MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Streptococcus thermophilus CNRZ1066 chromosome

Total Repeats: 6810

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_006449	ACAA	2	8	1610542	1610549	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
6002	NC_006449	TAAA	2	8	1610563	1610570	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6003	NC_006449	A	6	6	1610926	1610931	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6004	NC_006449	ATA	2	6	1610941	1610946	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6005	NC_006449	A	6	6	1610950	1610955	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6006	NC_006449	A	6	6	1610981	1610986	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6007	NC_006449	A	6	6	1611006	1611011	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6008	NC_006449	CAT	2	6	1611043	1611048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6009	NC_006449	CTA	2	6	1611065	1611070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6010	NC_006449	AT	3	6	1611274	1611279	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6011	NC_006449	TATTAG	2	12	1611312	1611323	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6012	NC_006449	CAC	2	6	1611338	1611343	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6013	NC_006449	ATC	2	6	1611370	1611375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6014	NC_006449	TC	3	6	1611374	1611379	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6015	NC_006449	TCCCT	2	10	1611456	1611465	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
6016	NC_006449	AAC	2	6	1611495	1611500	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6017	NC_006449	ACG	2	6	1611598	1611603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6018	NC_006449	CGA	2	6	1611678	1611683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6019	NC_006449	ACC	2	6	1611793	1611798	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6020	NC_006449	AGG	2	6	1611929	1611934	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6021	NC_006449	GTA	2	6	1612017	1612022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6022	NC_006449	CAA	2	6	1612026	1612031	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6023	NC_006449	CCTA	2	8	1612069	1612076	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6024	NC_006449	TC	3	6	1612189	1612194	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6025	NC_006449	GCC	2	6	1612286	1612291	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6026	NC_006449	CTC	2	6	1612334	1612339	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6027	NC_006449	CAT	2	6	1612377	1612382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6028	NC_006449	AG	3	6	1612396	1612401	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6029	NC_006449	TCAG	2	8	1612451	1612458	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6030	NC_006449	TC	3	6	1612512	1612517	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6031	NC_006449	CTA	2	6	1612624	1612629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6032	NC_006449	TTAG	2	8	1612724	1612731	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6033	NC_006449	TA	3	6	1612753	1612758	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6034	NC_006449	TGT	2	6	1612781	1612786	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6035	NC_006449	TC	3	6	1612807	1612812	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6036	NC_006449	CTC	2	6	1612937	1612942	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6037	NC_006449	CTT	2	6	1612952	1612957	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6038	NC_006449	TGAA	2	8	1613077	1613084	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6039	NC_006449	GCT	2	6	1613087	1613092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6040	NC_006449	AT	3	6	1613146	1613151	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6041	NC_006449	TGG	2	6	1613166	1613171	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6042	NC_006449	GA	3	6	1613346	1613351	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6043	NC_006449	TCC	2	6	1613432	1613437	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6044	NC_006449	CAT	2	6	1613565	1613570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6045	NC_006449	TTG	2	6	1613631	1613636	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6046	NC_006449	CTCCC	2	10	1613665	1613674	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
6047	NC_006449	AG	3	6	1613724	1613729	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6048	NC_006449	TCC	2	6	1613750	1613755	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6049	NC_006449	CGA	2	6	1613763	1613768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6050	NC_006449	CT	3	6	1613838	1613843	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6051	NC_006449	TTC	2	6	1613865	1613870	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6052	NC_006449	TCGC	2	8	1613943	1613950	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6053	NC_006449	CTA	2	6	1613953	1613958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6054	NC_006449	TCG	2	6	1614123	1614128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6055	NC_006449	TTA	2	6	1614180	1614185	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6056	NC_006449	CTAT	2	8	1614258	1614265	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6057	NC_006449	TTAC	2	8	1614272	1614279	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6058	NC_006449	CCT	2	6	1614368	1614373	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6059	NC_006449	AGG	2	6	1614470	1614475	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6060	NC_006449	ATC	2	6	1614526	1614531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6061	NC_006449	GGC	2	6	1614544	1614549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6062	NC_006449	GTG	2	6	1614596	1614601	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6063	NC_006449	GT	3	6	1614611	1614616	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6064	NC_006449	TCG	2	6	1614735	1614740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6065	NC_006449	ACCA	2	8	1614763	1614770	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6066	NC_006449	GT	3	6	1614780	1614785	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6067	NC_006449	ATG	2	6	1614805	1614810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6069	NC_006449	TTA	2	6	1614840	1614845	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6070	NC_006449	ATG	2	6	1614875	1614880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6071	NC_006449	CACGA	2	10	1614930	1614939	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
6072	NC_006449	GAC	2	6	1614943	1614948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6073	NC_006449	CAC	2	6	1614956	1614961	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6074	NC_006449	TTC	2	6	1615031	1615036	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6075	NC_006449	AG	3	6	1615270	1615275	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6076	NC_006449	TCC	2	6	1615295	1615300	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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6081	NC_006449	CTG	2	6	1615653	1615658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6082	NC_006449	TCG	2	6	1615728	1615733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6083	NC_006449	CTA	2	6	1615756	1615761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6085	NC_006449	AAG	2	6	1615923	1615928	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6089	NC_006449	CGT	2	6	1616049	1616054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6091	NC_006449	CT	3	6	1616145	1616150	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6092	NC_006449	T	6	6	1616198	1616203	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6093	NC_006449	T	6	6	1616208	1616213	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6094	NC_006449	TTC	2	6	1616217	1616222	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6096	NC_006449	TTAT	2	8	1616249	1616256	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6097	NC_006449	ATC	2	6	1616260	1616265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6098	NC_006449	CTT	2	6	1616267	1616272	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6099	NC_006449	T	6	6	1616288	1616293	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6100	NC_006449	ATACA	2	10	1616396	1616405	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
6101	NC_006449	GAAC	2	8	1616457	1616464	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6102	NC_006449	CAT	2	6	1616494	1616499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6103	NC_006449	TCATCG	2	12	1616514	1616525	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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6105	NC_006449	TAA	2	6	1616604	1616609	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6106	NC_006449	ATA	2	6	1616619	1616624	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6107	NC_006449	AAGA	2	8	1616689	1616696	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
6108	NC_006449	A	7	7	1616696	1616702	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6109	NC_006449	TAAA	2	8	1616722	1616729	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6110	NC_006449	T	6	6	1617913	1617918	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6111	NC_006449	AGCG	2	8	1617919	1617926	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6112	NC_006449	CT	3	6	1617977	1617982	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6113	NC_006449	TCA	2	6	1618016	1618021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6114	NC_006449	CAC	2	6	1618086	1618091	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6115	NC_006449	TCC	2	6	1618606	1618611	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6116	NC_006449	TAAT	2	8	1618622	1618629	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6117	NC_006449	GGA	2	6	1618665	1618670	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6118	NC_006449	ACA	2	6	1618733	1618738	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6119	NC_006449	A	6	6	1618738	1618743	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6120	NC_006449	CCT	2	6	1618923	1618928	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6121	NC_006449	ATT	2	6	1618986	1618991	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6122	NC_006449	ATT	2	6	1619031	1619036	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6123	NC_006449	TA	3	6	1619120	1619125	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6124	NC_006449	CTC	2	6	1619138	1619143	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6125	NC_006449	T	6	6	1619202	1619207	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6126	NC_006449	CTCA	2	8	1619215	1619222	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6127	NC_006449	A	6	6	1619323	1619328	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6128	NC_006449	TAT	2	6	1619338	1619343	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6129	NC_006449	TCT	2	6	1619421	1619426	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6130	NC_006449	T	7	7	1619516	1619522	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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