MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Streptococcus thermophilus CNRZ1066 chromosome

Total Repeats: 6810

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006449	T	7	7	22	28	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_006449	T	7	7	75	81	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_006449	ACT	2	6	1563	1568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_006449	CTA	5	15	1661	1675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_006449	ATA	2	6	1678	1683	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_006449	TAA	2	6	1685	1690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_006449	T	6	6	2870	2875	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_006449	AGG	2	6	2880	2885	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_006449	CTA	2	6	3107	3112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_006449	A	6	6	4417	4422	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_006449	TA	3	6	8573	8578	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_006449	CTTTT	2	10	8597	8606	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
13	NC_006449	A	8	8	8686	8693	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_006449	GGAAA	2	10	8720	8729	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
15	NC_006449	T	7	7	9396	9402	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_006449	A	7	7	9438	9444	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_006449	GAA	2	6	9484	9489	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_006449	GAT	2	6	12076	12081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_006449	TAA	2	6	12098	12103	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_006449	AGA	2	6	14936	14941	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_006449	TTC	2	6	14948	14953	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_006449	ATG	2	6	15910	15915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_006449	TTCT	2	8	15969	15976	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_006449	ATG	2	6	15978	15983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_006449	TAGA	2	8	16027	16034	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_006449	A	7	7	16359	16365	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_006449	TTG	2	6	16377	16382	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_006449	CAGT	2	8	17434	17441	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
29	NC_006449	T	6	6	17457	17462	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_006449	TAA	2	6	17495	17500	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_006449	A	6	6	17502	17507	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_006449	TTA	2	6	17508	17513	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_006449	A	6	6	17513	17518	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_006449	A	7	7	17533	17539	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_006449	AAG	2	6	17555	17560	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_006449	GAT	2	6	17562	17567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_006449	GA	3	6	17589	17594	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_006449	GAA	2	6	17605	17610	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_006449	A	7	7	17614	17620	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_006449	A	7	7	17625	17631	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_006449	AG	3	6	17679	17684	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_006449	AGA	2	6	17733	17738	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_006449	GAC	2	6	17774	17779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_006449	ATT	2	6	17803	17808	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_006449	GGC	2	6	17851	17856	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_006449	AG	3	6	17886	17891	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_006449	CTT	2	6	17901	17906	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_006449	ATTT	2	8	18013	18020	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_006449	TAG	2	6	18068	18073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_006449	CGA	2	6	18096	18101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_006449	GCA	2	6	18170	18175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_006449	CGC	2	6	18217	18222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_006449	GTGA	2	8	18223	18230	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_006449	TGT	2	6	18256	18261	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_006449	CAG	2	6	18339	18344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_006449	AGCG	2	8	18394	18401	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
57	NC_006449	AT	3	6	18523	18528	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_006449	GGA	2	6	18529	18534	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_006449	CT	3	6	18554	18559	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_006449	GAA	2	6	18793	18798	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_006449	GGT	2	6	18867	18872	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_006449	GTC	2	6	18881	18886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_006449	TCGTG	2	10	18890	18899	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
64	NC_006449	CAT	2	6	18949	18954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_006449	TAA	2	6	18984	18989	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_006449	GGA	2	6	18993	18998	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_006449	ATC	2	6	19017	19022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_006449	AC	3	6	19044	19049	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_006449	TGGT	2	8	19059	19066	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_006449	GAC	2	6	19087	19092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_006449	CGC	2	6	19183	19188	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_006449	AC	3	6	19213	19218	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_006449	CAC	2	6	19228	19233	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_006449	AGCC	2	8	19275	19282	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
75	NC_006449	GAT	2	6	19298	19303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_006449	CCT	2	6	19354	19359	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_006449	AGG	2	6	19456	19461	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_006449	GTAA	2	8	19550	19557	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_006449	ATAG	2	8	19564	19571	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_006449	GTTAA	2	10	19637	19646	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
81	NC_006449	ACG	2	6	19700	19705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_006449	TAG	2	6	19871	19876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_006449	GCGA	2	8	19879	19886	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
84	NC_006449	AGA	2	6	19958	19963	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_006449	AG	3	6	19986	19991	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_006449	TCG	2	6	20061	20066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_006449	GGA	2	6	20074	20079	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_006449	CT	3	6	20100	20105	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_006449	GGGAG	2	10	20155	20164	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
90	NC_006449	ACA	2	6	20192	20197	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_006449	ATG	2	6	20259	20264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_006449	GGA	2	6	20392	20397	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_006449	TC	3	6	20478	20483	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_006449	ACC	2	6	20657	20662	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_006449	AT	3	6	20678	20683	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_006449	AGC	2	6	20737	20742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_006449	ATTC	2	8	20744	20751	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
98	NC_006449	GAA	2	6	20871	20876	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_006449	GAG	2	6	20887	20892	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_006449	GA	3	6	21017	21022	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_006449	ACA	2	6	21043	21048	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_006449	TA	3	6	21071	21076	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_006449	CTAA	2	8	21098	21105	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
104	NC_006449	TAG	2	6	21200	21205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_006449	GA	3	6	21312	21317	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_006449	CTGA	2	8	21371	21378	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
107	NC_006449	CT	3	6	21428	21433	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_006449	GAT	2	6	21446	21451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_006449	CGG	2	6	21537	21542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_006449	GA	3	6	21635	21640	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_006449	TAGG	2	8	21753	21760	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_006449	GTT	2	6	21797	21802	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_006449	TAC	2	6	21807	21812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_006449	CCT	2	6	21895	21900	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_006449	GGT	2	6	22031	22036	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_006449	TCG	2	6	22146	22151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_006449	CGT	2	6	22226	22231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_006449	GTT	2	6	22329	22334	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_006449	AGGGA	2	10	22364	22373	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
120	NC_006449	GA	3	6	22450	22455	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_006449	GAAGTG	2	12	22475	22486	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_006449	ACTAAT	2	12	22505	22516	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_006449	AT	3	6	22550	22555	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_006449	TTGAG	2	10	22598	22607	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
125	NC_006449	GTG	2	6	22821	22826	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
126	NC_006449	AT	3	6	22979	22984	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_006449	A	6	6	23071	23076	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_006449	ACC	2	6	23184	23189	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
129	NC_006449	CGT	2	6	23221	23226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_006449	GAG	2	6	23233	23238	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
131	NC_006449	TAA	3	9	23329	23337	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_006449	CTC	2	6	23397	23402	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
133	NC_006449	CGC	2	6	23564	23569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
134	NC_006449	TA	3	6	23570	23575	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_006449	AT	3	6	23659	23664	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_006449	GGA	2	6	23679	23684	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
137	NC_006449	GCGT	2	8	23738	23745	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
138	NC_006449	TCC	2	6	23762	23767	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
139	NC_006449	AGC	2	6	23788	23793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_006449	TCG	2	6	23802	23807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_006449	CGG	2	6	23902	23907	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_006449	TGT	2	6	23931	23936	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
143	NC_006449	TGT	2	6	23979	23984	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
144	NC_006449	GGT	2	6	24093	24098	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
145	NC_006449	TAT	2	6	24210	24215	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_006449	T	6	6	24246	24251	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_006449	TAA	2	6	25639	25644	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_006449	T	6	6	25656	25661	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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