MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Paratyphi A str. ATCC 9150 chromosome

Total Repeats: 16585

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_006511	GCG	2	6	2739397	2739402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10002	NC_006511	AAT	2	6	2741601	2741606	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10003	NC_006511	TA	3	6	2741658	2741663	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10004	NC_006511	ATT	2	6	2741667	2741672	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10005	NC_006511	ATA	2	6	2741687	2741692	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10006	NC_006511	TAA	2	6	2741742	2741747	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10007	NC_006511	A	6	6	2741746	2741751	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10008	NC_006511	CT	3	6	2741776	2741781	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10009	NC_006511	ATA	2	6	2741896	2741901	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10010	NC_006511	TGG	2	6	2742005	2742010	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10011	NC_006511	AT	3	6	2742036	2742041	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10012	NC_006511	TAA	2	6	2742084	2742089	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10013	NC_006511	CAGA	2	8	2742105	2742112	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10014	NC_006511	TAA	3	9	2742526	2742534	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10015	NC_006511	AAT	2	6	2742546	2742551	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10016	NC_006511	CTA	2	6	2742562	2742567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10017	NC_006511	AG	4	8	2743691	2743698	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10018	NC_006511	ATA	2	6	2743777	2743782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10019	NC_006511	ACG	2	6	2743790	2743795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10020	NC_006511	AGC	2	6	2743819	2743824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10021	NC_006511	AAAT	2	8	2743826	2743833	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10022	NC_006511	AT	3	6	2743832	2743837	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10023	NC_006511	TGC	2	6	2743870	2743875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10024	NC_006511	ACTT	2	8	2743899	2743906	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10025	NC_006511	TCGC	2	8	2743926	2743933	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10026	NC_006511	ATT	2	6	2743956	2743961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10027	NC_006511	TA	3	6	2743967	2743972	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10028	NC_006511	ATT	2	6	2743975	2743980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10029	NC_006511	ATA	2	6	2743985	2743990	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10030	NC_006511	TTA	2	6	2744074	2744079	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10031	NC_006511	AAC	2	6	2744100	2744105	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10032	NC_006511	CTT	2	6	2744121	2744126	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10033	NC_006511	AGT	2	6	2744181	2744186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10034	NC_006511	ATCTTA	2	12	2745276	2745287	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10035	NC_006511	A	7	7	2745371	2745377	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10036	NC_006511	AAAG	2	8	2746318	2746325	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
10037	NC_006511	T	6	6	2746342	2746347	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10038	NC_006511	TGA	2	6	2746371	2746376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10039	NC_006511	A	6	6	2746383	2746388	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10040	NC_006511	A	8	8	2746408	2746415	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10041	NC_006511	ACC	2	6	2746423	2746428	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10042	NC_006511	TG	4	8	2746551	2746558	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10043	NC_006511	GAT	3	9	2746582	2746590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10044	NC_006511	TCT	2	6	2746609	2746614	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10045	NC_006511	AAC	2	6	2746711	2746716	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10046	NC_006511	ACA	2	6	2746780	2746785	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10047	NC_006511	ATTAT	2	10	2746826	2746835	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
10048	NC_006511	TTA	3	9	2746874	2746882	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10049	NC_006511	GAA	2	6	2746960	2746965	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10050	NC_006511	ATG	2	6	2746996	2747001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10051	NC_006511	TTA	2	6	2750456	2750461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10052	NC_006511	AGG	2	6	2750484	2750489	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10053	NC_006511	GCCA	2	8	2750515	2750522	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10054	NC_006511	GGC	2	6	2750528	2750533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10055	NC_006511	CTG	2	6	2753370	2753375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10056	NC_006511	C	6	6	2753465	2753470	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
10057	NC_006511	TGT	2	6	2753530	2753535	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10058	NC_006511	AAT	2	6	2753546	2753551	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10059	NC_006511	AGC	2	6	2758717	2758722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10060	NC_006511	CAATAA	2	12	2758813	2758824	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10061	NC_006511	GGGC	2	8	2758869	2758876	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
10062	NC_006511	GCG	2	6	2761496	2761501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10063	NC_006511	GCC	2	6	2761509	2761514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10064	NC_006511	CG	3	6	2761770	2761775	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10065	NC_006511	CCT	2	6	2761788	2761793	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10066	NC_006511	CG	3	6	2762718	2762723	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10067	NC_006511	GT	3	6	2762731	2762736	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10068	NC_006511	TGGG	2	8	2762817	2762824	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
10069	NC_006511	ATT	2	6	2763512	2763517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10070	NC_006511	ATTA	2	8	2763569	2763576	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10071	NC_006511	TG	3	6	2763616	2763621	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10072	NC_006511	ATC	3	9	2763774	2763782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10073	NC_006511	ACA	2	6	2763874	2763879	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10074	NC_006511	TAAT	2	8	2763940	2763947	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10075	NC_006511	AAC	3	9	2763952	2763960	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10076	NC_006511	A	6	6	2763979	2763984	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10077	NC_006511	CA	3	6	2763985	2763990	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10078	NC_006511	TAAA	2	8	2764022	2764029	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10079	NC_006511	TTA	2	6	2764050	2764055	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10080	NC_006511	TA	3	6	2764054	2764059	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10081	NC_006511	ACCA	2	8	2764104	2764111	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10082	NC_006511	CTTAC	2	10	2765016	2765025	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
10083	NC_006511	CAG	2	6	2765091	2765096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10084	NC_006511	GGA	2	6	2765138	2765143	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10085	NC_006511	ACCGA	2	10	2765159	2765168	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
10086	NC_006511	ACG	2	6	2765170	2765175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10087	NC_006511	GAT	2	6	2765178	2765183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10088	NC_006511	ATG	2	6	2765203	2765208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10089	NC_006511	GCC	2	6	2765355	2765360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10090	NC_006511	CCG	2	6	2765422	2765427	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10091	NC_006511	GCT	2	6	2765453	2765458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10092	NC_006511	ACG	2	6	2765474	2765479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10093	NC_006511	CAT	2	6	2765516	2765521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10094	NC_006511	CT	3	6	2766921	2766926	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10095	NC_006511	TCA	2	6	2766958	2766963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10096	NC_006511	GAG	2	6	2766968	2766973	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10097	NC_006511	AC	3	6	2767622	2767627	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10098	NC_006511	GAC	2	6	2770509	2770514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10099	NC_006511	GCC	2	6	2770611	2770616	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10100	NC_006511	CAG	2	6	2770620	2770625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10101	NC_006511	GCT	2	6	2770655	2770660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10102	NC_006511	GC	3	6	2770684	2770689	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10103	NC_006511	CGT	2	6	2770690	2770695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10104	NC_006511	CGC	2	6	2770714	2770719	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10105	NC_006511	GCC	2	6	2770821	2770826	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10106	NC_006511	GAA	2	6	2770839	2770844	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10107	NC_006511	CGC	2	6	2770849	2770854	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10108	NC_006511	ATT	2	6	2770872	2770877	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10109	NC_006511	TTA	2	6	2771051	2771056	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10110	NC_006511	TTG	2	6	2771136	2771141	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10111	NC_006511	ACG	2	6	2771206	2771211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10112	NC_006511	CTT	2	6	2771219	2771224	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10113	NC_006511	CCG	2	6	2771277	2771282	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10114	NC_006511	CGAAGA	2	12	2771399	2771410	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
10115	NC_006511	ACA	2	6	2771502	2771507	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10116	NC_006511	ATT	2	6	2771532	2771537	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10117	NC_006511	TCC	2	6	2771547	2771552	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10118	NC_006511	A	6	6	2771582	2771587	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10119	NC_006511	TCC	2	6	2771595	2771600	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10120	NC_006511	AAC	2	6	2774100	2774105	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10121	NC_006511	T	6	6	2775108	2775113	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10122	NC_006511	TC	3	6	2775160	2775165	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10123	NC_006511	TCA	2	6	2775181	2775186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10124	NC_006511	TCA	2	6	2775206	2775211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10125	NC_006511	AAT	2	6	2775239	2775244	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10126	NC_006511	GAA	2	6	2776558	2776563	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10127	NC_006511	TC	3	6	2776729	2776734	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10128	NC_006511	T	6	6	2776739	2776744	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10129	NC_006511	GGC	2	6	2776790	2776795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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10131	NC_006511	TAA	2	6	2777506	2777511	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10254	NC_006511	ATTT	2	8	2821639	2821646	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10258	NC_006511	GAT	2	6	2821759	2821764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10259	NC_006511	TTG	2	6	2821777	2821782	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10260	NC_006511	ATT	2	6	2825411	2825416	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10261	NC_006511	A	6	6	2825443	2825448	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10262	NC_006511	A	6	6	2825492	2825497	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10263	NC_006511	T	6	6	2826268	2826273	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10285	NC_006511	TGTC	2	8	2832082	2832089	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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10293	NC_006511	CAA	2	6	2832367	2832372	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10366	NC_006511	AT	4	8	2861653	2861660	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10367	NC_006511	TAA	2	6	2861692	2861697	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10372	NC_006511	GAAAA	2	10	2861948	2861957	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
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10378	NC_006511	TTGATA	2	12	2862242	2862253	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10379	NC_006511	ATCC	2	8	2862301	2862308	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
10380	NC_006511	TTG	2	6	2862347	2862352	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10381	NC_006511	ACA	3	9	2862358	2862366	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10382	NC_006511	TTCT	2	8	2862396	2862403	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
10383	NC_006511	T	7	7	2862420	2862426	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10384	NC_006511	AGT	2	6	2862434	2862439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10385	NC_006511	TA	3	6	2862453	2862458	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10386	NC_006511	CCCT	2	8	2862466	2862473	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
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