MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Paratyphi A str. ATCC 9150 chromosome

Total Repeats: 16585

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_006511	CCG	2	6	1399005	1399010	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5002	NC_006511	ATG	2	6	1399046	1399051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5003	NC_006511	CAA	2	6	1399066	1399071	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5004	NC_006511	AAC	2	6	1399073	1399078	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5005	NC_006511	TCT	2	6	1399122	1399127	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5006	NC_006511	ACT	2	6	1399198	1399203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5007	NC_006511	TCA	2	6	1399260	1399265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5008	NC_006511	GAC	2	6	1399280	1399285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5009	NC_006511	TGC	2	6	1399349	1399354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5010	NC_006511	GCG	3	9	1399358	1399366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5011	NC_006511	TTG	2	6	1399436	1399441	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5012	NC_006511	CAC	2	6	1399470	1399475	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5013	NC_006511	ATC	2	6	1399476	1399481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5014	NC_006511	AG	3	6	1399494	1399499	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5015	NC_006511	CGC	2	6	1399517	1399522	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5016	NC_006511	TGA	2	6	1399525	1399530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5017	NC_006511	TAA	2	6	1399601	1399606	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5018	NC_006511	CGC	2	6	1399625	1399630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5019	NC_006511	CTT	2	6	1399631	1399636	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5020	NC_006511	TTC	2	6	1399686	1399691	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5021	NC_006511	CGAT	2	8	1399726	1399733	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5022	NC_006511	CA	3	6	1399752	1399757	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5023	NC_006511	GGC	2	6	1399806	1399811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5024	NC_006511	CCAG	2	8	1399823	1399830	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5025	NC_006511	AAC	3	9	1399866	1399874	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5026	NC_006511	GCA	2	6	1399901	1399906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5027	NC_006511	ACA	2	6	1399936	1399941	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5028	NC_006511	CTG	2	6	1399967	1399972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5029	NC_006511	TGC	2	6	1399991	1399996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5030	NC_006511	CAA	2	6	1400064	1400069	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5031	NC_006511	TGT	2	6	1400076	1400081	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5032	NC_006511	TCAG	2	8	1400140	1400147	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5033	NC_006511	AGC	2	6	1400152	1400157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5034	NC_006511	TA	3	6	1401126	1401131	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5035	NC_006511	TGT	3	9	1401187	1401195	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5036	NC_006511	CTTTT	2	10	1401268	1401277	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
5037	NC_006511	ATAA	2	8	1401544	1401551	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5038	NC_006511	T	7	7	1401563	1401569	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5039	NC_006511	CAT	2	6	1401570	1401575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5040	NC_006511	TTGT	2	8	1401583	1401590	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5041	NC_006511	TGGAT	2	10	1401595	1401604	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
5042	NC_006511	AT	3	6	1401607	1401612	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5043	NC_006511	GCA	2	6	1401637	1401642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5044	NC_006511	TAAT	2	8	1401645	1401652	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5045	NC_006511	TAA	2	6	1401673	1401678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5046	NC_006511	A	7	7	1401752	1401758	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5047	NC_006511	CAT	2	6	1401762	1401767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5048	NC_006511	TAAA	2	8	1401772	1401779	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5049	NC_006511	A	6	6	1401777	1401782	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5050	NC_006511	ATTAA	2	10	1401849	1401858	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5051	NC_006511	CA	3	6	1401885	1401890	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5052	NC_006511	GTT	2	6	1401899	1401904	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5053	NC_006511	CTA	2	6	1401925	1401930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5054	NC_006511	ATG	2	6	1401963	1401968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5055	NC_006511	ACTA	2	8	1401974	1401981	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5056	NC_006511	CGAC	2	8	1406278	1406285	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5057	NC_006511	C	6	6	1406331	1406336	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5058	NC_006511	GCT	2	6	1406351	1406356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5059	NC_006511	GGC	2	6	1406364	1406369	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5060	NC_006511	CGA	2	6	1406376	1406381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5061	NC_006511	GGC	2	6	1406414	1406419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5062	NC_006511	TAT	2	6	1406482	1406487	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5063	NC_006511	AC	3	6	1406944	1406949	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5064	NC_006511	A	6	6	1409257	1409262	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5065	NC_006511	ATA	2	6	1409284	1409289	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5066	NC_006511	AAT	2	6	1409305	1409310	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5067	NC_006511	AGG	2	6	1409342	1409347	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5068	NC_006511	CTG	2	6	1410681	1410686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5069	NC_006511	TAA	2	6	1410687	1410692	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5070	NC_006511	CTT	2	6	1410814	1410819	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5071	NC_006511	ATTT	2	8	1410848	1410855	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5072	NC_006511	TAC	2	6	1410882	1410887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5073	NC_006511	CTTCG	2	10	1410901	1410910	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
5074	NC_006511	TAA	2	6	1410995	1411000	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5075	NC_006511	ACA	3	9	1411021	1411029	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5076	NC_006511	ACAA	2	8	1411071	1411078	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5077	NC_006511	ACT	2	6	1411098	1411103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5078	NC_006511	T	6	6	1411134	1411139	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5079	NC_006511	CCCTG	2	10	1412810	1412819	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
5080	NC_006511	T	7	7	1412827	1412833	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5081	NC_006511	A	7	7	1412855	1412861	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5082	NC_006511	ATGT	2	8	1412869	1412876	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5083	NC_006511	AT	3	6	1412907	1412912	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5084	NC_006511	GCT	2	6	1412924	1412929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5085	NC_006511	ACG	2	6	1412965	1412970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5086	NC_006511	GCT	2	6	1412972	1412977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5087	NC_006511	TTCT	2	8	1415726	1415733	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5088	NC_006511	CAT	2	6	1415756	1415761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5089	NC_006511	AAT	2	6	1415789	1415794	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5090	NC_006511	GC	3	6	1418778	1418783	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5091	NC_006511	ATTA	2	8	1418950	1418957	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5092	NC_006511	TA	3	6	1420451	1420456	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5093	NC_006511	CTG	2	6	1420472	1420477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5094	NC_006511	AAAT	2	8	1420546	1420553	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5095	NC_006511	T	6	6	1420606	1420611	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5096	NC_006511	A	6	6	1420612	1420617	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5097	NC_006511	TGC	2	6	1420779	1420784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5098	NC_006511	GGCA	2	8	1420817	1420824	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5099	NC_006511	A	9	9	1420824	1420832	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5100	NC_006511	CCG	2	6	1420833	1420838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5101	NC_006511	C	6	6	1421007	1421012	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5102	NC_006511	GC	3	6	1421086	1421091	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5103	NC_006511	CT	3	6	1421487	1421492	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5104	NC_006511	TAA	2	6	1421496	1421501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5105	NC_006511	AAT	2	6	1421707	1421712	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5106	NC_006511	T	6	6	1421721	1421726	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5107	NC_006511	GAT	2	6	1421730	1421735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5108	NC_006511	TTG	2	6	1421801	1421806	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5109	NC_006511	AAT	2	6	1421819	1421824	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5110	NC_006511	ATAAA	2	10	1421842	1421851	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5111	NC_006511	GAA	2	6	1421866	1421871	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5112	NC_006511	AAT	2	6	1422442	1422447	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5113	NC_006511	AAC	2	6	1422465	1422470	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5114	NC_006511	A	7	7	1422484	1422490	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5115	NC_006511	AT	3	6	1422531	1422536	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5116	NC_006511	ATG	3	9	1422754	1422762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5117	NC_006511	ATATG	2	10	1422774	1422783	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
5118	NC_006511	TCT	2	6	1422784	1422789	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5119	NC_006511	ATT	2	6	1422852	1422857	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5120	NC_006511	ATA	2	6	1422861	1422866	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5121	NC_006511	CCA	2	6	1422867	1422872	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5122	NC_006511	AT	3	6	1422884	1422889	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5123	NC_006511	TAA	2	6	1422917	1422922	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5124	NC_006511	CCA	2	6	1422939	1422944	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5125	NC_006511	TCA	2	6	1423023	1423028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5126	NC_006511	GTT	2	6	1423054	1423059	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5127	NC_006511	AAC	2	6	1423071	1423076	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5128	NC_006511	CGC	2	6	1425218	1425223	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5129	NC_006511	ACA	2	6	1425237	1425242	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5130	NC_006511	TG	3	6	1425261	1425266	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5131	NC_006511	ACC	2	6	1426086	1426091	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5132	NC_006511	CAAAAA	2	12	1426908	1426919	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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5134	NC_006511	ACA	2	6	1428839	1428844	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5250	NC_006511	A	7	7	1461171	1461177	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5251	NC_006511	T	6	6	1461236	1461241	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5252	NC_006511	CAAA	2	8	1461257	1461264	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5253	NC_006511	TCATGA	2	12	1461265	1461276	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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5256	NC_006511	AT	3	6	1461291	1461296	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5257	NC_006511	AT	3	6	1461306	1461311	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5259	NC_006511	ATA	2	6	1461375	1461380	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5261	NC_006511	TTC	2	6	1462629	1462634	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5263	NC_006511	CGG	2	6	1462650	1462655	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5264	NC_006511	CTTTT	2	10	1462657	1462666	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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5396	NC_006511	TGG	2	6	1510526	1510531	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5399	NC_006511	TGG	2	6	1510613	1510618	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5493	NC_006511	A	6	6	1547195	1547200	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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