MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. Ty2 chromosome

Total Repeats: 17242

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_004631	CGA	2	6	3878947	3878952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14002	NC_004631	TCG	2	6	3879039	3879044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14003	NC_004631	TAA	3	9	3879154	3879162	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14004	NC_004631	ATT	2	6	3879221	3879226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14005	NC_004631	TCCCG	2	10	3879287	3879296	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
14006	NC_004631	GT	3	6	3879318	3879323	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14007	NC_004631	AAT	2	6	3879455	3879460	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14008	NC_004631	CGG	2	6	3879473	3879478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14009	NC_004631	GCTG	2	8	3879481	3879488	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
14010	NC_004631	GCC	2	6	3879528	3879533	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14011	NC_004631	GGGA	2	8	3879535	3879542	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
14012	NC_004631	TGC	2	6	3879560	3879565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14013	NC_004631	ATGA	2	8	3879582	3879589	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
14014	NC_004631	CCT	2	6	3879615	3879620	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14015	NC_004631	AAT	2	6	3879652	3879657	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14016	NC_004631	ATA	2	6	3879664	3879669	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14017	NC_004631	TAAA	2	8	3880345	3880352	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14018	NC_004631	ATA	2	6	3880366	3880371	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14019	NC_004631	ATT	2	6	3880401	3880406	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14020	NC_004631	CAT	2	6	3880481	3880486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14021	NC_004631	A	6	6	3880540	3880545	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14022	NC_004631	GAT	2	6	3880578	3880583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14023	NC_004631	TCTG	2	8	3880605	3880612	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
14024	NC_004631	GTGAT	2	10	3880633	3880642	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
14025	NC_004631	TTA	3	9	3880682	3880690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14026	NC_004631	T	6	6	3880706	3880711	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14027	NC_004631	TCA	2	6	3880759	3880764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14028	NC_004631	CTT	2	6	3880766	3880771	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14029	NC_004631	TAATGC	2	12	3880825	3880836	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
14030	NC_004631	TGA	2	6	3880985	3880990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14031	NC_004631	GTC	2	6	3881053	3881058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14032	NC_004631	CCT	2	6	3881079	3881084	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14033	NC_004631	CAG	2	6	3881184	3881189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14034	NC_004631	A	6	6	3881242	3881247	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14035	NC_004631	AACT	2	8	3881251	3881258	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
14036	NC_004631	AT	3	6	3881297	3881302	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14037	NC_004631	TAC	2	6	3881303	3881308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14038	NC_004631	ATA	2	6	3881315	3881320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14039	NC_004631	GGA	2	6	3881509	3881514	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14040	NC_004631	AG	3	6	3881567	3881572	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14041	NC_004631	TAC	2	6	3881680	3881685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14042	NC_004631	GCC	2	6	3881710	3881715	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14043	NC_004631	ACG	2	6	3881722	3881727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14044	NC_004631	CAT	2	6	3881729	3881734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14045	NC_004631	CTGG	2	8	3881769	3881776	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
14046	NC_004631	TGG	2	6	3881856	3881861	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14047	NC_004631	TCA	2	6	3883169	3883174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14048	NC_004631	TCAT	2	8	3883180	3883187	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
14049	NC_004631	CCA	2	6	3883193	3883198	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14050	NC_004631	AGT	2	6	3883241	3883246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14051	NC_004631	ATC	2	6	3883260	3883265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14052	NC_004631	CTG	2	6	3883275	3883280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14053	NC_004631	CAG	2	6	3883356	3883361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14054	NC_004631	AAC	2	6	3883363	3883368	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14055	NC_004631	GAT	2	6	3883455	3883460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14056	NC_004631	AGC	2	6	3883472	3883477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14057	NC_004631	ATT	2	6	3883482	3883487	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14058	NC_004631	TGG	2	6	3883558	3883563	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14059	NC_004631	GTT	2	6	3883565	3883570	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14060	NC_004631	TCC	2	6	3883614	3883619	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14061	NC_004631	TGC	2	6	3883703	3883708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14062	NC_004631	CAG	2	6	3883762	3883767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14063	NC_004631	CAC	2	6	3883811	3883816	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14064	NC_004631	TCA	2	6	3883843	3883848	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14065	NC_004631	CAGCG	2	10	3883878	3883887	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
14066	NC_004631	AATA	2	8	3884042	3884049	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14067	NC_004631	GTG	2	6	3884113	3884118	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14068	NC_004631	TGG	2	6	3884776	3884781	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14069	NC_004631	TAA	2	6	3884892	3884897	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14070	NC_004631	ATG	2	6	3884972	3884977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14071	NC_004631	GGCA	2	8	3885013	3885020	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
14072	NC_004631	GAT	2	6	3885030	3885035	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14073	NC_004631	TAA	2	6	3885046	3885051	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14074	NC_004631	ATC	2	6	3885060	3885065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14075	NC_004631	AAT	2	6	3885072	3885077	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14076	NC_004631	AT	3	6	3885084	3885089	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14077	NC_004631	TAA	2	6	3885099	3885104	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14078	NC_004631	TAC	2	6	3885117	3885122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14079	NC_004631	CTA	2	6	3885123	3885128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14080	NC_004631	ATA	2	6	3885161	3885166	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14081	NC_004631	G	7	7	3885268	3885274	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
14082	NC_004631	CCCG	2	8	3885714	3885721	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
14083	NC_004631	CTT	2	6	3885747	3885752	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14084	NC_004631	TAA	2	6	3885811	3885816	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14085	NC_004631	AAT	2	6	3885817	3885822	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14086	NC_004631	TC	4	8	3885832	3885839	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14087	NC_004631	CCTTT	2	10	3885842	3885851	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
14088	NC_004631	TAT	2	6	3885854	3885859	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14089	NC_004631	TAA	3	9	3885876	3885884	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14090	NC_004631	TGG	2	6	3885916	3885921	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14091	NC_004631	GA	3	6	3885926	3885931	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14092	NC_004631	GGC	2	6	3885979	3885984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14093	NC_004631	GCC	2	6	3886006	3886011	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14094	NC_004631	GAC	2	6	3886020	3886025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14095	NC_004631	GC	4	8	3886056	3886063	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14096	NC_004631	T	6	6	3886105	3886110	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14097	NC_004631	TCA	2	6	3886176	3886181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14098	NC_004631	AGCGCC	2	12	3890107	3890118	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
14099	NC_004631	CAG	2	6	3891931	3891936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14100	NC_004631	CGC	3	9	3891950	3891958	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14101	NC_004631	GTG	2	6	3893371	3893376	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14102	NC_004631	GGT	2	6	3893402	3893407	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14103	NC_004631	GCGA	2	8	3893422	3893429	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
14104	NC_004631	A	6	6	3893445	3893450	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14105	NC_004631	TA	3	6	3893466	3893471	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14106	NC_004631	A	6	6	3893523	3893528	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14107	NC_004631	GCC	2	6	3894812	3894817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14108	NC_004631	ACG	2	6	3899739	3899744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14109	NC_004631	GAA	2	6	3900032	3900037	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14110	NC_004631	TTA	2	6	3900736	3900741	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14111	NC_004631	ATT	2	6	3900791	3900796	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14112	NC_004631	CGT	2	6	3900828	3900833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14113	NC_004631	GCA	2	6	3900835	3900840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14114	NC_004631	A	6	6	3900848	3900853	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14115	NC_004631	AGG	2	6	3900935	3900940	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14116	NC_004631	TGA	2	6	3900944	3900949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14117	NC_004631	GCC	2	6	3901020	3901025	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14118	NC_004631	GAA	2	6	3901039	3901044	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14119	NC_004631	GT	3	6	3901121	3901126	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14120	NC_004631	CCG	2	6	3901201	3901206	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14121	NC_004631	ACA	2	6	3901216	3901221	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14122	NC_004631	CGTA	2	8	3901245	3901252	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14123	NC_004631	ACA	2	6	3901446	3901451	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14124	NC_004631	GC	3	6	3901456	3901461	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14125	NC_004631	GC	3	6	3901539	3901544	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14126	NC_004631	GAA	2	6	3901688	3901693	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14127	NC_004631	GC	3	6	3901734	3901739	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14128	NC_004631	CTGG	2	8	3901841	3901848	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
14129	NC_004631	GTA	2	6	3901932	3901937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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14131	NC_004631	TGA	2	6	3902078	3902083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14132	NC_004631	GTC	2	6	3902085	3902090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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14243	NC_004631	TAT	2	6	3943214	3943219	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14250	NC_004631	G	6	6	3945052	3945057	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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14254	NC_004631	TTAT	2	8	3948847	3948854	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14255	NC_004631	GAGAG	2	10	3948932	3948941	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
14256	NC_004631	GTT	2	6	3949001	3949006	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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