MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Paratyphi A str. ATCC 9150 chromosome

Total Repeats: 16585

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_006511	CTA	2	6	167140	167145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
502	NC_006511	A	7	7	167177	167183	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
503	NC_006511	CTGG	2	8	168331	168338	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
504	NC_006511	ACG	2	6	171538	171543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
505	NC_006511	AGC	2	6	172549	172554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
506	NC_006511	CAC	2	6	172561	172566	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
507	NC_006511	TGT	2	6	173999	174004	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
508	NC_006511	GAT	2	6	176465	176470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
509	NC_006511	ATT	2	6	176478	176483	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
510	NC_006511	CGC	2	6	176517	176522	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
511	NC_006511	AGT	2	6	178039	178044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
512	NC_006511	GT	3	6	178047	178052	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
513	NC_006511	ATTT	2	8	178080	178087	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
514	NC_006511	AAT	2	6	178136	178141	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
515	NC_006511	TGA	2	6	178179	178184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
516	NC_006511	AAAG	2	8	178197	178204	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
517	NC_006511	CCT	2	6	178217	178222	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
518	NC_006511	ATT	2	6	178260	178265	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
519	NC_006511	CTG	2	6	178288	178293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
520	NC_006511	T	6	6	178314	178319	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_006511	CCT	2	6	178421	178426	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
522	NC_006511	TCAA	2	8	178436	178443	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
523	NC_006511	T	6	6	179311	179316	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
524	NC_006511	AGA	2	6	179334	179339	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
525	NC_006511	TGT	2	6	179340	179345	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
526	NC_006511	TTA	2	6	179392	179397	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
527	NC_006511	TAGA	2	8	179448	179455	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
528	NC_006511	CGGC	2	8	184056	184063	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
529	NC_006511	T	8	8	184064	184071	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_006511	TTA	2	6	184096	184101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
531	NC_006511	TGT	2	6	184128	184133	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
532	NC_006511	GAT	2	6	184186	184191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
533	NC_006511	CCG	2	6	184212	184217	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
534	NC_006511	TCT	2	6	185664	185669	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
535	NC_006511	T	7	7	185718	185724	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_006511	ATG	2	6	185750	185755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
537	NC_006511	GCA	2	6	185792	185797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
538	NC_006511	TGTC	2	8	185835	185842	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
539	NC_006511	ATA	2	6	185921	185926	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
540	NC_006511	ATT	2	6	185935	185940	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
541	NC_006511	TC	3	6	188711	188716	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
542	NC_006511	TGCC	2	8	188746	188753	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
543	NC_006511	T	6	6	188923	188928	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
544	NC_006511	T	6	6	188936	188941	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
545	NC_006511	CTA	2	6	189006	189011	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
546	NC_006511	ACT	2	6	189012	189017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
547	NC_006511	CAA	2	6	189049	189054	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
548	NC_006511	GAG	2	6	189081	189086	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
549	NC_006511	GGC	2	6	191743	191748	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
550	NC_006511	CTG	2	6	191809	191814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
551	NC_006511	T	7	7	191822	191828	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
552	NC_006511	GCT	2	6	191836	191841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
553	NC_006511	CT	3	6	192245	192250	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
554	NC_006511	CAC	2	6	192310	192315	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
555	NC_006511	T	6	6	192341	192346	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_006511	T	6	6	192359	192364	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
557	NC_006511	TTA	2	6	192370	192375	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
558	NC_006511	TTGA	2	8	192417	192424	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
559	NC_006511	CAA	2	6	192453	192458	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
560	NC_006511	TGA	2	6	196471	196476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
561	NC_006511	CCT	2	6	197282	197287	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
562	NC_006511	A	7	7	198183	198189	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NC_006511	CAT	2	6	198198	198203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
564	NC_006511	ATT	2	6	198232	198237	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
565	NC_006511	GGA	2	6	198254	198259	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
566	NC_006511	CGA	2	6	198660	198665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
567	NC_006511	TAT	2	6	198670	198675	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
568	NC_006511	TTG	2	6	198702	198707	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
569	NC_006511	T	6	6	202914	202919	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
570	NC_006511	TG	3	6	202947	202952	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
571	NC_006511	TCA	2	6	202957	202962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
572	NC_006511	GAAT	2	8	202991	202998	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
573	NC_006511	GCG	2	6	203035	203040	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
574	NC_006511	TTA	2	6	203041	203046	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
575	NC_006511	ATT	2	6	204408	204413	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
576	NC_006511	AT	3	6	204420	204425	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
577	NC_006511	AAGT	2	8	204442	204449	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
578	NC_006511	TCA	2	6	206200	206205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
579	NC_006511	ACT	2	6	206229	206234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
580	NC_006511	AGG	2	6	206244	206249	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
581	NC_006511	GAC	2	6	206708	206713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
582	NC_006511	T	6	6	206735	206740	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
583	NC_006511	AT	3	6	206754	206759	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
584	NC_006511	AAT	2	6	213479	213484	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
585	NC_006511	CCCT	2	8	214293	214300	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
586	NC_006511	TAAAAT	2	12	214313	214324	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
587	NC_006511	ATAAAT	2	12	215003	215014	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
588	NC_006511	AT	3	6	215018	215023	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
589	NC_006511	TA	3	6	215025	215030	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
590	NC_006511	TTG	2	6	215037	215042	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
591	NC_006511	AG	3	6	215071	215076	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
592	NC_006511	CCAT	2	8	215098	215105	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
593	NC_006511	T	7	7	215121	215127	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
594	NC_006511	TAT	2	6	215145	215150	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
595	NC_006511	ATAA	2	8	215163	215170	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
596	NC_006511	ATA	2	6	215174	215179	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
597	NC_006511	TTAT	2	8	215180	215187	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
598	NC_006511	A	7	7	215197	215203	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
599	NC_006511	TAT	2	6	215245	215250	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
600	NC_006511	CTT	2	6	215640	215645	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
601	NC_006511	TGA	2	6	216608	216613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
602	NC_006511	GCGCT	2	10	216626	216635	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
603	NC_006511	CGCGT	2	10	216678	216687	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
604	NC_006511	G	6	6	217558	217563	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
605	NC_006511	TAA	2	6	219523	219528	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
606	NC_006511	AG	3	6	219573	219578	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
607	NC_006511	CAT	2	6	219600	219605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
608	NC_006511	CGC	2	6	219609	219614	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
609	NC_006511	AACG	2	8	220613	220620	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
610	NC_006511	ACGC	2	8	221214	221221	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
611	NC_006511	TAA	2	6	221234	221239	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
612	NC_006511	GA	3	6	225073	225078	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
613	NC_006511	TCT	3	9	225081	225089	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
614	NC_006511	GTC	2	6	225090	225095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
615	NC_006511	GAA	2	6	225101	225106	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
616	NC_006511	TCC	2	6	227780	227785	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
617	NC_006511	ATAA	2	8	227786	227793	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
618	NC_006511	TTA	2	6	227808	227813	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
619	NC_006511	CCTT	2	8	227816	227823	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
620	NC_006511	CGA	2	6	227883	227888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
621	NC_006511	TGC	2	6	227903	227908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
622	NC_006511	AAT	3	9	227915	227923	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
623	NC_006511	TCA	2	6	227948	227953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
624	NC_006511	CTC	2	6	227994	227999	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
625	NC_006511	GTA	2	6	228019	228024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
626	NC_006511	TGTC	2	8	228044	228051	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
627	NC_006511	GGC	2	6	228060	228065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
628	NC_006511	AGA	2	6	228078	228083	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
629	NC_006511	CGC	2	6	228110	228115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
630	NC_006511	CGG	2	6	228134	228139	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
631	NC_006511	GTT	2	6	228217	228222	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
632	NC_006511	CCG	2	6	228224	228229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
633	NC_006511	AAG	2	6	228263	228268	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
634	NC_006511	CGC	2	6	228332	228337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
635	NC_006511	AAT	2	6	228354	228359	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
636	NC_006511	ATG	2	6	228397	228402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
637	NC_006511	CG	3	6	228429	228434	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
638	NC_006511	CGA	2	6	228514	228519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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643	NC_006511	TAC	2	6	228774	228779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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645	NC_006511	AGCA	2	8	229023	229030	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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665	NC_006511	CGG	2	6	229949	229954	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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684	NC_006511	T	6	6	234512	234517	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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952	NC_006511	AAT	2	6	308844	308849	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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