MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Streptococcus pyogenes MGAS10394 chromosome

Total Repeats: 6029

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_006086	AGT	2	6	114554	114559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
502	NC_006086	A	7	7	114670	114676	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
503	NC_006086	ATC	2	6	116507	116512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
504	NC_006086	TTG	2	6	116523	116528	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
505	NC_006086	AAT	2	6	116554	116559	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
506	NC_006086	CTA	2	6	116563	116568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
507	NC_006086	TATT	2	8	116571	116578	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
508	NC_006086	AGG	2	6	116586	116591	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
509	NC_006086	AAT	2	6	117566	117571	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
510	NC_006086	AAT	2	6	117575	117580	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
511	NC_006086	AGG	2	6	118099	118104	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
512	NC_006086	GTTTC	2	10	118519	118528	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
513	NC_006086	AGG	2	6	119484	119489	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
514	NC_006086	TTG	2	6	119894	119899	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
515	NC_006086	ATG	3	9	119906	119914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
516	NC_006086	GA	3	6	119923	119928	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
517	NC_006086	TCA	2	6	119982	119987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
518	NC_006086	TGT	2	6	120058	120063	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
519	NC_006086	C	6	6	120076	120081	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
520	NC_006086	A	7	7	120243	120249	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_006086	TAA	2	6	120312	120317	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
522	NC_006086	T	6	6	120358	120363	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
523	NC_006086	CAA	2	6	120395	120400	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
524	NC_006086	A	6	6	120407	120412	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_006086	A	7	7	120417	120423	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
526	NC_006086	A	7	7	120426	120432	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
527	NC_006086	TAA	2	6	120465	120470	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
528	NC_006086	AAAT	2	8	120654	120661	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
529	NC_006086	AG	3	6	120705	120710	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
530	NC_006086	GGC	2	6	120737	120742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
531	NC_006086	ACCT	2	8	120828	120835	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
532	NC_006086	AG	3	6	120880	120885	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
533	NC_006086	CGA	2	6	120982	120987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
534	NC_006086	GCA	2	6	121056	121061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
535	NC_006086	CGC	2	6	121103	121108	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
536	NC_006086	GTGA	2	8	121109	121116	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
537	NC_006086	TGT	2	6	121142	121147	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
538	NC_006086	AGA	2	6	121151	121156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
539	NC_006086	ATG	2	6	121157	121162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
540	NC_006086	CCA	2	6	121178	121183	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
541	NC_006086	TAAC	2	8	121192	121199	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
542	NC_006086	CAG	2	6	121225	121230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
543	NC_006086	AGCG	2	8	121280	121287	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
544	NC_006086	T	6	6	121295	121300	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
545	NC_006086	AT	3	6	121409	121414	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
546	NC_006086	GGA	2	6	121415	121420	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
547	NC_006086	CT	3	6	121440	121445	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
548	NC_006086	GAA	2	6	121679	121684	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
549	NC_006086	GGT	2	6	121753	121758	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
550	NC_006086	GTC	2	6	121767	121772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
551	NC_006086	TCGTG	2	10	121776	121785	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
552	NC_006086	CAT	2	6	121835	121840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
553	NC_006086	TAA	2	6	121870	121875	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
554	NC_006086	GGA	2	6	121879	121884	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
555	NC_006086	ATC	2	6	121903	121908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
556	NC_006086	AC	3	6	121930	121935	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
557	NC_006086	TGGT	2	8	121945	121952	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
558	NC_006086	CGC	2	6	122069	122074	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
559	NC_006086	AC	3	6	122099	122104	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
560	NC_006086	CAC	2	6	122114	122119	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
561	NC_006086	AGCC	2	8	122162	122169	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
562	NC_006086	GAT	2	6	122185	122190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
563	NC_006086	CCT	2	6	122241	122246	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
564	NC_006086	AGG	2	6	122340	122345	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
565	NC_006086	CTA	2	6	122386	122391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
566	NC_006086	CA	3	6	122465	122470	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
567	NC_006086	AGCG	2	8	122508	122515	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
568	NC_006086	TA	3	6	122529	122534	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
569	NC_006086	ATT	2	6	122628	122633	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
570	NC_006086	TAA	2	6	122634	122639	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
571	NC_006086	A	7	7	122652	122658	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
572	NC_006086	TAA	2	6	122665	122670	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
573	NC_006086	GTTAA	2	10	122672	122681	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
574	NC_006086	GAA	2	6	122718	122723	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
575	NC_006086	ACG	2	6	122735	122740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
576	NC_006086	GTAA	2	8	122758	122765	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
577	NC_006086	ACTA	2	8	122800	122807	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
578	NC_006086	GAAG	2	8	122840	122847	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
579	NC_006086	TAG	2	6	122906	122911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
580	NC_006086	GCGA	2	8	122914	122921	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
581	NC_006086	AGG	2	6	122928	122933	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
582	NC_006086	AGA	2	6	122994	122999	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
583	NC_006086	AG	3	6	123022	123027	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
584	NC_006086	GGA	2	6	123110	123115	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
585	NC_006086	CT	3	6	123136	123141	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
586	NC_006086	GGGAG	2	10	123191	123200	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
587	NC_006086	ACA	2	6	123228	123233	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
588	NC_006086	ATG	2	6	123295	123300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
589	NC_006086	TGT	2	6	123365	123370	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
590	NC_006086	GGA	2	6	123428	123433	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
591	NC_006086	TC	3	6	123514	123519	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
592	NC_006086	ATC	2	6	123635	123640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
593	NC_006086	ACC	2	6	123693	123698	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
594	NC_006086	AGC	2	6	123773	123778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
595	NC_006086	ATTC	2	8	123780	123787	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
596	NC_006086	TG	3	6	123904	123909	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
597	NC_006086	AAG	2	6	123910	123915	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
598	NC_006086	GAG	2	6	123925	123930	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
599	NC_006086	GA	3	6	124055	124060	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
600	NC_006086	TA	3	6	124109	124114	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
601	NC_006086	CTAA	2	8	124136	124143	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
602	NC_006086	TAG	2	6	124238	124243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
603	NC_006086	GA	3	6	124351	124356	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
604	NC_006086	CT	3	6	124466	124471	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
605	NC_006086	GAT	2	6	124484	124489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
606	NC_006086	AGG	2	6	124529	124534	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
607	NC_006086	CGG	2	6	124575	124580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
608	NC_006086	GA	3	6	124673	124678	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
609	NC_006086	TAGG	2	8	124791	124798	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
610	NC_006086	GTT	2	6	124835	124840	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
611	NC_006086	TAC	2	6	124845	124850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
612	NC_006086	CCT	2	6	124933	124938	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
613	NC_006086	TTGG	2	8	124974	124981	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
614	NC_006086	AATC	2	8	124983	124990	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
615	NC_006086	GGT	2	6	125069	125074	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
616	NC_006086	TCG	2	6	125184	125189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
617	NC_006086	CGT	2	6	125264	125269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
618	NC_006086	AGGGA	2	10	125402	125411	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
619	NC_006086	C	6	6	125440	125445	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
620	NC_006086	GA	3	6	125488	125493	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
621	NC_006086	AGTGTA	2	12	125515	125526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
622	NC_006086	ACTAAT	2	12	125543	125554	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
623	NC_006086	CAG	2	6	125705	125710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
624	NC_006086	GCTTA	2	10	125768	125777	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
625	NC_006086	AC	3	6	125781	125786	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
626	NC_006086	TGT	2	6	125909	125914	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
627	NC_006086	TAA	2	6	125963	125968	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
628	NC_006086	GGT	2	6	125989	125994	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
629	NC_006086	GGT	2	6	126024	126029	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
630	NC_006086	ATTAT	2	10	126058	126067	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
631	NC_006086	CGG	2	6	126108	126113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
632	NC_006086	TATAT	2	10	126141	126150	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
633	NC_006086	GGA	2	6	126153	126158	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
634	NC_006086	GCGT	2	8	126212	126219	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
635	NC_006086	TCC	2	6	126236	126241	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
636	NC_006086	TCG	2	6	126276	126281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
637	NC_006086	GTT	2	6	126340	126345	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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639	NC_006086	CGG	2	6	126463	126468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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