MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Streptococcus thermophilus LMG 18311 chromosome

Total Repeats: 6711

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006448	T	7	7	22	28	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_006448	T	7	7	75	81	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_006448	ACT	2	6	1563	1568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_006448	CTA	5	15	1661	1675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_006448	ATA	2	6	1678	1683	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_006448	TAA	2	6	1685	1690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_006448	T	6	6	2870	2875	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_006448	AGG	2	6	2880	2885	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_006448	CTA	2	6	3107	3112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_006448	A	6	6	4417	4422	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_006448	TAAG	2	8	8561	8568	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_006448	TA	3	6	8573	8578	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_006448	CTTTT	2	10	8597	8606	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_006448	A	8	8	8686	8693	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_006448	AGA	2	6	8703	8708	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_006448	GGAAA	2	10	8720	8729	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
17	NC_006448	T	7	7	9396	9402	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_006448	A	7	7	9438	9444	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_006448	GAA	2	6	9484	9489	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_006448	GAT	2	6	12076	12081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_006448	TAA	2	6	12098	12103	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_006448	AGA	2	6	14936	14941	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_006448	TTC	2	6	14948	14953	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_006448	ATG	2	6	15910	15915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_006448	TTCT	2	8	15969	15976	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_006448	ATG	2	6	15978	15983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_006448	TGAT	2	8	16260	16267	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_006448	A	6	6	16293	16298	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_006448	ATT	2	6	16311	16316	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_006448	GTG	2	6	16326	16331	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_006448	A	7	7	16361	16367	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_006448	TTG	2	6	16379	16384	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_006448	GAA	2	6	16440	16445	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_006448	AGC	2	6	16916	16921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_006448	CAGT	2	8	17438	17445	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
36	NC_006448	T	6	6	17461	17466	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_006448	TAA	2	6	17499	17504	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_006448	A	6	6	17506	17511	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_006448	TTA	2	6	17512	17517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_006448	A	6	6	17517	17522	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_006448	AAG	2	6	17559	17564	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_006448	GAT	2	6	17566	17571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_006448	GA	3	6	17593	17598	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_006448	GAA	2	6	17609	17614	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_006448	A	7	7	17618	17624	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_006448	A	7	7	17629	17635	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_006448	AG	3	6	17683	17688	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_006448	AGA	2	6	17737	17742	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_006448	GAC	2	6	17778	17783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_006448	ATT	2	6	17807	17812	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_006448	GGC	2	6	17855	17860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_006448	AG	3	6	17890	17895	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_006448	CTT	2	6	17905	17910	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_006448	ATTT	2	8	18017	18024	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_006448	TAG	2	6	18072	18077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_006448	CGA	2	6	18100	18105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_006448	GCA	2	6	18174	18179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_006448	CGC	2	6	18221	18226	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_006448	GTGA	2	8	18227	18234	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_006448	TGT	2	6	18260	18265	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_006448	CAG	2	6	18343	18348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_006448	AGCG	2	8	18398	18405	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
63	NC_006448	AT	3	6	18527	18532	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_006448	GGA	2	6	18533	18538	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_006448	CT	3	6	18558	18563	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_006448	GAA	2	6	18797	18802	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_006448	GGT	2	6	18871	18876	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_006448	GTC	2	6	18885	18890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_006448	TCGTG	2	10	18894	18903	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
70	NC_006448	CAT	2	6	18953	18958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_006448	TAA	2	6	18988	18993	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_006448	GGA	2	6	18997	19002	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_006448	ATC	2	6	19021	19026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_006448	AC	3	6	19048	19053	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_006448	TGGT	2	8	19063	19070	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_006448	GAC	2	6	19091	19096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_006448	CGC	2	6	19187	19192	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_006448	AC	3	6	19217	19222	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_006448	CAC	2	6	19232	19237	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_006448	AGCC	2	8	19279	19286	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
81	NC_006448	GAT	2	6	19302	19307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_006448	CCT	2	6	19358	19363	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_006448	AGG	2	6	19460	19465	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_006448	GTAA	2	8	19554	19561	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_006448	ATAG	2	8	19568	19575	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_006448	GTTAA	2	10	19641	19650	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
87	NC_006448	ACG	2	6	19704	19709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_006448	TAG	2	6	19875	19880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_006448	GCGA	2	8	19883	19890	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
90	NC_006448	AGA	2	6	19962	19967	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_006448	AG	3	6	19990	19995	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_006448	TCG	2	6	20065	20070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_006448	GGA	2	6	20078	20083	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_006448	CT	3	6	20104	20109	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_006448	GGGAG	2	10	20159	20168	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
96	NC_006448	ACA	2	6	20196	20201	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_006448	ATG	2	6	20263	20268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_006448	GGA	2	6	20396	20401	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_006448	TC	3	6	20482	20487	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_006448	ACC	2	6	20661	20666	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
101	NC_006448	AT	3	6	20682	20687	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_006448	AGC	2	6	20741	20746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_006448	ATTC	2	8	20748	20755	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
104	NC_006448	GAA	2	6	20875	20880	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_006448	GAG	2	6	20891	20896	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_006448	GA	3	6	21021	21026	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_006448	ACA	2	6	21047	21052	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_006448	TA	3	6	21075	21080	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_006448	CTAA	2	8	21102	21109	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
110	NC_006448	TAG	2	6	21204	21209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_006448	GA	3	6	21316	21321	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_006448	CTGA	2	8	21375	21382	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
113	NC_006448	CT	3	6	21432	21437	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_006448	GAT	2	6	21450	21455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_006448	CGG	2	6	21541	21546	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_006448	GA	3	6	21639	21644	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_006448	TAGG	2	8	21757	21764	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_006448	GTT	2	6	21801	21806	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_006448	TAC	2	6	21811	21816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_006448	CCT	2	6	21899	21904	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
121	NC_006448	GGT	2	6	22035	22040	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_006448	TCG	2	6	22150	22155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_006448	CGT	2	6	22230	22235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_006448	GTT	2	6	22333	22338	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_006448	AGGGA	2	10	22368	22377	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
126	NC_006448	GA	3	6	22454	22459	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_006448	GAAGTG	2	12	22479	22490	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_006448	ACTAAT	2	12	22509	22520	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_006448	AT	3	6	22554	22559	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_006448	TTGAG	2	10	22602	22611	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
131	NC_006448	GTG	2	6	22825	22830	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
132	NC_006448	AT	3	6	22983	22988	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_006448	A	6	6	23075	23080	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_006448	ACC	2	6	23188	23193	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
135	NC_006448	CGT	2	6	23225	23230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_006448	GAG	2	6	23237	23242	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
137	NC_006448	TAA	3	9	23333	23341	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_006448	CTC	2	6	23401	23406	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
139	NC_006448	CGC	2	6	23568	23573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
140	NC_006448	TA	3	6	23574	23579	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_006448	AT	3	6	23663	23668	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_006448	GGA	2	6	23683	23688	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
143	NC_006448	GCGT	2	8	23742	23749	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
144	NC_006448	TCC	2	6	23766	23771	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
145	NC_006448	AGC	2	6	23792	23797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_006448	TCG	2	6	23806	23811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_006448	CGG	2	6	23906	23911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_006448	TGT	2	6	23935	23940	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
149	NC_006448	TGT	2	6	23983	23988	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
150	NC_006448	GGT	2	6	24097	24102	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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