MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. Ty2 chromosome

Total Repeats: 17242

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_004631	GCG	2	6	754613	754618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2502	NC_004631	TGA	2	6	754648	754653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2503	NC_004631	CCG	2	6	754654	754659	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2504	NC_004631	CCG	2	6	754748	754753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2505	NC_004631	ATA	2	6	754756	754761	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2506	NC_004631	ATC	2	6	754780	754785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2507	NC_004631	TCT	2	6	754843	754848	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2508	NC_004631	GTC	2	6	754879	754884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2509	NC_004631	CGC	2	6	754896	754901	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2510	NC_004631	CAG	3	9	754905	754913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2511	NC_004631	GCC	2	6	754944	754949	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2512	NC_004631	CTG	2	6	754995	755000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2513	NC_004631	ACC	2	6	755068	755073	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2514	NC_004631	TGG	2	6	755129	755134	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2515	NC_004631	CGC	2	6	755150	755155	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2516	NC_004631	GGC	2	6	755160	755165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2517	NC_004631	CA	3	6	755177	755182	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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2519	NC_004631	CTG	2	6	755382	755387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2520	NC_004631	ATG	2	6	755401	755406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2521	NC_004631	GGC	2	6	755454	755459	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2522	NC_004631	TCT	2	6	755524	755529	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2523	NC_004631	GGT	2	6	755537	755542	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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2525	NC_004631	A	6	6	755571	755576	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2527	NC_004631	CGC	2	6	755689	755694	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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2529	NC_004631	A	7	7	757078	757084	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2531	NC_004631	ATA	2	6	757153	757158	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2532	NC_004631	CCG	2	6	758194	758199	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2533	NC_004631	GAGAG	2	10	758248	758257	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
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2537	NC_004631	CAT	2	6	760495	760500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2540	NC_004631	ACA	2	6	761563	761568	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2541	NC_004631	GA	4	8	764010	764017	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2542	NC_004631	GCC	2	6	766613	766618	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2543	NC_004631	AG	3	6	766645	766650	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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2551	NC_004631	CT	3	6	768054	768059	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2552	NC_004631	T	7	7	768067	768073	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2559	NC_004631	ATG	2	6	771796	771801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2562	NC_004631	TCA	2	6	771875	771880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2565	NC_004631	CGC	2	6	772853	772858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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2567	NC_004631	TGG	2	6	774706	774711	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2568	NC_004631	GCC	2	6	774721	774726	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2569	NC_004631	TCT	2	6	774792	774797	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2585	NC_004631	AAAGA	2	10	785812	785821	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
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2590	NC_004631	AATT	2	8	786391	786398	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2599	NC_004631	AT	4	8	789934	789941	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2601	NC_004631	AAT	2	6	789965	789970	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2602	NC_004631	ACAG	2	8	789999	790006	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2603	NC_004631	AAT	2	6	790019	790024	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2604	NC_004631	ATT	2	6	790035	790040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2605	NC_004631	ATTT	2	8	790066	790073	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2606	NC_004631	T	6	6	790071	790076	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2607	NC_004631	TCA	2	6	790112	790117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2609	NC_004631	T	6	6	790497	790502	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2610	NC_004631	TGT	2	6	790506	790511	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2611	NC_004631	TAA	2	6	790544	790549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2612	NC_004631	AAT	2	6	790558	790563	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2613	NC_004631	ATT	2	6	790575	790580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2614	NC_004631	CAA	2	6	790619	790624	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2615	NC_004631	TAA	2	6	790682	790687	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2616	NC_004631	CGG	2	6	791268	791273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2617	NC_004631	TCG	2	6	791277	791282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2618	NC_004631	T	6	6	791287	791292	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2619	NC_004631	TCA	2	6	792005	792010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2620	NC_004631	TCGCT	2	10	792029	792038	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
2621	NC_004631	TGG	2	6	792107	792112	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2622	NC_004631	GA	3	6	792119	792124	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2623	NC_004631	A	6	6	792127	792132	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2624	NC_004631	CAA	2	6	792197	792202	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2625	NC_004631	TTG	2	6	792229	792234	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2626	NC_004631	GAT	2	6	792237	792242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2629	NC_004631	GCCA	2	8	792495	792502	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2630	NC_004631	AGT	2	6	792531	792536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2631	NC_004631	TAA	2	6	792608	792613	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2632	NC_004631	GCA	2	6	792622	792627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2635	NC_004631	TCC	2	6	792884	792889	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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