MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. Ty2 chromosome

Total Repeats: 17242

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_004631	TCA	2	6	3631952	3631957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13002	NC_004631	TGA	2	6	3632953	3632958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13003	NC_004631	GCA	2	6	3633001	3633006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13004	NC_004631	T	6	6	3633533	3633538	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13005	NC_004631	GGC	2	6	3633634	3633639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13006	NC_004631	ACGC	2	8	3633687	3633694	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
13007	NC_004631	CGC	2	6	3633701	3633706	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13008	NC_004631	AT	3	6	3634020	3634025	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13009	NC_004631	GCA	2	6	3634088	3634093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13010	NC_004631	CATC	2	8	3634099	3634106	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
13011	NC_004631	CATT	2	8	3634116	3634123	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13012	NC_004631	AATGA	2	10	3634154	3634163	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
13013	NC_004631	CT	3	6	3634173	3634178	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13014	NC_004631	CTG	2	6	3634180	3634185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13015	NC_004631	AC	3	6	3634235	3634240	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13016	NC_004631	CCT	2	6	3634322	3634327	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13017	NC_004631	AAT	2	6	3634336	3634341	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13018	NC_004631	CA	4	8	3636780	3636787	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13019	NC_004631	ATT	2	6	3636791	3636796	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13020	NC_004631	CCCT	2	8	3636797	3636804	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
13021	NC_004631	GC	3	6	3636820	3636825	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13022	NC_004631	ACGA	2	8	3637916	3637923	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
13023	NC_004631	ATC	2	6	3638745	3638750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13024	NC_004631	TGA	2	6	3639338	3639343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13025	NC_004631	TGC	2	6	3639991	3639996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13026	NC_004631	GAAAT	2	10	3640041	3640050	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
13027	NC_004631	GCGCT	2	10	3640837	3640846	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
13028	NC_004631	GCC	2	6	3640893	3640898	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13029	NC_004631	TGAC	2	8	3647603	3647610	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13030	NC_004631	T	6	6	3647626	3647631	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13031	NC_004631	GTA	2	6	3647654	3647659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13032	NC_004631	A	6	6	3647671	3647676	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13033	NC_004631	GAT	2	6	3647717	3647722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13034	NC_004631	TCAAT	2	10	3648816	3648825	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
13035	NC_004631	A	7	7	3648876	3648882	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13036	NC_004631	A	6	6	3650492	3650497	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13037	NC_004631	GAA	2	6	3650505	3650510	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13038	NC_004631	TTA	2	6	3650780	3650785	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13039	NC_004631	CGC	2	6	3650789	3650794	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13040	NC_004631	TGA	2	6	3650933	3650938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13041	NC_004631	TGA	2	6	3650962	3650967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13042	NC_004631	CAG	2	6	3651024	3651029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13043	NC_004631	ACC	2	6	3651055	3651060	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13044	NC_004631	GC	3	6	3651065	3651070	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13045	NC_004631	T	6	6	3651262	3651267	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13046	NC_004631	ACG	2	6	3651278	3651283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13047	NC_004631	CAGG	2	8	3651290	3651297	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13048	NC_004631	CAG	2	6	3652088	3652093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13049	NC_004631	ATA	2	6	3654187	3654192	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13050	NC_004631	ATT	2	6	3654196	3654201	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13051	NC_004631	TCA	2	6	3654216	3654221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13052	NC_004631	TCA	3	9	3654261	3654269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13053	NC_004631	CG	3	6	3654290	3654295	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13054	NC_004631	CAG	2	6	3654331	3654336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13055	NC_004631	CCCG	2	8	3654349	3654356	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
13056	NC_004631	GAA	2	6	3654379	3654384	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13057	NC_004631	GCC	2	6	3654391	3654396	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13058	NC_004631	TTTTC	2	10	3654426	3654435	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
13059	NC_004631	AGA	2	6	3654492	3654497	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13060	NC_004631	TAA	2	6	3654501	3654506	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13061	NC_004631	GC	3	6	3654564	3654569	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13062	NC_004631	TAA	2	6	3654582	3654587	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13063	NC_004631	GGT	2	6	3654637	3654642	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13064	NC_004631	ATC	2	6	3654647	3654652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13065	NC_004631	ACG	2	6	3654668	3654673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13066	NC_004631	CCG	2	6	3654707	3654712	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13067	NC_004631	ATA	2	6	3654718	3654723	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13068	NC_004631	TAA	2	6	3654731	3654736	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13069	NC_004631	ATAAC	2	10	3654755	3654764	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
13070	NC_004631	CAG	3	9	3654772	3654780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13071	NC_004631	AAC	2	6	3654784	3654789	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13072	NC_004631	AAT	2	6	3654796	3654801	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13073	NC_004631	GTG	2	6	3654881	3654886	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13074	NC_004631	AGA	2	6	3654894	3654899	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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13076	NC_004631	TTA	2	6	3654959	3654964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13077	NC_004631	CCAG	2	8	3654972	3654979	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
13078	NC_004631	TCA	2	6	3655029	3655034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13079	NC_004631	ATC	2	6	3655091	3655096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13080	NC_004631	TAA	2	6	3655194	3655199	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13081	NC_004631	CAG	2	6	3655240	3655245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13082	NC_004631	ATCA	2	8	3655318	3655325	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13083	NC_004631	GCG	2	6	3655358	3655363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13084	NC_004631	GAG	2	6	3655396	3655401	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13085	NC_004631	T	6	6	3655458	3655463	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13086	NC_004631	ATG	2	6	3655529	3655534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13087	NC_004631	TA	4	8	3655560	3655567	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13088	NC_004631	CCAT	2	8	3655570	3655577	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
13089	NC_004631	AG	3	6	3655601	3655606	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13090	NC_004631	ACC	2	6	3655615	3655620	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13091	NC_004631	TGGT	2	8	3655652	3655659	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13092	NC_004631	G	6	6	3655731	3655736	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
13093	NC_004631	A	6	6	3656561	3656566	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13094	NC_004631	ATA	2	6	3656576	3656581	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13095	NC_004631	TGT	2	6	3657609	3657614	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13096	NC_004631	TGA	2	6	3657619	3657624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13097	NC_004631	A	7	7	3657663	3657669	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13098	NC_004631	GGC	2	6	3657714	3657719	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13099	NC_004631	GC	3	6	3657783	3657788	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13100	NC_004631	CTG	2	6	3658864	3658869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13101	NC_004631	TCAGG	2	10	3658877	3658886	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
13102	NC_004631	CTGGC	2	10	3658916	3658925	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
13103	NC_004631	CAAT	2	8	3658937	3658944	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13104	NC_004631	TCT	2	6	3659855	3659860	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13105	NC_004631	GTA	2	6	3659865	3659870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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13107	NC_004631	A	8	8	3659922	3659929	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13108	NC_004631	CAT	2	6	3659936	3659941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13109	NC_004631	GTT	2	6	3659984	3659989	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13110	NC_004631	GA	3	6	3660525	3660530	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13111	NC_004631	AAC	2	6	3660573	3660578	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13112	NC_004631	TGA	2	6	3660603	3660608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13113	NC_004631	T	6	6	3662736	3662741	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13114	NC_004631	A	7	7	3663877	3663883	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13115	NC_004631	TCA	2	6	3663889	3663894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13116	NC_004631	TGCAA	2	10	3663913	3663922	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
13117	NC_004631	ATT	2	6	3663923	3663928	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13118	NC_004631	T	6	6	3663927	3663932	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13119	NC_004631	ATT	2	6	3664555	3664560	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13120	NC_004631	CGC	2	6	3664581	3664586	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13121	NC_004631	TTAA	2	8	3664609	3664616	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13122	NC_004631	A	7	7	3664683	3664689	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13123	NC_004631	TGA	2	6	3664723	3664728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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13125	NC_004631	AAG	2	6	3664809	3664814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13126	NC_004631	ATT	2	6	3664850	3664855	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13127	NC_004631	CT	3	6	3664924	3664929	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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13129	NC_004631	AGCC	2	8	3664978	3664985	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
13130	NC_004631	GCA	2	6	3665013	3665018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13131	NC_004631	GCG	2	6	3665036	3665041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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13133	NC_004631	CGGA	2	8	3665063	3665070	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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13155	NC_004631	A	6	6	3665846	3665851	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13161	NC_004631	AATA	2	8	3667820	3667827	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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