MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Streptococcus thermophilus CNRZ1066 chromosome

Total Repeats: 6810

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_006449	CCT	2	6	1718185	1718190	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6502	NC_006449	AAT	2	6	1718247	1718252	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6503	NC_006449	A	7	7	1718269	1718275	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6504	NC_006449	TGT	2	6	1718299	1718304	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6505	NC_006449	CAA	2	6	1718418	1718423	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6506	NC_006449	CAA	2	6	1718429	1718434	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6507	NC_006449	TAC	2	6	1718458	1718463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6508	NC_006449	TAA	2	6	1720706	1720711	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6509	NC_006449	A	7	7	1720710	1720716	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6510	NC_006449	CCT	2	6	1720808	1720813	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6511	NC_006449	CGC	2	6	1720835	1720840	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6512	NC_006449	AAT	2	6	1720847	1720852	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6513	NC_006449	A	6	6	1720861	1720866	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6514	NC_006449	ACTTT	2	10	1720873	1720882	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
6515	NC_006449	T	8	8	1720880	1720887	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6516	NC_006449	T	7	7	1720899	1720905	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6517	NC_006449	GGT	2	6	1720984	1720989	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6518	NC_006449	TAC	2	6	1721011	1721016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6519	NC_006449	T	6	6	1721018	1721023	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6520	NC_006449	CAC	2	6	1721034	1721039	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6521	NC_006449	CTAT	2	8	1721058	1721065	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6522	NC_006449	AAAAT	2	10	1721073	1721082	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
6523	NC_006449	ATTG	2	8	1721097	1721104	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6524	NC_006449	TAG	2	6	1721175	1721180	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6525	NC_006449	ATC	2	6	1721563	1721568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6526	NC_006449	TTC	2	6	1722384	1722389	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6527	NC_006449	ATT	2	6	1722415	1722420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6528	NC_006449	TA	3	6	1722440	1722445	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6529	NC_006449	ATT	2	6	1722464	1722469	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6530	NC_006449	AT	3	6	1722476	1722481	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6531	NC_006449	A	7	7	1722509	1722515	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6532	NC_006449	ACT	2	6	1722518	1722523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6533	NC_006449	ATT	2	6	1722616	1722621	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6534	NC_006449	T	6	6	1722731	1722736	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6535	NC_006449	CTG	2	6	1723661	1723666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6536	NC_006449	TA	3	6	1723677	1723682	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6537	NC_006449	CAG	2	6	1723689	1723694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6538	NC_006449	TATTT	2	10	1723695	1723704	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
6539	NC_006449	A	6	6	1725889	1725894	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6540	NC_006449	TA	3	6	1725895	1725900	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6541	NC_006449	ATA	2	6	1725931	1725936	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6542	NC_006449	TAAA	2	8	1725995	1726002	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6543	NC_006449	ATAC	2	8	1726079	1726086	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6544	NC_006449	AATT	2	8	1726109	1726116	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6545	NC_006449	TC	3	6	1726131	1726136	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6546	NC_006449	GAT	2	6	1726140	1726145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6547	NC_006449	ACA	2	6	1727478	1727483	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6548	NC_006449	AATT	2	8	1727486	1727493	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6549	NC_006449	ATA	2	6	1727503	1727508	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6550	NC_006449	ATT	2	6	1727527	1727532	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6551	NC_006449	ATG	2	6	1727543	1727548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6552	NC_006449	A	6	6	1727572	1727577	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6553	NC_006449	TTTA	2	8	1727581	1727588	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6554	NC_006449	T	7	7	1727594	1727600	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6555	NC_006449	ATG	2	6	1727610	1727615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6556	NC_006449	AAT	2	6	1727653	1727658	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6557	NC_006449	AGA	2	6	1727687	1727692	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6558	NC_006449	ATT	2	6	1727716	1727721	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6559	NC_006449	AG	3	6	1727900	1727905	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6560	NC_006449	TAA	2	6	1727947	1727952	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6561	NC_006449	T	6	6	1728001	1728006	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6562	NC_006449	CGATAA	2	12	1728056	1728067	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6563	NC_006449	ACAA	2	8	1728082	1728089	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
6564	NC_006449	T	6	6	1728105	1728110	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6565	NC_006449	ATA	2	6	1728149	1728154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6566	NC_006449	GAA	2	6	1728169	1728174	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6567	NC_006449	AGG	2	6	1728195	1728200	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6568	NC_006449	A	6	6	1728230	1728235	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6569	NC_006449	A	6	6	1728262	1728267	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6570	NC_006449	TC	3	6	1728298	1728303	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6571	NC_006449	ATG	2	6	1728315	1728320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6572	NC_006449	T	7	7	1728344	1728350	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6573	NC_006449	ATG	2	6	1729112	1729117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6574	NC_006449	AGG	2	6	1729132	1729137	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6575	NC_006449	GAA	2	6	1729173	1729178	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6576	NC_006449	TAAT	2	8	1729204	1729211	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6577	NC_006449	TGA	2	6	1732108	1732113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6578	NC_006449	GA	3	6	1732126	1732131	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6579	NC_006449	TC	3	6	1732145	1732150	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6580	NC_006449	T	6	6	1732181	1732186	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6581	NC_006449	TG	3	6	1732223	1732228	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6582	NC_006449	CAAGGG	2	12	1732231	1732242	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
6583	NC_006449	CAGC	2	8	1732325	1732332	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6584	NC_006449	ACG	2	6	1732364	1732369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6586	NC_006449	G	6	6	1732425	1732430	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6587	NC_006449	A	6	6	1734800	1734805	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6588	NC_006449	ATT	2	6	1735139	1735144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6589	NC_006449	T	9	9	1735161	1735169	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6590	NC_006449	TTC	2	6	1735187	1735192	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6591	NC_006449	T	7	7	1736476	1736482	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6592	NC_006449	TATT	2	8	1736487	1736494	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6593	NC_006449	CTT	2	6	1736495	1736500	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6594	NC_006449	ATA	2	6	1736501	1736506	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6595	NC_006449	TAA	2	6	1736606	1736611	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6596	NC_006449	AGG	2	6	1736621	1736626	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6597	NC_006449	TTA	2	6	1736828	1736833	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6598	NC_006449	AG	3	6	1736841	1736846	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6599	NC_006449	TAA	2	6	1736907	1736912	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6600	NC_006449	AGAA	2	8	1736935	1736942	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
6601	NC_006449	A	6	6	1738093	1738098	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6602	NC_006449	T	6	6	1738126	1738131	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6603	NC_006449	T	6	6	1738138	1738143	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6604	NC_006449	AG	3	6	1738161	1738166	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6605	NC_006449	TAT	2	6	1738182	1738187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6606	NC_006449	AT	3	6	1739922	1739927	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6607	NC_006449	AT	3	6	1739954	1739959	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6608	NC_006449	T	9	9	1739963	1739971	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6609	NC_006449	AGC	2	6	1740000	1740005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6610	NC_006449	TAA	2	6	1742244	1742249	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6611	NC_006449	AGC	2	6	1742256	1742261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6612	NC_006449	ATA	2	6	1742265	1742270	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6613	NC_006449	CTCC	2	8	1742279	1742286	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
6614	NC_006449	TGCTT	2	10	1742292	1742301	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
6615	NC_006449	TC	3	6	1744371	1744376	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6616	NC_006449	A	6	6	1744381	1744386	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6617	NC_006449	GTC	2	6	1744398	1744403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6618	NC_006449	CTT	2	6	1744410	1744415	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6619	NC_006449	CTT	2	6	1747111	1747116	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6620	NC_006449	T	6	6	1747124	1747129	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6621	NC_006449	TAT	2	6	1747139	1747144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6622	NC_006449	CCCA	2	8	1747165	1747172	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
6623	NC_006449	CTTT	2	8	1747196	1747203	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6624	NC_006449	T	6	6	1747201	1747206	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6625	NC_006449	ATG	2	6	1748925	1748930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6626	NC_006449	CCT	2	6	1748954	1748959	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6627	NC_006449	TTA	2	6	1748966	1748971	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6628	NC_006449	T	7	7	1749029	1749035	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6629	NC_006449	AAGA	2	8	1749042	1749049	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
6630	NC_006449	TA	4	8	1749064	1749071	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6631	NC_006449	TCA	2	6	1749086	1749091	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6632	NC_006449	ACAA	2	8	1749092	1749099	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
6633	NC_006449	GAG	2	6	1749113	1749118	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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