MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Paratyphi A str. ATCC 9150 chromosome

Total Repeats: 16585

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_006511	CAC	2	6	3615642	3615647	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13002	NC_006511	AC	3	6	3615659	3615664	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13003	NC_006511	AGA	2	6	3615691	3615696	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13004	NC_006511	AAG	2	6	3615703	3615708	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13005	NC_006511	CGG	2	6	3615793	3615798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13006	NC_006511	GCAA	2	8	3615838	3615845	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
13007	NC_006511	CTG	2	6	3615858	3615863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13008	NC_006511	CAAA	2	8	3615889	3615896	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
13009	NC_006511	TA	3	6	3616046	3616051	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13010	NC_006511	AT	3	6	3616061	3616066	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13011	NC_006511	TAA	2	6	3616090	3616095	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13012	NC_006511	ATT	2	6	3616858	3616863	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13013	NC_006511	TGAA	2	8	3616869	3616876	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13014	NC_006511	ATT	2	6	3620294	3620299	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13015	NC_006511	ATT	2	6	3620303	3620308	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13016	NC_006511	TTAC	2	8	3620326	3620333	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13017	NC_006511	TTC	2	6	3620359	3620364	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13018	NC_006511	TAAAAA	2	12	3620404	3620415	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13019	NC_006511	TACCG	2	10	3621086	3621095	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
13020	NC_006511	ATT	2	6	3621125	3621130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13021	NC_006511	ATT	2	6	3621157	3621162	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13022	NC_006511	ATTC	2	8	3621167	3621174	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13023	NC_006511	ATT	2	6	3621223	3621228	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13024	NC_006511	TAA	3	9	3621240	3621248	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13025	NC_006511	TTATT	2	10	3623186	3623195	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
13026	NC_006511	A	6	6	3623222	3623227	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13027	NC_006511	T	7	7	3623263	3623269	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13028	NC_006511	ATT	2	6	3623280	3623285	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13029	NC_006511	AT	3	6	3623299	3623304	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13030	NC_006511	GGC	2	6	3623379	3623384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13031	NC_006511	C	6	6	3623391	3623396	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
13032	NC_006511	TG	3	6	3623452	3623457	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13033	NC_006511	GCT	2	6	3623501	3623506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13034	NC_006511	AGC	2	6	3623508	3623513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13035	NC_006511	CAG	2	6	3623698	3623703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13036	NC_006511	TAAG	2	8	3623743	3623750	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13037	NC_006511	CCCG	2	8	3623812	3623819	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
13038	NC_006511	TAAAA	2	10	3623843	3623852	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
13039	NC_006511	A	6	6	3623989	3623994	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13040	NC_006511	T	6	6	3624032	3624037	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13041	NC_006511	CCTG	2	8	3624292	3624299	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
13042	NC_006511	T	8	8	3624310	3624317	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13043	NC_006511	C	10	10	3624335	3624344	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
13044	NC_006511	TAG	2	6	3624406	3624411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13045	NC_006511	CAA	2	6	3625027	3625032	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13046	NC_006511	T	6	6	3625171	3625176	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13047	NC_006511	TCA	2	6	3625258	3625263	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13048	NC_006511	TTTG	2	8	3625268	3625275	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
13049	NC_006511	TTC	2	6	3625281	3625286	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13050	NC_006511	ACC	2	6	3626138	3626143	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13051	NC_006511	GTC	2	6	3626169	3626174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13052	NC_006511	T	6	6	3626183	3626188	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13053	NC_006511	CAA	2	6	3626251	3626256	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13054	NC_006511	TGC	2	6	3626270	3626275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13055	NC_006511	GTA	2	6	3626984	3626989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13056	NC_006511	TCA	2	6	3627021	3627026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13057	NC_006511	A	6	6	3627075	3627080	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13058	NC_006511	GAT	2	6	3627131	3627136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13059	NC_006511	TGA	2	6	3627168	3627173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13060	NC_006511	TGAA	2	8	3627194	3627201	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13061	NC_006511	ATC	2	6	3627258	3627263	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13062	NC_006511	AAT	2	6	3627320	3627325	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13063	NC_006511	TA	3	6	3627347	3627352	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13064	NC_006511	CGCT	2	8	3627387	3627394	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
13065	NC_006511	ACTC	2	8	3627429	3627436	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
13066	NC_006511	GCC	2	6	3627441	3627446	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13067	NC_006511	ATT	2	6	3627461	3627466	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13068	NC_006511	TCTG	2	8	3627493	3627500	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
13069	NC_006511	CAAT	2	8	3627604	3627611	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13070	NC_006511	ATT	2	6	3627640	3627645	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13071	NC_006511	A	7	7	3627675	3627681	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13072	NC_006511	TATT	2	8	3627702	3627709	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13073	NC_006511	GCC	2	6	3629792	3629797	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13074	NC_006511	ATT	2	6	3630712	3630717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13075	NC_006511	AGGA	2	8	3630743	3630750	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13076	NC_006511	GTTT	2	8	3630793	3630800	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
13077	NC_006511	TTA	2	6	3631155	3631160	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13078	NC_006511	TTA	3	9	3631183	3631191	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13079	NC_006511	ATG	2	6	3632320	3632325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13080	NC_006511	TGAG	2	8	3632707	3632714	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
13081	NC_006511	GAA	2	6	3632726	3632731	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13082	NC_006511	AAT	2	6	3632760	3632765	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13083	NC_006511	AC	3	6	3632780	3632785	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13084	NC_006511	TACT	2	8	3632787	3632794	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13085	NC_006511	TAGA	2	8	3634409	3634416	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13086	NC_006511	A	7	7	3635825	3635831	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13087	NC_006511	AGA	2	6	3635845	3635850	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13088	NC_006511	A	6	6	3635850	3635855	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13089	NC_006511	GCGATC	2	12	3635856	3635867	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13090	NC_006511	A	6	6	3635886	3635891	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13091	NC_006511	AT	3	6	3635897	3635902	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13092	NC_006511	CCG	2	6	3635926	3635931	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13093	NC_006511	TGA	2	6	3635939	3635944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13094	NC_006511	AAT	2	6	3635970	3635975	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13095	NC_006511	TCA	2	6	3635979	3635984	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13096	NC_006511	AT	3	6	3636048	3636053	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13097	NC_006511	TAGCG	2	10	3637270	3637279	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
13098	NC_006511	CA	3	6	3637288	3637293	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13099	NC_006511	ACAG	2	8	3638267	3638274	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
13100	NC_006511	AAT	2	6	3638276	3638281	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13101	NC_006511	GCG	2	6	3638293	3638298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13102	NC_006511	T	7	7	3638318	3638324	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13103	NC_006511	TCG	2	6	3638330	3638335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13104	NC_006511	CCT	3	9	3638348	3638356	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13105	NC_006511	CT	3	6	3638363	3638368	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13106	NC_006511	GAG	2	6	3638375	3638380	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13107	NC_006511	TGA	2	6	3638407	3638412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13108	NC_006511	A	6	6	3640511	3640516	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13109	NC_006511	GACA	2	8	3640611	3640618	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
13110	NC_006511	CAT	2	6	3641902	3641907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13111	NC_006511	CGC	2	6	3642446	3642451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13112	NC_006511	CT	3	6	3643323	3643328	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13113	NC_006511	GT	3	6	3643360	3643365	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13114	NC_006511	A	6	6	3643387	3643392	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13115	NC_006511	GAT	2	6	3643401	3643406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13116	NC_006511	TA	3	6	3643458	3643463	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13117	NC_006511	TAT	2	6	3643481	3643486	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13118	NC_006511	A	7	7	3643500	3643506	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13119	NC_006511	ATA	2	6	3645050	3645055	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13120	NC_006511	TAT	2	6	3645063	3645068	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13121	NC_006511	AGA	2	6	3645101	3645106	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13122	NC_006511	GAAGAG	2	12	3645109	3645120	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13123	NC_006511	GGC	2	6	3645131	3645136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13124	NC_006511	CT	3	6	3645139	3645144	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13125	NC_006511	AGC	2	6	3645170	3645175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13126	NC_006511	CGA	2	6	3645204	3645209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13127	NC_006511	CGG	2	6	3645291	3645296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13128	NC_006511	TAC	2	6	3645346	3645351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13129	NC_006511	AGA	2	6	3645365	3645370	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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13131	NC_006511	GCC	2	6	3645424	3645429	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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