MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Streptococcus pyogenes MGAS10394 chromosome

Total Repeats: 6029

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_006086	TACACT	2	12	1626184	1626195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5002	NC_006086	ATC	2	6	1626213	1626218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5003	NC_006086	TC	3	6	1626217	1626222	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5004	NC_006086	G	6	6	1626265	1626270	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5005	NC_006086	TCCCT	2	10	1626299	1626308	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
5006	NC_006086	ACG	2	6	1626441	1626446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5007	NC_006086	CGA	2	6	1626521	1626526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5008	NC_006086	ACC	2	6	1626636	1626641	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5009	NC_006086	GATT	2	8	1626720	1626727	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5010	NC_006086	CCAA	2	8	1626729	1626736	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5011	NC_006086	AGG	2	6	1626772	1626777	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5012	NC_006086	GTA	2	6	1626860	1626865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5013	NC_006086	CAA	2	6	1626869	1626874	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5014	NC_006086	CCTA	2	8	1626912	1626919	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5015	NC_006086	TC	3	6	1627032	1627037	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5016	NC_006086	GCC	2	6	1627129	1627134	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5017	NC_006086	CTC	2	6	1627177	1627182	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5018	NC_006086	CAT	2	6	1627220	1627225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5019	NC_006086	AG	3	6	1627239	1627244	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5020	NC_006086	TC	3	6	1627354	1627359	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5021	NC_006086	CTA	2	6	1627467	1627472	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5022	NC_006086	TTAG	2	8	1627567	1627574	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5023	NC_006086	TA	3	6	1627596	1627601	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5024	NC_006086	TC	3	6	1627650	1627655	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5025	NC_006086	CTC	2	6	1627780	1627785	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5026	NC_006086	CTT	2	6	1627795	1627800	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5027	NC_006086	CA	3	6	1627801	1627806	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5028	NC_006086	TGAA	2	8	1627922	1627929	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5029	NC_006086	GCT	2	6	1627932	1627937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5030	NC_006086	TGG	2	6	1628011	1628016	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5031	NC_006086	GAT	2	6	1628070	1628075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5032	NC_006086	GA	3	6	1628191	1628196	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5033	NC_006086	TCC	2	6	1628277	1628282	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5034	NC_006086	ACA	2	6	1628340	1628345	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5035	NC_006086	CAT	2	6	1628410	1628415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5036	NC_006086	TTG	2	6	1628476	1628481	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5037	NC_006086	CTCCC	2	10	1628510	1628519	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
5038	NC_006086	AG	3	6	1628569	1628574	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5039	NC_006086	TCC	2	6	1628595	1628600	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5040	NC_006086	CT	3	6	1628683	1628688	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5041	NC_006086	TTC	2	6	1628710	1628715	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5042	NC_006086	CCT	2	6	1628777	1628782	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5043	NC_006086	TCGC	2	8	1628789	1628796	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5044	NC_006086	CTA	2	6	1628799	1628804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5045	NC_006086	CTTC	2	8	1628863	1628870	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5046	NC_006086	TTAG	2	8	1628902	1628909	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5047	NC_006086	CTTA	2	8	1628944	1628951	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5048	NC_006086	TCG	2	6	1628969	1628974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5049	NC_006086	CTT	2	6	1628986	1628991	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5050	NC_006086	TTA	2	6	1629026	1629031	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5051	NC_006086	TTA	2	6	1629040	1629045	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5052	NC_006086	T	7	7	1629052	1629058	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5053	NC_006086	TTA	2	6	1629071	1629076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5054	NC_006086	AAT	2	6	1629077	1629082	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5055	NC_006086	TAT	2	6	1629173	1629178	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5056	NC_006086	CGCT	2	8	1629195	1629202	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5057	NC_006086	TG	3	6	1629240	1629245	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5058	NC_006086	TAG	2	6	1629319	1629324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5060	NC_006086	AGG	2	6	1629464	1629469	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5061	NC_006086	ATC	2	6	1629520	1629525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5062	NC_006086	GGC	2	6	1629538	1629543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5063	NC_006086	GTG	2	6	1629591	1629596	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5064	NC_006086	GT	3	6	1629606	1629611	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5065	NC_006086	ACCA	2	8	1629758	1629765	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5066	NC_006086	GT	3	6	1629775	1629780	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5067	NC_006086	ATG	2	6	1629800	1629805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5069	NC_006086	TTA	2	6	1629835	1629840	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5070	NC_006086	ATG	2	6	1629870	1629875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5071	NC_006086	CACGA	2	10	1629925	1629934	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
5072	NC_006086	GAC	2	6	1629938	1629943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5074	NC_006086	TTC	2	6	1630026	1630031	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5076	NC_006086	TCC	2	6	1630290	1630295	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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5078	NC_006086	A	6	6	1630410	1630415	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5081	NC_006086	TGG	2	6	1630527	1630532	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5082	NC_006086	CAT	2	6	1630548	1630553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5085	NC_006086	CTT	2	6	1630589	1630594	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5086	NC_006086	CTG	2	6	1630648	1630653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5087	NC_006086	TCG	2	6	1630723	1630728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5088	NC_006086	TC	3	6	1630824	1630829	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5089	NC_006086	AGGT	2	8	1630875	1630882	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5090	NC_006086	CGC	2	6	1630967	1630972	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5091	NC_006086	CT	3	6	1631000	1631005	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5092	NC_006086	ATTT	2	8	1631049	1631056	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5093	NC_006086	TTA	2	6	1631240	1631245	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5094	NC_006086	T	7	7	1631278	1631284	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5095	NC_006086	AGTT	2	8	1631319	1631326	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5096	NC_006086	CTT	2	6	1631337	1631342	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5097	NC_006086	AATG	2	8	1631365	1631372	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5098	NC_006086	T	6	6	1632557	1632562	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5099	NC_006086	TTA	2	6	1632601	1632606	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5100	NC_006086	TTC	2	6	1632609	1632614	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5101	NC_006086	ATT	2	6	1632622	1632627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5102	NC_006086	A	7	7	1632722	1632728	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5103	NC_006086	ATA	2	6	1632784	1632789	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5105	NC_006086	A	7	7	1638618	1638624	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5106	NC_006086	CAC	2	6	1638625	1638630	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5107	NC_006086	GAT	2	6	1638635	1638640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5108	NC_006086	TAC	2	6	1638641	1638646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5109	NC_006086	TTTA	2	8	1638655	1638662	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5110	NC_006086	AGT	2	6	1638669	1638674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5111	NC_006086	CTT	2	6	1638710	1638715	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5112	NC_006086	ATC	2	6	1638736	1638741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5113	NC_006086	TTTA	2	8	1638769	1638776	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5114	NC_006086	ATT	2	6	1641314	1641319	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5115	NC_006086	GTTAAA	2	12	1641329	1641340	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5116	NC_006086	AT	3	6	1644502	1644507	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5117	NC_006086	ACT	2	6	1646169	1646174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5118	NC_006086	ATA	2	6	1646445	1646450	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5119	NC_006086	T	6	6	1646489	1646494	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5120	NC_006086	T	6	6	1646499	1646504	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5121	NC_006086	A	7	7	1646564	1646570	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5122	NC_006086	TTACT	2	10	1646646	1646655	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
5123	NC_006086	TCAGG	2	10	1646663	1646672	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
5124	NC_006086	TAAA	2	8	1646712	1646719	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5125	NC_006086	TCA	2	6	1646737	1646742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5126	NC_006086	ATA	2	6	1646797	1646802	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5127	NC_006086	CAT	2	6	1646823	1646828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5128	NC_006086	GTA	2	6	1646869	1646874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5129	NC_006086	AAG	2	6	1646886	1646891	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5130	NC_006086	TTTCA	2	10	1648327	1648336	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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5132	NC_006086	AAT	2	6	1650412	1650417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5401	NC_006086	A	7	7	1733180	1733186	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5402	NC_006086	ATT	2	6	1733214	1733219	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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