MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. Ty2 chromosome

Total Repeats: 17242

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15501	NC_004631	TA	3	6	4294784	4294789	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15502	NC_004631	GCC	2	6	4294855	4294860	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15503	NC_004631	ATT	2	6	4295190	4295195	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15504	NC_004631	TACA	2	8	4295242	4295249	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
15505	NC_004631	A	7	7	4295257	4295263	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15506	NC_004631	GCGCTT	2	12	4298901	4298912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15507	NC_004631	CCA	2	6	4298984	4298989	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15508	NC_004631	TCT	2	6	4299004	4299009	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15509	NC_004631	TGT	2	6	4300308	4300313	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15510	NC_004631	ATC	2	6	4300315	4300320	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15511	NC_004631	T	6	6	4300324	4300329	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15512	NC_004631	TCCT	2	8	4300350	4300357	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15513	NC_004631	T	6	6	4300389	4300394	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15514	NC_004631	TAA	2	6	4300411	4300416	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15515	NC_004631	A	7	7	4300450	4300456	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15516	NC_004631	T	6	6	4301186	4301191	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15517	NC_004631	TGC	2	6	4301242	4301247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15518	NC_004631	GTTT	2	8	4301264	4301271	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
15519	NC_004631	AGGA	2	8	4301274	4301281	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15520	NC_004631	GGC	2	6	4302880	4302885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15521	NC_004631	ATG	2	6	4302937	4302942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15522	NC_004631	GTTT	2	8	4305834	4305841	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
15523	NC_004631	CAA	2	6	4305930	4305935	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15524	NC_004631	CG	3	6	4305945	4305950	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15525	NC_004631	CTG	2	6	4306632	4306637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15526	NC_004631	TTA	2	6	4306663	4306668	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15527	NC_004631	TAT	2	6	4306674	4306679	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15528	NC_004631	A	6	6	4306698	4306703	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15529	NC_004631	CAT	2	6	4306776	4306781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15530	NC_004631	AT	3	6	4306858	4306863	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15531	NC_004631	T	6	6	4306876	4306881	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15532	NC_004631	ACA	2	6	4306883	4306888	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15533	NC_004631	TAT	2	6	4306925	4306930	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15534	NC_004631	TTAA	2	8	4306937	4306944	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15535	NC_004631	TGCT	2	8	4306946	4306953	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
15536	NC_004631	TGA	2	6	4306962	4306967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15537	NC_004631	ATATG	2	10	4306974	4306983	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
15538	NC_004631	TA	3	6	4307040	4307045	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15539	NC_004631	A	6	6	4307045	4307050	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15540	NC_004631	T	7	7	4307067	4307073	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15541	NC_004631	T	6	6	4307086	4307091	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15542	NC_004631	TTA	2	6	4307101	4307106	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15543	NC_004631	TTA	2	6	4307192	4307197	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15544	NC_004631	CGG	2	6	4307285	4307290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15545	NC_004631	TGA	2	6	4307306	4307311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15546	NC_004631	T	6	6	4307315	4307320	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15547	NC_004631	TAT	2	6	4307350	4307355	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15548	NC_004631	TAGT	2	8	4307367	4307374	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
15549	NC_004631	AAT	2	6	4307377	4307382	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15550	NC_004631	A	7	7	4307399	4307405	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15551	NC_004631	TTAA	2	8	4307418	4307425	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15552	NC_004631	TGT	2	6	4307438	4307443	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15553	NC_004631	CGT	2	6	4307460	4307465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15554	NC_004631	GGT	2	6	4307539	4307544	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15555	NC_004631	ACA	2	6	4307628	4307633	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15556	NC_004631	TGG	2	6	4322145	4322150	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15557	NC_004631	GGT	2	6	4331051	4331056	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15558	NC_004631	TAA	2	6	4331063	4331068	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15559	NC_004631	A	6	6	4331067	4331072	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15560	NC_004631	T	7	7	4331094	4331100	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15561	NC_004631	GGC	2	6	4331189	4331194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15562	NC_004631	TCA	2	6	4331197	4331202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15563	NC_004631	GC	3	6	4331245	4331250	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15564	NC_004631	GTT	2	6	4331627	4331632	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15565	NC_004631	TGTTTC	2	12	4331694	4331705	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
15566	NC_004631	T	6	6	4331762	4331767	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15567	NC_004631	T	6	6	4331786	4331791	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15568	NC_004631	TAT	2	6	4331839	4331844	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15569	NC_004631	TAC	2	6	4331845	4331850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15570	NC_004631	T	8	8	4331858	4331865	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15571	NC_004631	TTAT	2	8	4331897	4331904	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15572	NC_004631	AAAG	2	8	4331907	4331914	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
15573	NC_004631	CCTG	2	8	4331981	4331988	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
15574	NC_004631	TTA	2	6	4332013	4332018	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15575	NC_004631	AAT	2	6	4332108	4332113	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15576	NC_004631	AAT	2	6	4332121	4332126	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15577	NC_004631	ATTCG	2	10	4334079	4334088	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
15578	NC_004631	GTTT	2	8	4334664	4334671	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
15579	NC_004631	GTCTTT	2	12	4334675	4334686	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
15580	NC_004631	AGG	2	6	4334707	4334712	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15581	NC_004631	GTG	2	6	4334749	4334754	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15582	NC_004631	TGTAAG	2	12	4334778	4334789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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15585	NC_004631	TAGT	2	8	4334864	4334871	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
15586	NC_004631	TTG	2	6	4335619	4335624	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15587	NC_004631	TATT	2	8	4335666	4335673	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15588	NC_004631	TGA	2	6	4335728	4335733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15589	NC_004631	T	8	8	4335753	4335760	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15590	NC_004631	T	6	6	4335797	4335802	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15591	NC_004631	GCG	2	6	4335803	4335808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15592	NC_004631	CGA	2	6	4335878	4335883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15593	NC_004631	ATA	2	6	4335884	4335889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15594	NC_004631	GCC	2	6	4339119	4339124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15595	NC_004631	TAT	2	6	4340118	4340123	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15596	NC_004631	GGA	2	6	4341257	4341262	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15597	NC_004631	GC	3	6	4343277	4343282	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15598	NC_004631	CG	3	6	4343293	4343298	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15599	NC_004631	TGC	2	6	4343320	4343325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15600	NC_004631	GCC	2	6	4343343	4343348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15601	NC_004631	GA	3	6	4343405	4343410	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15602	NC_004631	CGCGTT	2	12	4343442	4343453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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15604	NC_004631	TAA	2	6	4345491	4345496	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15605	NC_004631	AGC	2	6	4345550	4345555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15606	NC_004631	T	6	6	4345562	4345567	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15607	NC_004631	TAA	2	6	4345776	4345781	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15608	NC_004631	A	6	6	4345816	4345821	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15609	NC_004631	GC	3	6	4347377	4347382	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15610	NC_004631	TG	3	6	4352472	4352477	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15611	NC_004631	A	7	7	4352484	4352490	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15612	NC_004631	ATTA	2	8	4352514	4352521	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15613	NC_004631	ATT	2	6	4352531	4352536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15614	NC_004631	A	6	6	4352552	4352557	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15616	NC_004631	TTA	2	6	4352604	4352609	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15617	NC_004631	A	6	6	4352687	4352692	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15618	NC_004631	GTAT	2	8	4352730	4352737	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
15619	NC_004631	CGG	2	6	4352752	4352757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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15624	NC_004631	A	7	7	4355000	4355006	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15625	NC_004631	GCC	2	6	4355108	4355113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15626	NC_004631	T	6	6	4357340	4357345	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15627	NC_004631	GAAA	2	8	4357428	4357435	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
15628	NC_004631	TAT	2	6	4357451	4357456	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15629	NC_004631	GGAT	2	8	4357520	4357527	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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