MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Paratyphi A str. ATCC 9150 chromosome

Total Repeats: 16585

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_006511	CAG	2	6	2258359	2258364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8002	NC_006511	GTC	2	6	2258417	2258422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8003	NC_006511	TGA	2	6	2258437	2258442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8004	NC_006511	AACT	2	8	2258489	2258496	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8005	NC_006511	TTG	2	6	2258503	2258508	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8006	NC_006511	TA	3	6	2258550	2258555	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8007	NC_006511	TA	3	6	2258564	2258569	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8008	NC_006511	A	6	6	2258583	2258588	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8009	NC_006511	ATC	2	6	2258618	2258623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8010	NC_006511	T	7	7	2258687	2258693	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8011	NC_006511	AAAT	2	8	2258705	2258712	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8012	NC_006511	CTG	2	6	2258760	2258765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8013	NC_006511	TACAA	2	10	2258792	2258801	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
8014	NC_006511	CAAC	2	8	2258810	2258817	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8015	NC_006511	TAC	2	6	2258905	2258910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8016	NC_006511	TAG	2	6	2258936	2258941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8017	NC_006511	TGC	2	6	2258987	2258992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8018	NC_006511	CAG	2	6	2259026	2259031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8019	NC_006511	TTG	2	6	2259076	2259081	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8020	NC_006511	ATTT	2	8	2259117	2259124	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8021	NC_006511	TAC	2	6	2259131	2259136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8022	NC_006511	T	6	6	2259149	2259154	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8023	NC_006511	CAT	2	6	2259166	2259171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8024	NC_006511	TCA	2	6	2259186	2259191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8025	NC_006511	CAAA	2	8	2259206	2259213	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
8026	NC_006511	GAA	2	6	2259225	2259230	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8027	NC_006511	ATA	2	6	2259231	2259236	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8028	NC_006511	AACA	2	8	2259252	2259259	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
8029	NC_006511	ATT	2	6	2259280	2259285	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8030	NC_006511	TGCA	2	8	2259301	2259308	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8031	NC_006511	TAC	2	6	2259351	2259356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8032	NC_006511	AAC	2	6	2259447	2259452	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8033	NC_006511	TA	3	6	2259456	2259461	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8034	NC_006511	AT	3	6	2259474	2259479	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8035	NC_006511	TAA	2	6	2259521	2259526	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8036	NC_006511	CTG	2	6	2259532	2259537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8037	NC_006511	TGA	2	6	2259545	2259550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8038	NC_006511	AAG	2	6	2259615	2259620	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8039	NC_006511	AAT	2	6	2259752	2259757	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8040	NC_006511	TAAT	2	8	2259775	2259782	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8041	NC_006511	CCA	2	6	2259791	2259796	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8042	NC_006511	GCG	2	6	2259808	2259813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8043	NC_006511	AAG	2	6	2259863	2259868	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8044	NC_006511	A	6	6	2259890	2259895	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8045	NC_006511	CCA	2	6	2259990	2259995	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8046	NC_006511	CAC	2	6	2260092	2260097	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8047	NC_006511	AG	3	6	2260138	2260143	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8048	NC_006511	A	7	7	2260397	2260403	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8049	NC_006511	ATGA	2	8	2260435	2260442	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8050	NC_006511	CGT	2	6	2260551	2260556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8051	NC_006511	GA	3	6	2260640	2260645	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8052	NC_006511	CGAG	2	8	2260711	2260718	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
8053	NC_006511	ATC	2	6	2260750	2260755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8054	NC_006511	GAC	2	6	2260846	2260851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8055	NC_006511	TGA	2	6	2260860	2260865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8056	NC_006511	AGG	2	6	2260895	2260900	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8057	NC_006511	AAG	2	6	2260906	2260911	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8058	NC_006511	GC	3	6	2260935	2260940	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8059	NC_006511	TGAAG	2	10	2261014	2261023	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
8060	NC_006511	GCC	2	6	2261189	2261194	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8061	NC_006511	AATC	2	8	2261206	2261213	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8062	NC_006511	T	6	6	2261258	2261263	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8063	NC_006511	AAT	2	6	2261901	2261906	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8064	NC_006511	T	7	7	2261929	2261935	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8065	NC_006511	ATG	2	6	2261948	2261953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8066	NC_006511	ATA	2	6	2261957	2261962	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8067	NC_006511	AT	3	6	2261987	2261992	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8068	NC_006511	CAT	2	6	2261998	2262003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8069	NC_006511	GGA	2	6	2262012	2262017	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8070	NC_006511	T	6	6	2263100	2263105	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8071	NC_006511	T	7	7	2263192	2263198	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8072	NC_006511	CTC	2	6	2263218	2263223	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8073	NC_006511	T	6	6	2263225	2263230	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8074	NC_006511	TTA	2	6	2263258	2263263	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8075	NC_006511	ATT	2	6	2263295	2263300	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8076	NC_006511	ACA	2	6	2263314	2263319	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8077	NC_006511	ACT	2	6	2263326	2263331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8078	NC_006511	CCA	2	6	2263358	2263363	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8079	NC_006511	T	6	6	2263488	2263493	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8080	NC_006511	TATT	2	8	2263519	2263526	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8081	NC_006511	TAT	2	6	2263570	2263575	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8082	NC_006511	GTGTG	2	10	2263585	2263594	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
8083	NC_006511	ACA	2	6	2263672	2263677	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8084	NC_006511	CGA	2	6	2264320	2264325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8085	NC_006511	CT	3	6	2268541	2268546	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8086	NC_006511	A	6	6	2269245	2269250	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8087	NC_006511	TCCCT	2	10	2269866	2269875	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
8088	NC_006511	AC	4	8	2270467	2270474	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8089	NC_006511	ATT	2	6	2270506	2270511	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8090	NC_006511	AGAT	2	8	2270554	2270561	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8091	NC_006511	ATTA	2	8	2270569	2270576	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8092	NC_006511	TAAT	2	8	2270610	2270617	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8093	NC_006511	TAA	2	6	2270645	2270650	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8094	NC_006511	AAG	2	6	2270711	2270716	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8095	NC_006511	GCC	2	6	2270752	2270757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8096	NC_006511	ACG	2	6	2270769	2270774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8097	NC_006511	TGA	2	6	2270801	2270806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8098	NC_006511	GC	3	6	2270831	2270836	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8099	NC_006511	ACGG	2	8	2270863	2270870	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
8100	NC_006511	TCT	2	6	2270974	2270979	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8101	NC_006511	CT	3	6	2270978	2270983	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8102	NC_006511	ATC	2	6	2272130	2272135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8103	NC_006511	GT	3	6	2274236	2274241	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8104	NC_006511	TAA	2	6	2274245	2274250	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8105	NC_006511	ATT	2	6	2274267	2274272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8106	NC_006511	AGC	2	6	2274282	2274287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8107	NC_006511	TAA	2	6	2274325	2274330	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8108	NC_006511	CAC	2	6	2274362	2274367	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8109	NC_006511	TCG	2	6	2275614	2275619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8110	NC_006511	AGC	2	6	2275691	2275696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8111	NC_006511	CAC	2	6	2275705	2275710	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8112	NC_006511	GCG	2	6	2277310	2277315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8113	NC_006511	CGC	2	6	2277326	2277331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8114	NC_006511	T	6	6	2280358	2280363	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8115	NC_006511	CAC	2	6	2280397	2280402	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8116	NC_006511	GATG	2	8	2280488	2280495	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
8117	NC_006511	AGA	2	6	2280499	2280504	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8118	NC_006511	GA	3	6	2280503	2280508	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8119	NC_006511	GCG	2	6	2280587	2280592	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8120	NC_006511	TTG	2	6	2280595	2280600	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8121	NC_006511	GCG	2	6	2280674	2280679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8122	NC_006511	GCG	2	6	2280710	2280715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8123	NC_006511	CGG	2	6	2280720	2280725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8124	NC_006511	ACG	2	6	2280743	2280748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8125	NC_006511	TAA	2	6	2280754	2280759	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8126	NC_006511	ATC	2	6	2280821	2280826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8127	NC_006511	TGG	2	6	2280875	2280880	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8128	NC_006511	CAT	2	6	2280895	2280900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8129	NC_006511	AGCC	2	8	2280939	2280946	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8130	NC_006511	CGC	2	6	2280955	2280960	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8131	NC_006511	CCG	2	6	2280963	2280968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8132	NC_006511	CCG	2	6	2280977	2280982	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8133	NC_006511	CGC	2	6	2281002	2281007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8134	NC_006511	CGC	2	6	2281171	2281176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8135	NC_006511	ATA	2	6	2281178	2281183	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8136	NC_006511	GC	3	6	2281272	2281277	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8137	NC_006511	CCG	2	6	2281283	2281288	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8138	NC_006511	GCG	2	6	2281440	2281445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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8142	NC_006511	GCT	2	6	2281611	2281616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8143	NC_006511	CTG	2	6	2281629	2281634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8144	NC_006511	CTT	2	6	2281640	2281645	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8145	NC_006511	CAG	2	6	2281764	2281769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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8152	NC_006511	TAA	2	6	2281912	2281917	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8153	NC_006511	ATTGCA	2	12	2281926	2281937	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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8158	NC_006511	TTTA	2	8	2282071	2282078	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8160	NC_006511	T	7	7	2282126	2282132	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8164	NC_006511	ATT	2	6	2285338	2285343	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8166	NC_006511	T	7	7	2285388	2285394	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8167	NC_006511	CGT	2	6	2287895	2287900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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8171	NC_006511	AACG	2	8	2289433	2289440	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
8172	NC_006511	GCC	2	6	2289502	2289507	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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8201	NC_006511	CCG	2	6	2290670	2290675	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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8236	NC_006511	CT	3	6	2309233	2309238	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8237	NC_006511	GC	3	6	2309248	2309253	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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8242	NC_006511	G	6	6	2310818	2310823	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
8243	NC_006511	ATG	2	6	2310906	2310911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8245	NC_006511	CG	3	6	2311009	2311014	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8246	NC_006511	TGACCA	2	12	2311057	2311068	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
8247	NC_006511	GCT	2	6	2311139	2311144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8248	NC_006511	CCA	2	6	2311162	2311167	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8249	NC_006511	CCGC	3	12	2311211	2311222	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
8250	NC_006511	GC	3	6	2311395	2311400	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8251	NC_006511	CCG	2	6	2311408	2311413	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8252	NC_006511	CGC	2	6	2311454	2311459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8253	NC_006511	ACT	2	6	2311480	2311485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8254	NC_006511	TCGGC	2	10	2311522	2311531	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
8255	NC_006511	ATG	2	6	2311551	2311556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8256	NC_006511	CAG	2	6	2311568	2311573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8257	NC_006511	A	6	6	2311632	2311637	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8258	NC_006511	TGA	2	6	2312590	2312595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8259	NC_006511	GCA	2	6	2315135	2315140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8260	NC_006511	AT	3	6	2315152	2315157	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8261	NC_006511	AT	3	6	2315187	2315192	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8262	NC_006511	A	6	6	2315224	2315229	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8263	NC_006511	T	7	7	2315245	2315251	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8335	NC_006511	ATA	2	6	2345481	2345486	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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