MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Paratyphi A str. ATCC 9150 chromosome

Total Repeats: 16585

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_006511	CCG	2	6	3462133	3462138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12502	NC_006511	AACC	2	8	3462218	3462225	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12503	NC_006511	A	6	6	3462228	3462233	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12504	NC_006511	AT	4	8	3462251	3462258	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12505	NC_006511	GGC	2	6	3463911	3463916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12506	NC_006511	AAG	2	6	3463940	3463945	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12507	NC_006511	AGGG	2	8	3463948	3463955	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
12508	NC_006511	CAA	2	6	3466062	3466067	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12509	NC_006511	GT	3	6	3466074	3466079	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12510	NC_006511	A	6	6	3466086	3466091	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12511	NC_006511	CAG	2	6	3466158	3466163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12512	NC_006511	ATT	2	6	3466192	3466197	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12513	NC_006511	AAG	2	6	3466742	3466747	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12514	NC_006511	TGGC	2	8	3466767	3466774	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
12515	NC_006511	GCCA	2	8	3466781	3466788	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
12516	NC_006511	CTT	2	6	3469192	3469197	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12517	NC_006511	CTTT	2	8	3469230	3469237	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
12518	NC_006511	T	6	6	3469235	3469240	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12519	NC_006511	TTAA	2	8	3469274	3469281	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12520	NC_006511	ATTA	2	8	3469303	3469310	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12521	NC_006511	TTA	2	6	3469316	3469321	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12522	NC_006511	TTAA	2	8	3469334	3469341	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12523	NC_006511	AAAT	2	8	3469391	3469398	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12524	NC_006511	TGT	2	6	3469494	3469499	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12525	NC_006511	ATT	2	6	3469502	3469507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12526	NC_006511	GCC	2	6	3469544	3469549	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12527	NC_006511	C	6	6	3469548	3469553	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
12528	NC_006511	CCG	2	6	3472538	3472543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12529	NC_006511	GAT	2	6	3475112	3475117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12530	NC_006511	TAT	2	6	3475123	3475128	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12531	NC_006511	CGC	2	6	3475821	3475826	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12532	NC_006511	TTC	3	9	3475862	3475870	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12533	NC_006511	TGCC	2	8	3475911	3475918	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
12534	NC_006511	AAC	2	6	3476052	3476057	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12535	NC_006511	GTC	2	6	3476066	3476071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12536	NC_006511	GCA	2	6	3477459	3477464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12537	NC_006511	GCGCT	2	10	3477488	3477497	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
12538	NC_006511	CAT	2	6	3477520	3477525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12539	NC_006511	TAA	2	6	3482051	3482056	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12540	NC_006511	AAC	2	6	3482057	3482062	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12541	NC_006511	TCC	3	9	3482097	3482105	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12542	NC_006511	AGGG	2	8	3482117	3482124	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
12543	NC_006511	AGG	2	6	3482125	3482130	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12544	NC_006511	CGC	2	6	3482157	3482162	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12545	NC_006511	GCG	2	6	3482313	3482318	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12546	NC_006511	TAAT	2	8	3482339	3482346	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12547	NC_006511	CAT	2	6	3482380	3482385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12548	NC_006511	ATT	2	6	3482395	3482400	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12549	NC_006511	T	6	6	3482462	3482467	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12550	NC_006511	ATTA	2	8	3482565	3482572	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12551	NC_006511	A	7	7	3482581	3482587	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12552	NC_006511	C	6	6	3482596	3482601	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
12553	NC_006511	AGTGA	2	10	3482611	3482620	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
12554	NC_006511	CG	3	6	3485370	3485375	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12555	NC_006511	AAT	2	6	3486165	3486170	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12556	NC_006511	AACC	2	8	3486181	3486188	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12557	NC_006511	AGA	2	6	3487113	3487118	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12558	NC_006511	TA	4	8	3487122	3487129	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12559	NC_006511	TCG	2	6	3487136	3487141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12560	NC_006511	ATT	2	6	3487502	3487507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12561	NC_006511	T	6	6	3487598	3487603	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12562	NC_006511	TAT	2	6	3487632	3487637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12563	NC_006511	GGC	2	6	3489210	3489215	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12564	NC_006511	CTT	2	6	3498719	3498724	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12565	NC_006511	GCA	2	6	3498738	3498743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12566	NC_006511	CGT	2	6	3498762	3498767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12567	NC_006511	A	8	8	3498883	3498890	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12568	NC_006511	GGC	2	6	3498966	3498971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12569	NC_006511	T	7	7	3500145	3500151	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12570	NC_006511	GC	3	6	3500176	3500181	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12571	NC_006511	AGC	2	6	3500216	3500221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12572	NC_006511	CGT	2	6	3500435	3500440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12573	NC_006511	AATA	2	8	3500464	3500471	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12574	NC_006511	TCC	2	6	3500479	3500484	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12575	NC_006511	CT	3	6	3500521	3500526	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12576	NC_006511	TTG	2	6	3501059	3501064	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12577	NC_006511	TAA	2	6	3501117	3501122	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12578	NC_006511	A	6	6	3501182	3501187	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12579	NC_006511	CAA	2	6	3501269	3501274	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12580	NC_006511	ACG	2	6	3503226	3503231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12581	NC_006511	TCCG	2	8	3505153	3505160	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
12582	NC_006511	AG	3	6	3505168	3505173	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12583	NC_006511	CTC	2	6	3505184	3505189	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12584	NC_006511	A	6	6	3505195	3505200	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12585	NC_006511	TCG	2	6	3505248	3505253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12586	NC_006511	CAT	2	6	3505359	3505364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12587	NC_006511	CTT	2	6	3505401	3505406	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12588	NC_006511	GCG	2	6	3505460	3505465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12589	NC_006511	TTG	2	6	3505510	3505515	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12590	NC_006511	TTA	2	6	3505661	3505666	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12591	NC_006511	GGC	2	6	3505701	3505706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12592	NC_006511	AAT	2	6	3505717	3505722	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12593	NC_006511	GGTTT	2	10	3505778	3505787	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
12594	NC_006511	GTA	2	6	3505801	3505806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12595	NC_006511	T	6	6	3505861	3505866	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12596	NC_006511	AAC	2	6	3505943	3505948	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12597	NC_006511	GC	3	6	3506013	3506018	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12598	NC_006511	GTGAA	2	10	3506108	3506117	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
12599	NC_006511	GAC	2	6	3506157	3506162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12600	NC_006511	GTG	2	6	3506225	3506230	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12601	NC_006511	GAT	2	6	3506286	3506291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12602	NC_006511	GAG	2	6	3506316	3506321	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12603	NC_006511	GC	3	6	3506428	3506433	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12604	NC_006511	GAG	2	6	3506461	3506466	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12605	NC_006511	A	9	9	3506521	3506529	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12606	NC_006511	ATA	2	6	3506550	3506555	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12607	NC_006511	TCATTC	2	12	3506629	3506640	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12608	NC_006511	CTT	2	6	3506652	3506657	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12609	NC_006511	A	7	7	3506663	3506669	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12610	NC_006511	TTTC	2	8	3506685	3506692	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
12611	NC_006511	ACC	2	6	3507316	3507321	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12612	NC_006511	TTA	2	6	3507334	3507339	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12613	NC_006511	T	6	6	3507361	3507366	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12614	NC_006511	CAATAT	2	12	3507379	3507390	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12615	NC_006511	T	9	9	3507401	3507409	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12616	NC_006511	CAA	2	6	3507441	3507446	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12617	NC_006511	CTC	2	6	3507451	3507456	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12618	NC_006511	GTT	2	6	3513325	3513330	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12619	NC_006511	A	6	6	3513383	3513388	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12620	NC_006511	TCA	3	9	3513389	3513397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12621	NC_006511	GAG	2	6	3513437	3513442	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12622	NC_006511	AGCGC	2	10	3517478	3517487	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
12623	NC_006511	TC	3	6	3518829	3518834	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12624	NC_006511	ACATG	2	10	3518884	3518893	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
12625	NC_006511	T	6	6	3518915	3518920	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12626	NC_006511	A	8	8	3518926	3518933	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12627	NC_006511	AG	3	6	3518948	3518953	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12628	NC_006511	GAAAA	2	10	3518977	3518986	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
12629	NC_006511	TGGC	2	8	3519039	3519046	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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