MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. Ty2 chromosome

Total Repeats: 17242

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16001	NC_004631	TGG	2	6	4437072	4437077	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16002	NC_004631	GAG	2	6	4437138	4437143	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16003	NC_004631	CGT	2	6	4437197	4437202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16004	NC_004631	CAGTG	2	10	4437318	4437327	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
16005	NC_004631	A	6	6	4437401	4437406	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16006	NC_004631	TCA	2	6	4437479	4437484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16007	NC_004631	ATG	2	6	4437531	4437536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16008	NC_004631	G	6	6	4437547	4437552	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
16009	NC_004631	ATT	2	6	4438010	4438015	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16010	NC_004631	TTA	2	6	4438033	4438038	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16011	NC_004631	TATC	2	8	4442790	4442797	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
16012	NC_004631	AT	3	6	4442800	4442805	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16013	NC_004631	AAC	2	6	4442910	4442915	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16014	NC_004631	ATT	2	6	4442938	4442943	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16015	NC_004631	ATT	3	9	4444899	4444907	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16016	NC_004631	TTA	2	6	4444991	4444996	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16017	NC_004631	TCC	2	6	4445037	4445042	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16018	NC_004631	TG	4	8	4445660	4445667	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16019	NC_004631	AGA	2	6	4445678	4445683	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16020	NC_004631	A	7	7	4445700	4445706	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16021	NC_004631	TCT	2	6	4445767	4445772	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16022	NC_004631	AT	3	6	4445777	4445782	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16023	NC_004631	CGT	2	6	4445801	4445806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16024	NC_004631	TGA	2	6	4445825	4445830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16025	NC_004631	G	6	6	4445861	4445866	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
16026	NC_004631	CTA	2	6	4445897	4445902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16027	NC_004631	CACC	2	8	4445931	4445938	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
16028	NC_004631	GGT	2	6	4446018	4446023	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16029	NC_004631	CGA	2	6	4446065	4446070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16030	NC_004631	TAC	2	6	4446080	4446085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16031	NC_004631	CTT	3	9	4446147	4446155	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16032	NC_004631	CTT	2	6	4446189	4446194	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16033	NC_004631	GCCA	2	8	4446234	4446241	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
16034	NC_004631	CGA	2	6	4446249	4446254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16035	NC_004631	CGC	2	6	4446350	4446355	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16036	NC_004631	TTCG	2	8	4446415	4446422	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
16037	NC_004631	A	6	6	4446448	4446453	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16038	NC_004631	ACGG	2	8	4446487	4446494	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
16039	NC_004631	GTT	2	6	4446519	4446524	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16040	NC_004631	TGA	2	6	4446730	4446735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16041	NC_004631	TTCAT	2	10	4446769	4446778	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
16042	NC_004631	CTGA	2	8	4446803	4446810	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
16043	NC_004631	GT	3	6	4446831	4446836	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16044	NC_004631	T	6	6	4446838	4446843	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16045	NC_004631	T	6	6	4447818	4447823	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16046	NC_004631	ATT	2	6	4447886	4447891	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16047	NC_004631	T	6	6	4447927	4447932	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16048	NC_004631	A	6	6	4447995	4448000	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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16050	NC_004631	GGT	2	6	4448205	4448210	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16051	NC_004631	T	6	6	4448244	4448249	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16052	NC_004631	ACC	2	6	4448842	4448847	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16053	NC_004631	AGG	2	6	4448900	4448905	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16054	NC_004631	TAC	2	6	4449322	4449327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16055	NC_004631	GGCT	2	8	4449343	4449350	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
16056	NC_004631	GTT	2	6	4449361	4449366	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16057	NC_004631	T	6	6	4449481	4449486	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16058	NC_004631	AGG	2	6	4449528	4449533	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16059	NC_004631	TAT	2	6	4449555	4449560	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16060	NC_004631	CGT	2	6	4449571	4449576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16061	NC_004631	TTGTT	2	10	4449593	4449602	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
16062	NC_004631	A	6	6	4449692	4449697	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16063	NC_004631	AC	3	6	4449704	4449709	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16064	NC_004631	GAG	2	6	4449751	4449756	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16065	NC_004631	T	7	7	4451240	4451246	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16066	NC_004631	TAA	2	6	4454237	4454242	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16067	NC_004631	AG	3	6	4454246	4454251	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16068	NC_004631	TGA	2	6	4455639	4455644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16069	NC_004631	TTC	2	6	4455990	4455995	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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16071	NC_004631	GGC	2	6	4457520	4457525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16072	NC_004631	TCC	2	6	4457978	4457983	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16073	NC_004631	CCG	2	6	4458249	4458254	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16074	NC_004631	AAT	2	6	4458268	4458273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16075	NC_004631	ATT	3	9	4458286	4458294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16076	NC_004631	TTAT	2	8	4458301	4458308	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
16077	NC_004631	GCG	2	6	4464901	4464906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16078	NC_004631	CGG	2	6	4465037	4465042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16079	NC_004631	CCA	2	6	4465096	4465101	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16080	NC_004631	CAC	2	6	4465119	4465124	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16081	NC_004631	CTC	2	6	4465191	4465196	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16082	NC_004631	T	7	7	4465212	4465218	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16083	NC_004631	AAAATA	2	12	4465231	4465242	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16084	NC_004631	TCA	2	6	4465286	4465291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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16086	NC_004631	CTAT	2	8	4465337	4465344	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
16087	NC_004631	AT	3	6	4465343	4465348	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16088	NC_004631	A	6	6	4466119	4466124	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16089	NC_004631	AACT	2	8	4466182	4466189	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
16090	NC_004631	A	8	8	4466240	4466247	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16091	NC_004631	TGC	2	6	4466255	4466260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16092	NC_004631	TA	3	6	4466261	4466266	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16093	NC_004631	AGC	2	6	4466273	4466278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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16096	NC_004631	TTC	2	6	4471292	4471297	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16097	NC_004631	TCCGGC	2	12	4471305	4471316	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
16098	NC_004631	TCAG	2	8	4471365	4471372	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
16099	NC_004631	CA	3	6	4471395	4471400	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16100	NC_004631	GTT	2	6	4471454	4471459	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16101	NC_004631	GGCT	2	8	4471470	4471477	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
16102	NC_004631	CAG	2	6	4471490	4471495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16103	NC_004631	CAG	2	6	4471508	4471513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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16106	NC_004631	CCA	2	6	4471594	4471599	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16107	NC_004631	GTT	2	6	4471636	4471641	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16108	NC_004631	T	7	7	4471660	4471666	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16109	NC_004631	CTT	2	6	4471673	4471678	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16110	NC_004631	AAT	2	6	4471718	4471723	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16111	NC_004631	GGC	2	6	4471754	4471759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16112	NC_004631	GCA	2	6	4473084	4473089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16113	NC_004631	GCC	2	6	4474046	4474051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16114	NC_004631	CGTT	2	8	4474065	4474072	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
16115	NC_004631	G	6	6	4476691	4476696	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
16116	NC_004631	CA	3	6	4476730	4476735	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16117	NC_004631	GCC	2	6	4476753	4476758	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16118	NC_004631	CAT	2	6	4479613	4479618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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16120	NC_004631	T	6	6	4482494	4482499	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16121	NC_004631	GTT	2	6	4482752	4482757	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16122	NC_004631	GTC	2	6	4482819	4482824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16123	NC_004631	CTG	2	6	4482834	4482839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16124	NC_004631	ATT	2	6	4482841	4482846	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16125	NC_004631	TCT	2	6	4483001	4483006	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16126	NC_004631	ATT	2	6	4483021	4483026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16127	NC_004631	TCG	2	6	4483107	4483112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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16129	NC_004631	TCG	2	6	4483152	4483157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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16255	NC_004631	GGT	2	6	4525962	4525967	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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16261	NC_004631	TTG	2	6	4530253	4530258	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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16391	NC_004631	TGTT	2	8	4583320	4583327	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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