006576	TTGG	2	8	218409	218416	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
579	NC_006576	CACC	2	8	218482	218489	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
580	NC_006576	GCT	2	6	218529	218534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
581	NC_006576	CTG	2	6	221126	221131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
582	NC_006576	AGC	2	6	221144	221149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
583	NC_006576	AGA	2	6	221202	221207	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
584	NC_006576	CTG	2	6	222509	222514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
585	NC_006576	TGC	2	6	222562	222567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
586	NC_006576	TTTA	2	8	222591	222598	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
587	NC_006576	CGC	2	6	222619	222624	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
588	NC_006576	T	6	6	222625	222630	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
589	NC_006576	AGT	2	6	222643	222648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
590	NC_006576	CGCCCC	2	12	222660	222671	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
591	NC_006576	GGT	2	6	222683	222688	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
592	NC_006576	TTA	2	6	222743	222748	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
593	NC_006576	CCT	2	6	222781	222786	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
594	NC_006576	TCC	2	6	222853	222858	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
595	NC_006576	CAG	2	6	223729	223734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
596	NC_006576	AATA	2	8	223811	223818	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
597	NC_006576	CAG	2	6	223821	223826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
598	NC_006576	CAG	2	6	223900	223905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
599	NC_006576	TTG	2	6	223923	223928	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
600	NC_006576	CAG	2	6	223997	224002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
601	NC_006576	GTGA	2	8	234215	234222	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
602	NC_006576	GAT	2	6	234229	234234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
603	NC_006576	TAAC	2	8	234365	234372	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
604	NC_006576	CAA	2	6	234416	234421	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
605	NC_006576	GAA	2	6	234426	234431	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
606	NC_006576	TTC	2	6	234434	234439	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
607	NC_006576	CAA	2	6	234480	234485	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
608	NC_006576	TTC	2	6	234586	234591	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
609	NC_006576	AG	3	6	234599	234604	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
610	NC_006576	GAC	2	6	234618	234623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
611	NC_006576	GGA	2	6	234658	234663	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
612	NC_006576	GCAG	2	8	234676	234683	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
613	NC_006576	GTG	2	6	234708	234713	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
614	NC_006576	CAG	2	6	235398	235403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
615	NC_006576	GGACG	2	10	235426	235435	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
616	NC_006576	TTTATT	2	12	235471	235482	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
617	NC_006576	CGA	2	6	235503	235508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
618	NC_006576	CCA	2	6	235515	235520	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
619	NC_006576	ATCA	2	8	235577	235584	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
620	NC_006576	CGAT	2	8	235613	235620	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
621	NC_006576	GCG	2	6	238420	238425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
622	NC_006576	TTGGC	2	10	238466	238475	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
623	NC_006576	AGT	2	6	238477	238482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
624	NC_006576	CAG	2	6	238520	238525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
625	NC_006576	GCAGC	2	10	238636	238645	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
626	NC_006576	AAC	2	6	239499	239504	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
627	NC_006576	CAG	2	6	239535	239540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
628	NC_006576	CTC	2	6	239545	239550	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
629	NC_006576	AAG	2	6	239551	239556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
630	NC_006576	CTA	2	6	239591	239596	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
631	NC_006576	GCT	2	6	239604	239609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
632	NC_006576	CAG	2	6	239654	239659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
633	NC_006576	TGG	2	6	239692	239697	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
634	NC_006576	GGAC	2	8	239705	239712	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
635	NC_006576	CTA	2	6	240784	240789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
636	NC_006576	TTGC	2	8	240822	240829	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
637	NC_006576	CTG	2	6	243594	243599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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770	NC_006576	TGGCT	2	10	318820	318829	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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