MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. Ty2 chromosome

Total Repeats: 17242

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16501	NC_004631	AGG	2	6	4637194	4637199	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16502	NC_004631	CGA	2	6	4637270	4637275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16503	NC_004631	ATT	2	6	4638427	4638432	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16504	NC_004631	ACCC	2	8	4638461	4638468	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
16505	NC_004631	TTTTCC	2	12	4638487	4638498	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16506	NC_004631	GCCT	2	8	4638504	4638511	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
16507	NC_004631	CTG	2	6	4638512	4638517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16508	NC_004631	GT	3	6	4638526	4638531	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16509	NC_004631	TTTA	2	8	4638560	4638567	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
16510	NC_004631	GAA	2	6	4638602	4638607	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16511	NC_004631	AACCA	2	10	4641400	4641409	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
16512	NC_004631	GCC	2	6	4641961	4641966	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16513	NC_004631	CGG	2	6	4641967	4641972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16514	NC_004631	CGA	2	6	4641993	4641998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16515	NC_004631	AACC	2	8	4642440	4642447	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16516	NC_004631	A	8	8	4643884	4643891	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16517	NC_004631	TAT	2	6	4644594	4644599	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16518	NC_004631	TCA	2	6	4644623	4644628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16519	NC_004631	ATTG	2	8	4644639	4644646	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
16520	NC_004631	A	6	6	4644689	4644694	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16521	NC_004631	CAT	2	6	4644767	4644772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16522	NC_004631	GCGCT	2	10	4647261	4647270	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
16523	NC_004631	GC	3	6	4647289	4647294	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16524	NC_004631	GCC	2	6	4647318	4647323	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16525	NC_004631	AAG	2	6	4649533	4649538	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16526	NC_004631	GTT	2	6	4649618	4649623	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16527	NC_004631	TGA	2	6	4649628	4649633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16528	NC_004631	ATTA	2	8	4649641	4649648	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16529	NC_004631	CTTA	2	8	4649664	4649671	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
16530	NC_004631	AT	3	6	4649672	4649677	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16531	NC_004631	A	6	6	4649698	4649703	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16532	NC_004631	TAC	2	6	4649724	4649729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16533	NC_004631	T	6	6	4649749	4649754	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16534	NC_004631	ATT	2	6	4649762	4649767	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16535	NC_004631	TGTT	2	8	4649768	4649775	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
16536	NC_004631	ATT	2	6	4649819	4649824	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16537	NC_004631	TAT	2	6	4649860	4649865	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16538	NC_004631	AAT	2	6	4649878	4649883	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16539	NC_004631	GTT	2	6	4649978	4649983	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16540	NC_004631	AT	3	6	4650053	4650058	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16541	NC_004631	GTA	2	6	4650110	4650115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16542	NC_004631	GAT	2	6	4650176	4650181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16543	NC_004631	GGC	2	6	4650645	4650650	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16544	NC_004631	CAT	2	6	4650690	4650695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16545	NC_004631	ATT	2	6	4650702	4650707	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16546	NC_004631	GAT	2	6	4651760	4651765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16547	NC_004631	CGG	2	6	4651821	4651826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16548	NC_004631	CTG	2	6	4652319	4652324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16549	NC_004631	T	7	7	4652330	4652336	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16550	NC_004631	ATT	2	6	4653317	4653322	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16551	NC_004631	ATCA	2	8	4653325	4653332	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
16552	NC_004631	AAT	2	6	4653860	4653865	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16553	NC_004631	ATA	2	6	4653917	4653922	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16554	NC_004631	ATAA	2	8	4653933	4653940	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16555	NC_004631	ATTT	2	8	4654476	4654483	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
16556	NC_004631	ACC	2	6	4654499	4654504	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16557	NC_004631	TAT	2	6	4654609	4654614	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16558	NC_004631	TGT	2	6	4655875	4655880	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16559	NC_004631	TGG	2	6	4655885	4655890	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16560	NC_004631	AAGCG	2	10	4655953	4655962	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
16561	NC_004631	GC	3	6	4655984	4655989	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16562	NC_004631	TGG	2	6	4659368	4659373	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16563	NC_004631	ACA	2	6	4660950	4660955	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16564	NC_004631	GTG	2	6	4660956	4660961	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16565	NC_004631	TCG	2	6	4660975	4660980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16566	NC_004631	GCC	2	6	4661062	4661067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16567	NC_004631	TTA	2	6	4661159	4661164	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16568	NC_004631	GAT	2	6	4661226	4661231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16569	NC_004631	CGA	2	6	4661234	4661239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16570	NC_004631	A	7	7	4661289	4661295	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16571	NC_004631	T	6	6	4661299	4661304	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16572	NC_004631	GCC	2	6	4663579	4663584	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16573	NC_004631	ATG	2	6	4663613	4663618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16574	NC_004631	AGT	2	6	4663694	4663699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16575	NC_004631	GAT	2	6	4664761	4664766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16576	NC_004631	CTG	2	6	4666331	4666336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16577	NC_004631	ATT	2	6	4666358	4666363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16578	NC_004631	GCT	2	6	4666380	4666385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16579	NC_004631	GGC	2	6	4666432	4666437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16580	NC_004631	GTC	2	6	4666645	4666650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16581	NC_004631	GAT	2	6	4668009	4668014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16582	NC_004631	CG	3	6	4671418	4671423	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16583	NC_004631	A	6	6	4671522	4671527	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16584	NC_004631	TGCA	2	8	4671538	4671545	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
16585	NC_004631	T	6	6	4671573	4671578	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16586	NC_004631	T	6	6	4671607	4671612	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16587	NC_004631	TAC	2	6	4671617	4671622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16588	NC_004631	GTTT	2	8	4673334	4673341	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
16589	NC_004631	T	7	7	4673339	4673345	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16590	NC_004631	TAA	2	6	4673348	4673353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16591	NC_004631	CAC	2	6	4673359	4673364	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16592	NC_004631	TAAA	2	8	4673374	4673381	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16593	NC_004631	CAC	2	6	4673445	4673450	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16594	NC_004631	CAGC	3	12	4673471	4673482	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
16595	NC_004631	T	6	6	4673491	4673496	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16596	NC_004631	A	7	7	4673504	4673510	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16597	NC_004631	AT	3	6	4673514	4673519	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16598	NC_004631	A	6	6	4673566	4673571	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16599	NC_004631	TGT	2	6	4673605	4673610	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16600	NC_004631	GTG	2	6	4673611	4673616	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16601	NC_004631	TAC	2	6	4673620	4673625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16602	NC_004631	TTG	2	6	4673634	4673639	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16603	NC_004631	AG	3	6	4673665	4673670	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16604	NC_004631	CGGA	2	8	4673682	4673689	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
16605	NC_004631	T	7	7	4674130	4674136	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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16607	NC_004631	GCG	2	6	4675268	4675273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16608	NC_004631	GCC	2	6	4675327	4675332	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16609	NC_004631	GCC	2	6	4675362	4675367	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16610	NC_004631	GCAGAA	2	12	4675393	4675404	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
16611	NC_004631	GCG	2	6	4675423	4675428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16612	NC_004631	GT	3	6	4675515	4675520	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16613	NC_004631	CA	4	8	4675533	4675540	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16614	NC_004631	CGG	2	6	4675545	4675550	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16615	NC_004631	TTA	2	6	4675622	4675627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16616	NC_004631	GGCGG	2	10	4675657	4675666	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
16617	NC_004631	TGG	2	6	4675780	4675785	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16618	NC_004631	TCC	2	6	4675791	4675796	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16619	NC_004631	CGC	2	6	4675859	4675864	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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16621	NC_004631	GCC	2	6	4675940	4675945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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16623	NC_004631	GTT	2	6	4676222	4676227	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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16625	NC_004631	TCG	2	6	4676250	4676255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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16627	NC_004631	ATT	2	6	4676292	4676297	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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