MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Paratyphi A str. ATCC 9150 chromosome

Total Repeats: 16585

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_006511	AGA	2	6	3747134	3747139	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13502	NC_006511	AT	3	6	3747338	3747343	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13503	NC_006511	AG	3	6	3747367	3747372	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13504	NC_006511	A	6	6	3747414	3747419	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13505	NC_006511	GCA	2	6	3747420	3747425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13506	NC_006511	TTA	2	6	3747452	3747457	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13507	NC_006511	TAA	2	6	3747478	3747483	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13508	NC_006511	TAAATA	2	12	3747528	3747539	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13509	NC_006511	AT	3	6	3747556	3747561	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13510	NC_006511	AAT	2	6	3747577	3747582	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13511	NC_006511	T	6	6	3747626	3747631	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13512	NC_006511	CAAT	2	8	3747632	3747639	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13513	NC_006511	CT	3	6	3747644	3747649	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13514	NC_006511	ATA	2	6	3747676	3747681	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13515	NC_006511	TTG	2	6	3747688	3747693	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13516	NC_006511	AGAA	2	8	3747753	3747760	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
13517	NC_006511	TCA	2	6	3747798	3747803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13518	NC_006511	CAA	3	9	3747870	3747878	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13519	NC_006511	GAAT	2	8	3747880	3747887	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13520	NC_006511	TATC	2	8	3748616	3748623	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13521	NC_006511	ACA	2	6	3748674	3748679	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13522	NC_006511	CGC	2	6	3748764	3748769	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13523	NC_006511	GCG	2	6	3748772	3748777	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13524	NC_006511	TAC	2	6	3748813	3748818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13525	NC_006511	GC	3	6	3748837	3748842	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13526	NC_006511	TGG	2	6	3748877	3748882	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13527	NC_006511	AAC	2	6	3749426	3749431	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13528	NC_006511	GAT	2	6	3749503	3749508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13529	NC_006511	A	6	6	3749529	3749534	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13530	NC_006511	T	6	6	3749550	3749555	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13531	NC_006511	ACA	2	6	3749601	3749606	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13532	NC_006511	GAT	2	6	3749638	3749643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13533	NC_006511	A	6	6	3752517	3752522	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13534	NC_006511	TTTTA	2	10	3752553	3752562	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
13535	NC_006511	CAT	2	6	3752579	3752584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13536	NC_006511	CCT	2	6	3752587	3752592	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13537	NC_006511	A	6	6	3752623	3752628	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13538	NC_006511	GAA	2	6	3753336	3753341	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13539	NC_006511	CGT	2	6	3753394	3753399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13540	NC_006511	CGG	2	6	3753405	3753410	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13541	NC_006511	ACATGA	2	12	3753431	3753442	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
13542	NC_006511	ATT	2	6	3753475	3753480	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13543	NC_006511	TGC	2	6	3753508	3753513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13544	NC_006511	AGC	2	6	3753528	3753533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13545	NC_006511	GCGT	2	8	3753543	3753550	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
13546	NC_006511	GAT	2	6	3753561	3753566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13547	NC_006511	TTA	2	6	3753615	3753620	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13548	NC_006511	AGTC	2	8	3753622	3753629	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13549	NC_006511	GTTT	2	8	3753678	3753685	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
13550	NC_006511	A	7	7	3753701	3753707	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13551	NC_006511	ATG	2	6	3753788	3753793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13552	NC_006511	A	7	7	3753803	3753809	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13553	NC_006511	ACA	2	6	3753814	3753819	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13554	NC_006511	ACAG	2	8	3755771	3755778	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
13555	NC_006511	GAG	2	6	3755802	3755807	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13556	NC_006511	TTG	2	6	3759443	3759448	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13557	NC_006511	ACTT	2	8	3759471	3759478	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13558	NC_006511	GCC	2	6	3759507	3759512	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13559	NC_006511	CCT	2	6	3760477	3760482	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13560	NC_006511	AT	3	6	3760508	3760513	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13561	NC_006511	CGC	2	6	3760578	3760583	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13562	NC_006511	CAT	2	6	3760598	3760603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13563	NC_006511	AGA	2	6	3760605	3760610	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13564	NC_006511	GAA	3	9	3760644	3760652	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13565	NC_006511	AGT	2	6	3763514	3763519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13566	NC_006511	TAT	2	6	3765463	3765468	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13567	NC_006511	CGT	2	6	3765486	3765491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13569	NC_006511	TTG	2	6	3766798	3766803	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13570	NC_006511	TCT	2	6	3766842	3766847	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13571	NC_006511	GGT	2	6	3766945	3766950	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13572	NC_006511	GGC	2	6	3767040	3767045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13573	NC_006511	A	6	6	3767055	3767060	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13574	NC_006511	TCAA	2	8	3767065	3767072	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13575	NC_006511	TAA	2	6	3767240	3767245	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13576	NC_006511	GTAA	2	8	3768851	3768858	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13577	NC_006511	T	6	6	3771780	3771785	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13578	NC_006511	GC	3	6	3773318	3773323	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13579	NC_006511	AT	3	6	3773449	3773454	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13580	NC_006511	ATG	2	6	3773464	3773469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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13584	NC_006511	CATC	2	8	3774125	3774132	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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13588	NC_006511	A	6	6	3774264	3774269	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13589	NC_006511	CA	3	6	3774305	3774310	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13590	NC_006511	T	7	7	3774335	3774341	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13591	NC_006511	CGG	2	6	3774346	3774351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13592	NC_006511	CGG	2	6	3774407	3774412	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13593	NC_006511	GCG	2	6	3774421	3774426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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13595	NC_006511	T	6	6	3774558	3774563	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13599	NC_006511	GC	3	6	3774722	3774727	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13600	NC_006511	GAC	2	6	3774728	3774733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13601	NC_006511	AG	3	6	3774747	3774752	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13602	NC_006511	GC	3	6	3774779	3774784	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13603	NC_006511	CAC	2	6	3774882	3774887	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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13606	NC_006511	TCATT	2	10	3774968	3774977	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
13607	NC_006511	TTC	2	6	3774978	3774983	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13608	NC_006511	TTC	2	6	3775023	3775028	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13609	NC_006511	CAA	2	6	3775088	3775093	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13610	NC_006511	CCGCGC	2	12	3775178	3775189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13611	NC_006511	ACG	2	6	3775239	3775244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13612	NC_006511	CCG	2	6	3775282	3775287	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13613	NC_006511	GAA	2	6	3775296	3775301	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13614	NC_006511	ATC	2	6	3775324	3775329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13615	NC_006511	GTA	2	6	3775440	3775445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13616	NC_006511	ATC	2	6	3775495	3775500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13617	NC_006511	GTAG	2	8	3775524	3775531	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
13618	NC_006511	ACC	2	6	3775600	3775605	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13619	NC_006511	CGC	2	6	3775642	3775647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13620	NC_006511	AAG	2	6	3775690	3775695	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13621	NC_006511	GGCA	2	8	3775739	3775746	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13622	NC_006511	AGGTG	2	10	3775834	3775843	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
13623	NC_006511	CG	3	6	3775863	3775868	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13624	NC_006511	CGC	2	6	3775915	3775920	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13625	NC_006511	A	7	7	3775936	3775942	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13626	NC_006511	CGCC	2	8	3776037	3776044	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
13627	NC_006511	CCG	3	9	3776064	3776072	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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13758	NC_006511	CAG	2	6	3800947	3800952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13759	NC_006511	CTG	2	6	3800974	3800979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13760	NC_006511	GGCGCA	2	12	3801025	3801036	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
13761	NC_006511	CCG	2	6	3801038	3801043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13762	NC_006511	CGA	2	6	3801055	3801060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13763	NC_006511	CCCG	2	8	3801068	3801075	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
13764	NC_006511	GGC	2	6	3801083	3801088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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13770	NC_006511	GGC	2	6	3801187	3801192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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13772	NC_006511	GCG	2	6	3801224	3801229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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13774	NC_006511	TGT	2	6	3801268	3801273	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13775	NC_006511	GCAGC	2	10	3801287	3801296	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
13776	NC_006511	CTG	2	6	3801317	3801322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13777	NC_006511	GGT	2	6	3801356	3801361	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13778	NC_006511	CAGCAT	2	12	3801392	3801403	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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13782	NC_006511	ATTA	2	8	3808090	3808097	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13783	NC_006511	ATTTT	2	10	3808099	3808108	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13785	NC_006511	CAT	2	6	3808145	3808150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13786	NC_006511	ATTG	2	8	3808155	3808162	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13787	NC_006511	AAT	2	6	3808168	3808173	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13788	NC_006511	ATTT	2	8	3808221	3808228	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13789	NC_006511	AT	3	6	3812690	3812695	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13790	NC_006511	CG	3	6	3812720	3812725	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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13798	NC_006511	CGCC	2	8	3820708	3820715	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
13799	NC_006511	AT	3	6	3820745	3820750	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13800	NC_006511	CAT	2	6	3820758	3820763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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13882	NC_006511	CA	3	6	3864455	3864460	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13883	NC_006511	TCAT	2	8	3864477	3864484	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13884	NC_006511	GGC	2	6	3864499	3864504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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