MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. Ty2 chromosome

Total Repeats: 17242

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_004631	TC	3	6	903875	903880	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3002	NC_004631	GCA	2	6	903887	903892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3003	NC_004631	CAT	2	6	903960	903965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3004	NC_004631	AGC	2	6	903991	903996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3005	NC_004631	GGC	2	6	904203	904208	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3006	NC_004631	GTT	2	6	904209	904214	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3007	NC_004631	GCT	2	6	904250	904255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3008	NC_004631	ATA	2	6	904257	904262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3009	NC_004631	TGG	2	6	904306	904311	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3010	NC_004631	A	7	7	904314	904320	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3011	NC_004631	G	7	7	904371	904377	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3012	NC_004631	ATT	2	6	904532	904537	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3013	NC_004631	ATCC	2	8	904555	904562	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3014	NC_004631	TGA	2	6	904649	904654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3015	NC_004631	AG	3	6	904682	904687	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3016	NC_004631	T	6	6	904713	904718	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3017	NC_004631	TGT	2	6	904721	904726	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3018	NC_004631	TGT	3	9	904743	904751	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3019	NC_004631	GTA	2	6	904752	904757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3020	NC_004631	TTCA	2	8	904777	904784	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3021	NC_004631	AT	3	6	904872	904877	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3022	NC_004631	TTTGAA	2	12	904892	904903	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3023	NC_004631	TAA	2	6	904917	904922	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3024	NC_004631	TGA	2	6	905080	905085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3025	NC_004631	GAGG	2	8	905110	905117	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
3026	NC_004631	TGG	2	6	905125	905130	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3027	NC_004631	TGAT	2	8	905227	905234	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3028	NC_004631	TGC	2	6	905257	905262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3029	NC_004631	TCT	3	9	905279	905287	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3030	NC_004631	TAT	2	6	905307	905312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3031	NC_004631	T	6	6	905360	905365	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3032	NC_004631	T	6	6	905390	905395	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3033	NC_004631	ATGC	2	8	905453	905460	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3034	NC_004631	TTAA	2	8	905521	905528	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3035	NC_004631	T	6	6	905529	905534	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3036	NC_004631	TAG	2	6	905549	905554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3037	NC_004631	AATT	2	8	905558	905565	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3038	NC_004631	TGA	2	6	905571	905576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3039	NC_004631	CAT	2	6	905602	905607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3040	NC_004631	TTTC	2	8	905703	905710	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3041	NC_004631	TCA	2	6	905728	905733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3042	NC_004631	AG	3	6	905784	905789	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3043	NC_004631	CGGGT	2	10	905790	905799	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
3044	NC_004631	TCG	2	6	905874	905879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3045	NC_004631	AAT	2	6	905941	905946	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3046	NC_004631	ATT	2	6	905962	905967	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3047	NC_004631	GTT	2	6	906009	906014	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3048	NC_004631	CTG	2	6	906023	906028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3049	NC_004631	ATT	2	6	906029	906034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3050	NC_004631	TAAAA	2	10	906078	906087	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3051	NC_004631	AAC	2	6	906116	906121	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3052	NC_004631	ATA	2	6	906153	906158	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3053	NC_004631	TAA	2	6	906187	906192	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3054	NC_004631	AGG	2	6	906194	906199	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3055	NC_004631	ATAAA	2	10	909843	909852	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3056	NC_004631	TGTT	2	8	909901	909908	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3057	NC_004631	GTTT	2	8	909974	909981	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3058	NC_004631	CTT	2	6	909989	909994	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3059	NC_004631	GCCA	2	8	910056	910063	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3060	NC_004631	CCG	2	6	910115	910120	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3061	NC_004631	CGT	2	6	910176	910181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3062	NC_004631	CTC	2	6	910275	910280	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3063	NC_004631	AAG	2	6	910295	910300	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3064	NC_004631	TG	3	6	910363	910368	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3065	NC_004631	CGGG	2	8	910388	910395	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3066	NC_004631	GAT	2	6	910413	910418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3067	NC_004631	A	6	6	910432	910437	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3068	NC_004631	ACA	2	6	910491	910496	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3069	NC_004631	ATT	2	6	910534	910539	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3070	NC_004631	CA	3	6	910599	910604	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3071	NC_004631	AC	3	6	910665	910670	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3072	NC_004631	CGG	2	6	910700	910705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3073	NC_004631	CGT	2	6	910731	910736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3074	NC_004631	A	6	6	910837	910842	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3075	NC_004631	AGCG	2	8	910849	910856	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3076	NC_004631	AAAGA	2	10	910873	910882	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
3077	NC_004631	CGC	2	6	910989	910994	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3078	NC_004631	TC	3	6	911093	911098	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3079	NC_004631	CA	3	6	911139	911144	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3080	NC_004631	GCA	2	6	911276	911281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3081	NC_004631	CGGA	2	8	911775	911782	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3082	NC_004631	TCCG	2	8	911791	911798	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3083	NC_004631	T	6	6	911837	911842	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3084	NC_004631	TGAA	2	8	912939	912946	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3085	NC_004631	TGC	2	6	912952	912957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3086	NC_004631	TCT	2	6	913073	913078	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3087	NC_004631	GGC	2	6	913079	913084	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3088	NC_004631	CGAATC	2	12	913136	913147	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
3089	NC_004631	TTA	2	6	914460	914465	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3090	NC_004631	CGT	2	6	914484	914489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3091	NC_004631	GGC	2	6	918406	918411	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3092	NC_004631	A	6	6	922011	922016	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3093	NC_004631	GCC	2	6	922033	922038	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3094	NC_004631	CAG	3	9	922147	922155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3095	NC_004631	AAG	2	6	922169	922174	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3096	NC_004631	TCG	2	6	926316	926321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3097	NC_004631	TTG	2	6	926339	926344	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3098	NC_004631	TAC	2	6	926370	926375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3099	NC_004631	AGCC	2	8	926421	926428	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3100	NC_004631	TCAC	2	8	926462	926469	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3101	NC_004631	GCC	2	6	926472	926477	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3102	NC_004631	TC	3	6	930118	930123	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3103	NC_004631	TGT	2	6	930153	930158	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3104	NC_004631	CCA	2	6	930202	930207	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3105	NC_004631	TGC	2	6	930214	930219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3106	NC_004631	AAG	2	6	930543	930548	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3107	NC_004631	AAT	2	6	930592	930597	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3108	NC_004631	ATTTA	2	10	930653	930662	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3109	NC_004631	ATT	2	6	930677	930682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3110	NC_004631	TAT	2	6	930690	930695	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3111	NC_004631	TAT	2	6	930803	930808	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3112	NC_004631	GCT	2	6	930851	930856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3114	NC_004631	GGC	2	6	930938	930943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3115	NC_004631	ATG	2	6	931849	931854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3116	NC_004631	TAA	2	6	931975	931980	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3117	NC_004631	TGTTT	2	10	932000	932009	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
3118	NC_004631	AGAA	2	8	933011	933018	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3119	NC_004631	CAA	2	6	933053	933058	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3120	NC_004631	AAT	2	6	933059	933064	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3121	NC_004631	TGA	2	6	933103	933108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3122	NC_004631	TTA	2	6	933134	933139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3123	NC_004631	ATT	2	6	933247	933252	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3124	NC_004631	GCT	2	6	933349	933354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3125	NC_004631	GAC	2	6	933363	933368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3127	NC_004631	AGA	2	6	933426	933431	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3128	NC_004631	CCTG	2	8	933432	933439	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3129	NC_004631	CAA	2	6	933451	933456	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3130	NC_004631	GAC	2	6	935888	935893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3131	NC_004631	CAG	2	6	935909	935914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3132	NC_004631	ATT	2	6	935945	935950	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3133	NC_004631	ATT	2	6	935957	935962	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3135	NC_004631	CTGG	2	8	936049	936056	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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3261	NC_004631	T	7	7	960627	960633	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3262	NC_004631	ATT	2	6	960638	960643	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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