MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Paratyphi A str. ATCC 9150 chromosome

Total Repeats: 16585

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_006511	AAC	2	6	3878032	3878037	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14002	NC_006511	AGC	2	6	3878122	3878127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14003	NC_006511	CAT	2	6	3878128	3878133	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14004	NC_006511	AAAG	2	8	3878136	3878143	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
14005	NC_006511	GTT	2	6	3878231	3878236	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14006	NC_006511	G	7	7	3878473	3878479	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
14007	NC_006511	GT	4	8	3878532	3878539	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14008	NC_006511	GAC	2	6	3878576	3878581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14009	NC_006511	CAA	2	6	3878602	3878607	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14010	NC_006511	GGT	2	6	3878674	3878679	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14011	NC_006511	GA	3	6	3878704	3878709	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14012	NC_006511	AGTC	2	8	3878800	3878807	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14013	NC_006511	GCTG	2	8	3878818	3878825	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
14014	NC_006511	TTA	2	6	3878833	3878838	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14015	NC_006511	CGG	2	6	3878957	3878962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14016	NC_006511	ATG	2	6	3879033	3879038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14017	NC_006511	ACC	2	6	3879228	3879233	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14018	NC_006511	TGG	2	6	3879288	3879293	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14019	NC_006511	TCC	2	6	3879314	3879319	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14020	NC_006511	GGA	2	6	3879331	3879336	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14021	NC_006511	AGG	2	6	3879369	3879374	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14022	NC_006511	GGT	2	6	3879451	3879456	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14023	NC_006511	CGG	2	6	3879538	3879543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14024	NC_006511	TCA	2	6	3879566	3879571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14025	NC_006511	CGT	2	6	3879646	3879651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14026	NC_006511	G	6	6	3879695	3879700	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
14027	NC_006511	GAC	3	9	3879877	3879885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14028	NC_006511	GT	3	6	3879899	3879904	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14029	NC_006511	GA	3	6	3879986	3879991	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14030	NC_006511	GGC	2	6	3880056	3880061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14031	NC_006511	GGT	2	6	3880070	3880075	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14032	NC_006511	CCTG	2	8	3880250	3880257	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
14033	NC_006511	CCGT	2	8	3880285	3880292	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
14034	NC_006511	TC	3	6	3880367	3880372	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14035	NC_006511	AAT	2	6	3880386	3880391	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14036	NC_006511	T	9	9	3880411	3880419	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14037	NC_006511	CTT	2	6	3880463	3880468	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14038	NC_006511	TCA	2	6	3880476	3880481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14039	NC_006511	ATT	2	6	3881337	3881342	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14040	NC_006511	TGTTT	2	10	3881360	3881369	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
14041	NC_006511	TCC	2	6	3881785	3881790	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14042	NC_006511	CT	3	6	3881827	3881832	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14043	NC_006511	TTG	2	6	3882365	3882370	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14044	NC_006511	TAA	2	6	3882423	3882428	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14045	NC_006511	T	7	7	3882509	3882515	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14046	NC_006511	AAC	2	6	3882542	3882547	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14047	NC_006511	CCT	2	6	3882573	3882578	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14048	NC_006511	CCT	2	6	3884039	3884044	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14049	NC_006511	AGA	2	6	3884066	3884071	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14050	NC_006511	T	6	6	3884096	3884101	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14051	NC_006511	GAA	2	6	3884155	3884160	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14052	NC_006511	AAG	2	6	3884177	3884182	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14053	NC_006511	GGA	2	6	3884213	3884218	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14054	NC_006511	A	6	6	3884255	3884260	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14055	NC_006511	A	7	7	3884305	3884311	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14056	NC_006511	T	9	9	3884532	3884540	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14057	NC_006511	GAG	2	6	3884559	3884564	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14058	NC_006511	ACG	2	6	3884607	3884612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14059	NC_006511	GAA	2	6	3886540	3886545	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14060	NC_006511	AAT	2	6	3887502	3887507	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14061	NC_006511	GGC	2	6	3887522	3887527	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14062	NC_006511	GTA	2	6	3887555	3887560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14063	NC_006511	TAAA	2	8	3887624	3887631	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14064	NC_006511	AAAGT	2	10	3891058	3891067	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
14065	NC_006511	TCATT	2	10	3891134	3891143	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
14066	NC_006511	AT	3	6	3892911	3892916	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14067	NC_006511	TGT	2	6	3892938	3892943	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14068	NC_006511	ACA	2	6	3892996	3893001	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14069	NC_006511	CGAC	2	8	3894531	3894538	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
14070	NC_006511	GCC	2	6	3894575	3894580	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14071	NC_006511	GAC	2	6	3895027	3895032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14072	NC_006511	GTCCT	2	10	3895034	3895043	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
14073	NC_006511	GAC	2	6	3895096	3895101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14074	NC_006511	GAC	2	6	3895195	3895200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14075	NC_006511	GC	3	6	3895211	3895216	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14076	NC_006511	GCC	2	6	3895223	3895228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14077	NC_006511	T	6	6	3895280	3895285	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14078	NC_006511	AGC	2	6	3897245	3897250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14079	NC_006511	TCT	2	6	3897255	3897260	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14080	NC_006511	TCCC	2	8	3897284	3897291	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
14081	NC_006511	AAGCG	2	10	3899350	3899359	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
14082	NC_006511	GCC	2	6	3900935	3900940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14083	NC_006511	ACG	3	9	3900991	3900999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14084	NC_006511	GCGCG	2	10	3901016	3901025	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
14085	NC_006511	CGG	2	6	3901275	3901280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14086	NC_006511	CG	3	6	3901293	3901298	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14087	NC_006511	CGC	2	6	3901332	3901337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14088	NC_006511	CAG	2	6	3901390	3901395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14089	NC_006511	GCC	2	6	3901415	3901420	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14090	NC_006511	AAT	2	6	3901465	3901470	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14091	NC_006511	CTT	2	6	3901488	3901493	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14092	NC_006511	CTT	2	6	3901548	3901553	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14093	NC_006511	GTT	2	6	3901603	3901608	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14094	NC_006511	AAC	2	6	3901658	3901663	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14095	NC_006511	CGG	2	6	3901684	3901689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14096	NC_006511	ACG	2	6	3901693	3901698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14097	NC_006511	CAGC	2	8	3901702	3901709	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
14098	NC_006511	TAA	2	6	3901719	3901724	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14099	NC_006511	ACG	2	6	3901760	3901765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14100	NC_006511	TTTG	2	8	3901794	3901801	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
14101	NC_006511	CGT	2	6	3901822	3901827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14102	NC_006511	CGC	2	6	3901845	3901850	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14103	NC_006511	GCT	2	6	3901866	3901871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14104	NC_006511	CGC	2	6	3901884	3901889	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14105	NC_006511	GC	5	10	3901986	3901995	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14106	NC_006511	TCG	2	6	3902014	3902019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14107	NC_006511	AAT	2	6	3902039	3902044	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14108	NC_006511	CCTGC	2	10	3902093	3902102	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
14109	NC_006511	T	8	8	3902169	3902176	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14110	NC_006511	ACC	2	6	3902188	3902193	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14111	NC_006511	TTCTG	2	10	3902221	3902230	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
14112	NC_006511	TTG	2	6	3902315	3902320	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14113	NC_006511	CGA	2	6	3902776	3902781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14114	NC_006511	TGT	2	6	3902814	3902819	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14115	NC_006511	TTA	2	6	3902906	3902911	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14116	NC_006511	T	6	6	3902944	3902949	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14117	NC_006511	TTTTG	2	10	3904441	3904450	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
14118	NC_006511	GTCAT	2	10	3904465	3904474	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
14119	NC_006511	TCT	2	6	3904564	3904569	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14120	NC_006511	AT	3	6	3904606	3904611	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14121	NC_006511	GGA	2	6	3910323	3910328	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14122	NC_006511	AGA	2	6	3911299	3911304	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14123	NC_006511	TGA	2	6	3917438	3917443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14124	NC_006511	AGC	2	6	3917448	3917453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14125	NC_006511	GCT	2	6	3917470	3917475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14126	NC_006511	ACA	2	6	3917481	3917486	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14127	NC_006511	GAT	2	6	3917492	3917497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14128	NC_006511	TTA	2	6	3917498	3917503	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14129	NC_006511	T	7	7	3917517	3917523	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14133	NC_006511	TAT	2	6	3919095	3919100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14251	NC_006511	CCTA	2	8	3964122	3964129	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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14253	NC_006511	TAA	2	6	3964208	3964213	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14255	NC_006511	ATTT	2	8	3964271	3964278	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14256	NC_006511	AGTT	2	8	3964303	3964310	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
14257	NC_006511	ATTT	2	8	3964311	3964318	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14258	NC_006511	TC	3	6	3964360	3964365	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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