MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shigella flexneri 2a str. 2457T

Total Repeats: 21274

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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16002	NC_004741	ACG	2	6	3415523	3415528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16003	NC_004741	AGT	2	6	3415564	3415569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16004	NC_004741	TAA	2	6	3415575	3415580	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16005	NC_004741	AGA	2	6	3415692	3415697	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16006	NC_004741	CGC	2	6	3417404	3417409	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16007	NC_004741	GAG	2	6	3417458	3417463	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16008	NC_004741	GTT	2	6	3417584	3417589	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16009	NC_004741	ATTA	2	8	3417609	3417616	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16010	NC_004741	T	6	6	3417623	3417628	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16011	NC_004741	ATTC	2	8	3417686	3417693	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
16012	NC_004741	CCCG	2	8	3417764	3417771	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
16013	NC_004741	CATT	2	8	3417793	3417800	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
16014	NC_004741	A	6	6	3417822	3417827	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16015	NC_004741	GT	3	6	3421743	3421748	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16016	NC_004741	CAT	2	6	3421819	3421824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16017	NC_004741	CAG	2	6	3421863	3421868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16018	NC_004741	GAA	2	6	3421893	3421898	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16019	NC_004741	AGC	2	6	3421918	3421923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16020	NC_004741	ACC	2	6	3421943	3421948	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16021	NC_004741	TGG	2	6	3422007	3422012	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16022	NC_004741	GCC	2	6	3422079	3422084	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16023	NC_004741	GGTA	2	8	3422108	3422115	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
16024	NC_004741	TGG	2	6	3422126	3422131	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16025	NC_004741	GC	3	6	3422134	3422139	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16026	NC_004741	A	6	6	3422169	3422174	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16027	NC_004741	AGG	2	6	3422225	3422230	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16028	NC_004741	CT	3	6	3422247	3422252	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16029	NC_004741	CG	3	6	3422257	3422262	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16030	NC_004741	TGT	2	6	3422708	3422713	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16031	NC_004741	T	6	6	3424246	3424251	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16032	NC_004741	TGA	2	6	3424309	3424314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16033	NC_004741	ATA	2	6	3424385	3424390	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16034	NC_004741	ATG	2	6	3424397	3424402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16035	NC_004741	GAAA	2	8	3424438	3424445	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
16036	NC_004741	A	7	7	3424443	3424449	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16037	NC_004741	AAT	2	6	3424469	3424474	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16038	NC_004741	AAC	2	6	3424528	3424533	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16039	NC_004741	CAC	2	6	3424549	3424554	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16040	NC_004741	ACA	2	6	3427036	3427041	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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16042	NC_004741	TCC	2	6	3428412	3428417	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16043	NC_004741	TG	3	6	3428443	3428448	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16044	NC_004741	GCAA	2	8	3428509	3428516	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
16045	NC_004741	TCC	2	6	3428571	3428576	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16046	NC_004741	CCT	2	6	3428579	3428584	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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16048	NC_004741	GGA	2	6	3428608	3428613	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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16051	NC_004741	GTT	2	6	3428674	3428679	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16052	NC_004741	A	6	6	3429852	3429857	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16053	NC_004741	ATG	2	6	3429883	3429888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16054	NC_004741	CGC	2	6	3431254	3431259	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16055	NC_004741	GC	3	6	3431325	3431330	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16056	NC_004741	AATGAA	2	12	3431374	3431385	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16057	NC_004741	T	7	7	3432348	3432354	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16058	NC_004741	CTTC	2	8	3432358	3432365	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16059	NC_004741	T	6	6	3432381	3432386	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16060	NC_004741	ACTTC	2	10	3432392	3432401	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
16061	NC_004741	TTC	3	9	3432399	3432407	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16062	NC_004741	ATT	2	6	3432421	3432426	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16063	NC_004741	TTATT	2	10	3432495	3432504	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
16064	NC_004741	GGC	2	6	3432548	3432553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16065	NC_004741	TGA	2	6	3432564	3432569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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16067	NC_004741	ATA	2	6	3432591	3432596	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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16069	NC_004741	TAC	2	6	3432612	3432617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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16071	NC_004741	AT	3	6	3432672	3432677	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16072	NC_004741	AAC	2	6	3432690	3432695	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16073	NC_004741	A	7	7	3432702	3432708	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16074	NC_004741	AATA	2	8	3432715	3432722	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16075	NC_004741	A	6	6	3432780	3432785	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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16081	NC_004741	TCTG	2	8	3433186	3433193	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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16085	NC_004741	TGAT	2	8	3433368	3433375	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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16089	NC_004741	TA	3	6	3433532	3433537	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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16092	NC_004741	T	7	7	3433675	3433681	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16093	NC_004741	GAT	2	6	3433715	3433720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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16098	NC_004741	GAT	2	6	3433874	3433879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16099	NC_004741	TGG	2	6	3433890	3433895	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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16109	NC_004741	TA	3	6	3438894	3438899	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16110	NC_004741	TA	3	6	3438915	3438920	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16111	NC_004741	CAA	2	6	3438957	3438962	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16112	NC_004741	GTTT	2	8	3439581	3439588	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
16113	NC_004741	TC	3	6	3439593	3439598	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16114	NC_004741	TCA	2	6	3439600	3439605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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16122	NC_004741	TATT	2	8	3442019	3442026	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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16124	NC_004741	A	6	6	3442124	3442129	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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16126	NC_004741	TAA	2	6	3442177	3442182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16127	NC_004741	ATA	2	6	3442236	3442241	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16128	NC_004741	TCAA	2	8	3442247	3442254	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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16130	NC_004741	AT	4	8	3442269	3442276	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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