MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. Ty2 chromosome

Total Repeats: 17242

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_004631	TAA	3	9	4179450	4179458	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15002	NC_004631	TA	3	6	4179476	4179481	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15003	NC_004631	TTTA	2	8	4179488	4179495	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15004	NC_004631	CTTC	2	8	4179546	4179553	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15005	NC_004631	TGC	2	6	4179588	4179593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15006	NC_004631	GCC	3	9	4179628	4179636	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15007	NC_004631	CGC	2	6	4179670	4179675	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15008	NC_004631	GCC	2	6	4179724	4179729	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15009	NC_004631	CTG	2	6	4179970	4179975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15010	NC_004631	GCT	2	6	4180027	4180032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15011	NC_004631	TCA	2	6	4180082	4180087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15012	NC_004631	GCC	2	6	4180126	4180131	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15013	NC_004631	GC	3	6	4180277	4180282	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15014	NC_004631	CCA	2	6	4180296	4180301	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15015	NC_004631	GCG	2	6	4180329	4180334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15016	NC_004631	CGG	2	6	4180437	4180442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15017	NC_004631	GTT	2	6	4180474	4180479	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15018	NC_004631	CAC	2	6	4180609	4180614	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15019	NC_004631	TGG	2	6	4180617	4180622	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15020	NC_004631	TGC	2	6	4180650	4180655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15021	NC_004631	CCA	2	6	4180659	4180664	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15022	NC_004631	GGT	2	6	4180681	4180686	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15023	NC_004631	CGG	2	6	4180689	4180694	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15024	NC_004631	GTT	2	6	4180804	4180809	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15025	NC_004631	CGG	2	6	4180830	4180835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15026	NC_004631	TGC	2	6	4180854	4180859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15027	NC_004631	TCG	2	6	4180907	4180912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15028	NC_004631	TTA	2	6	4180922	4180927	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15029	NC_004631	TAA	2	6	4180965	4180970	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15030	NC_004631	TTA	2	6	4181012	4181017	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15031	NC_004631	GTT	2	6	4181083	4181088	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15032	NC_004631	GGT	2	6	4181149	4181154	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15033	NC_004631	GCC	2	6	4181206	4181211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15034	NC_004631	TTA	2	6	4181228	4181233	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15035	NC_004631	CGT	2	6	4181253	4181258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15036	NC_004631	AGA	2	6	4181346	4181351	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15037	NC_004631	GCC	2	6	4181380	4181385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15038	NC_004631	C	6	6	4181384	4181389	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
15039	NC_004631	AAGC	2	8	4181394	4181401	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
15040	NC_004631	AGT	2	6	4181407	4181412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15041	NC_004631	TACCG	2	10	4181419	4181428	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
15042	NC_004631	TGT	2	6	4181553	4181558	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15043	NC_004631	CGT	2	6	4181661	4181666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15044	NC_004631	GTTA	2	8	4181727	4181734	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
15045	NC_004631	GTC	2	6	4181746	4181751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15046	NC_004631	ATT	2	6	4181775	4181780	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15047	NC_004631	CGC	2	6	4181789	4181794	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15048	NC_004631	GTG	2	6	4181851	4181856	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15049	NC_004631	CGC	2	6	4181870	4181875	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15050	NC_004631	GTT	2	6	4181880	4181885	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15051	NC_004631	CGC	2	6	4181921	4181926	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15052	NC_004631	TAT	2	6	4181939	4181944	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15053	NC_004631	TTA	2	6	4181968	4181973	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15054	NC_004631	TGTT	2	8	4182041	4182048	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
15055	NC_004631	TCG	2	6	4182058	4182063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15056	NC_004631	TCG	2	6	4182076	4182081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15057	NC_004631	CCG	2	6	4182193	4182198	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15058	NC_004631	GCC	2	6	4182205	4182210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15059	NC_004631	GGTC	2	8	4182230	4182237	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
15060	NC_004631	ATTA	2	8	4182264	4182271	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15061	NC_004631	CCG	2	6	4182292	4182297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15062	NC_004631	CAT	2	6	4182306	4182311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15063	NC_004631	TGG	2	6	4182350	4182355	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15064	NC_004631	GGT	2	6	4182381	4182386	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15065	NC_004631	TCA	2	6	4182460	4182465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15066	NC_004631	AT	3	6	4182561	4182566	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15067	NC_004631	CGT	2	6	4182578	4182583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15068	NC_004631	ATG	2	6	4182683	4182688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15069	NC_004631	ATT	2	6	4182717	4182722	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15070	NC_004631	TGT	2	6	4182777	4182782	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15071	NC_004631	CGC	2	6	4182821	4182826	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15072	NC_004631	TAA	2	6	4182837	4182842	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15073	NC_004631	ATT	2	6	4182876	4182881	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15074	NC_004631	GAG	2	6	4182886	4182891	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15075	NC_004631	CGC	2	6	4182896	4182901	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15076	NC_004631	TAA	2	6	4182928	4182933	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15077	NC_004631	AGAA	2	8	4182936	4182943	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
15078	NC_004631	GCC	2	6	4182993	4182998	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15079	NC_004631	CGC	2	6	4183025	4183030	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15080	NC_004631	CCG	2	6	4183156	4183161	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15081	NC_004631	ATT	2	6	4183281	4183286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15082	NC_004631	GCT	2	6	4183320	4183325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15083	NC_004631	ATA	2	6	4183378	4183383	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15084	NC_004631	GTT	2	6	4183392	4183397	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15085	NC_004631	GC	3	6	4183511	4183516	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15086	NC_004631	CACG	2	8	4183604	4183611	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
15087	NC_004631	TGA	2	6	4183655	4183660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15088	NC_004631	CAG	2	6	4183683	4183688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15089	NC_004631	CGCC	2	8	4183691	4183698	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
15090	NC_004631	GCT	2	6	4183707	4183712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15091	NC_004631	TAA	2	6	4183724	4183729	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15092	NC_004631	CGC	3	9	4183731	4183739	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15093	NC_004631	CGT	2	6	4183787	4183792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15094	NC_004631	GCC	2	6	4183818	4183823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15095	NC_004631	GGT	2	6	4183905	4183910	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15096	NC_004631	GCC	2	6	4183962	4183967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15097	NC_004631	TTG	2	6	4183993	4183998	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15098	NC_004631	TGG	2	6	4184051	4184056	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15099	NC_004631	GAT	3	9	4184094	4184102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15100	NC_004631	GCC	3	9	4184109	4184117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15101	NC_004631	TGG	3	9	4184144	4184152	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15102	NC_004631	GC	3	6	4184171	4184176	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15103	NC_004631	TGG	2	6	4184216	4184221	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15104	NC_004631	AAT	2	6	4184307	4184312	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15105	NC_004631	TCGCCG	2	12	4184368	4184379	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
15106	NC_004631	GGT	2	6	4184388	4184393	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15107	NC_004631	TCG	2	6	4184398	4184403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15108	NC_004631	CGG	2	6	4184471	4184476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15109	NC_004631	GCC	2	6	4184520	4184525	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15110	NC_004631	G	6	6	4184528	4184533	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
15111	NC_004631	GTT	2	6	4184547	4184552	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15112	NC_004631	AAT	2	6	4184561	4184566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15113	NC_004631	GTC	3	9	4184691	4184699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15114	NC_004631	CGGG	2	8	4184702	4184709	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
15115	NC_004631	CGC	2	6	4184723	4184728	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15116	NC_004631	TCG	2	6	4184731	4184736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15117	NC_004631	CGC	2	6	4184756	4184761	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15118	NC_004631	TCG	2	6	4184764	4184769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15119	NC_004631	GCC	2	6	4184784	4184789	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15120	NC_004631	TCG	2	6	4184791	4184796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15121	NC_004631	CGC	2	6	4184882	4184887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15122	NC_004631	TCA	2	6	4185001	4185006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15123	NC_004631	GCG	2	6	4185019	4185024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15124	NC_004631	TAA	2	6	4185037	4185042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15125	NC_004631	AGCGAT	2	12	4185057	4185068	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
15126	NC_004631	T	6	6	4185078	4185083	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15127	NC_004631	TTAA	2	8	4185104	4185111	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15253	NC_004631	AAACT	2	10	4211848	4211857	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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15288	NC_004631	ATAA	2	8	4232947	4232954	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15499	NC_004631	TTAT	2	8	4293711	4293718	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15500	NC_004631	CAC	2	6	4294748	4294753	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding

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