MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Paratyphi A str. ATCC 9150 chromosome

Total Repeats: 16585

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_006511	GCG	2	6	1550605	1550610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5502	NC_006511	TAA	2	6	1550638	1550643	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5503	NC_006511	T	6	6	1550697	1550702	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5504	NC_006511	GC	3	6	1550722	1550727	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5505	NC_006511	CA	3	6	1550814	1550819	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5506	NC_006511	CAT	2	6	1550864	1550869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5507	NC_006511	TCC	2	6	1550929	1550934	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5508	NC_006511	AAGACT	2	12	1550943	1550954	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5509	NC_006511	TTG	2	6	1552374	1552379	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5510	NC_006511	TG	3	6	1552378	1552383	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5511	NC_006511	AATT	2	8	1552384	1552391	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5512	NC_006511	A	6	6	1552397	1552402	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5513	NC_006511	T	7	7	1552418	1552424	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5514	NC_006511	TAA	2	6	1552445	1552450	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5515	NC_006511	A	7	7	1552449	1552455	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5516	NC_006511	AAG	2	6	1552492	1552497	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5517	NC_006511	T	6	6	1552529	1552534	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5518	NC_006511	CTT	2	6	1552558	1552563	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5519	NC_006511	A	7	7	1552598	1552604	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5520	NC_006511	A	6	6	1552617	1552622	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5521	NC_006511	TAA	2	6	1552929	1552934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5522	NC_006511	T	7	7	1552957	1552963	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5523	NC_006511	CA	3	6	1552975	1552980	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5524	NC_006511	TACA	2	8	1553283	1553290	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5525	NC_006511	CATA	2	8	1553295	1553302	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5526	NC_006511	T	6	6	1553594	1553599	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5527	NC_006511	CGT	2	6	1553603	1553608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5528	NC_006511	TGC	2	6	1553610	1553615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5529	NC_006511	CCT	2	6	1554629	1554634	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5530	NC_006511	CGA	2	6	1554657	1554662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5531	NC_006511	AAC	2	6	1554685	1554690	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5532	NC_006511	CT	3	6	1554701	1554706	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5533	NC_006511	CTGT	2	8	1554764	1554771	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5534	NC_006511	CCA	2	6	1555241	1555246	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5535	NC_006511	CTT	2	6	1555256	1555261	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5536	NC_006511	GTG	2	6	1555338	1555343	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5537	NC_006511	CGT	2	6	1555388	1555393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5538	NC_006511	ATG	2	6	1555573	1555578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5539	NC_006511	CGT	2	6	1555629	1555634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5540	NC_006511	ATC	2	6	1555660	1555665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5541	NC_006511	CGG	2	6	1555682	1555687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5542	NC_006511	GCA	2	6	1555696	1555701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5543	NC_006511	ATGCCG	2	12	1555722	1555733	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5544	NC_006511	CCA	2	6	1555828	1555833	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5545	NC_006511	GC	3	6	1555853	1555858	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5546	NC_006511	CAG	2	6	1555922	1555927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5547	NC_006511	ATA	2	6	1556073	1556078	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5548	NC_006511	CGT	2	6	1556141	1556146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5549	NC_006511	TTC	2	6	1556165	1556170	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5550	NC_006511	TAA	2	6	1556185	1556190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5551	NC_006511	GC	3	6	1556236	1556241	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5552	NC_006511	GCA	2	6	1556268	1556273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5553	NC_006511	ATCA	2	8	1556303	1556310	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5554	NC_006511	GCTG	2	8	1556330	1556337	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5555	NC_006511	CTG	2	6	1556467	1556472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5556	NC_006511	CCT	2	6	1556541	1556546	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5557	NC_006511	TCG	2	6	1556604	1556609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5558	NC_006511	CAA	2	6	1556683	1556688	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5559	NC_006511	TTA	2	6	1556693	1556698	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5560	NC_006511	CG	3	6	1556761	1556766	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5561	NC_006511	GGC	2	6	1556799	1556804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5562	NC_006511	GCT	2	6	1556920	1556925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5563	NC_006511	GTG	2	6	1556926	1556931	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5564	NC_006511	GTA	2	6	1556934	1556939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5565	NC_006511	GCG	2	6	1556942	1556947	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5566	NC_006511	CAG	2	6	1556950	1556955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5567	NC_006511	CAG	2	6	1556989	1556994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5568	NC_006511	CG	3	6	1557089	1557094	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5569	NC_006511	CGCCAG	2	12	1557160	1557171	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
5570	NC_006511	TGG	2	6	1557173	1557178	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5571	NC_006511	TCG	2	6	1557200	1557205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5572	NC_006511	TA	3	6	1557274	1557279	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5573	NC_006511	CAGCGC	2	12	1557457	1557468	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
5574	NC_006511	GCG	2	6	1557479	1557484	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5575	NC_006511	CTG	2	6	1557499	1557504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5576	NC_006511	GCG	2	6	1557534	1557539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5577	NC_006511	TGT	2	6	1557590	1557595	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5578	NC_006511	TGT	2	6	1557599	1557604	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5579	NC_006511	TTC	2	6	1557634	1557639	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5580	NC_006511	TGC	2	6	1557647	1557652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5581	NC_006511	TCA	2	6	1558425	1558430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5582	NC_006511	CAA	2	6	1560385	1560390	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5583	NC_006511	TTA	2	6	1560411	1560416	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5584	NC_006511	GACA	2	8	1560445	1560452	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5585	NC_006511	TAAT	2	8	1560546	1560553	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5586	NC_006511	GGC	2	6	1560572	1560577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5587	NC_006511	T	6	6	1560593	1560598	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5588	NC_006511	T	6	6	1562069	1562074	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5589	NC_006511	GAAAA	2	10	1562084	1562093	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
5590	NC_006511	AAT	2	6	1562190	1562195	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5591	NC_006511	AG	3	6	1562203	1562208	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5592	NC_006511	T	8	8	1562240	1562247	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5593	NC_006511	TTCCC	2	10	1562998	1563007	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
5594	NC_006511	TGT	2	6	1566132	1566137	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5595	NC_006511	GCGAGC	2	12	1566158	1566169	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
5596	NC_006511	TGT	2	6	1566218	1566223	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5597	NC_006511	T	7	7	1566230	1566236	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5598	NC_006511	TCA	2	6	1566295	1566300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5599	NC_006511	GGC	2	6	1567498	1567503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5600	NC_006511	GCC	2	6	1567507	1567512	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5601	NC_006511	CGC	2	6	1567576	1567581	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5602	NC_006511	CTA	2	6	1567659	1567664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5603	NC_006511	AAC	2	6	1567723	1567728	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5604	NC_006511	TG	3	6	1567736	1567741	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5605	NC_006511	T	9	9	1567770	1567778	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5606	NC_006511	GAA	2	6	1567815	1567820	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5607	NC_006511	A	8	8	1567819	1567826	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5608	NC_006511	A	6	6	1567858	1567863	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5609	NC_006511	ACA	2	6	1568647	1568652	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5610	NC_006511	A	7	7	1571157	1571163	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5611	NC_006511	ATTT	2	8	1571183	1571190	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5612	NC_006511	T	6	6	1571188	1571193	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5613	NC_006511	AC	3	6	1571282	1571287	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5614	NC_006511	ATTA	2	8	1571293	1571300	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5615	NC_006511	CTGC	2	8	1572280	1572287	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5616	NC_006511	CAG	2	6	1572316	1572321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5617	NC_006511	CAA	2	6	1572373	1572378	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5618	NC_006511	TTC	2	6	1573471	1573476	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5619	NC_006511	ACCC	2	8	1573485	1573492	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
5620	NC_006511	ACGC	2	8	1573501	1573508	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5621	NC_006511	ATTA	2	8	1573547	1573554	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5622	NC_006511	ATA	3	9	1573558	1573566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5623	NC_006511	ATT	2	6	1573582	1573587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5624	NC_006511	AATA	2	8	1573588	1573595	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5625	NC_006511	CAG	2	6	1573799	1573804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5626	NC_006511	TGC	2	6	1573809	1573814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5627	NC_006511	CCT	2	6	1575272	1575277	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5628	NC_006511	ACGG	2	8	1576087	1576094	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5629	NC_006511	TCA	2	6	1576128	1576133	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5631	NC_006511	TAA	2	6	1576237	1576242	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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