MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. Ty2 chromosome

Total Repeats: 17242

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_004631	CAG	2	6	3487616	3487621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12502	NC_004631	A	6	6	3489596	3489601	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12503	NC_004631	AAT	2	6	3490005	3490010	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12504	NC_004631	GGC	2	6	3490301	3490306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12505	NC_004631	GTCG	2	8	3490343	3490350	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
12506	NC_004631	TGT	2	6	3491874	3491879	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12507	NC_004631	ACA	2	6	3491937	3491942	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12508	NC_004631	AT	3	6	3491964	3491969	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12509	NC_004631	GTCT	2	8	3492013	3492020	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
12510	NC_004631	CAC	2	6	3493693	3493698	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12511	NC_004631	AAATG	2	10	3493734	3493743	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
12512	NC_004631	ATA	2	6	3493789	3493794	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12513	NC_004631	ACTTT	2	10	3493811	3493820	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
12514	NC_004631	TAC	2	6	3497318	3497323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12515	NC_004631	GCC	2	6	3497351	3497356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12516	NC_004631	ATT	2	6	3497371	3497376	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12517	NC_004631	TATT	2	8	3497395	3497402	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12518	NC_004631	CGT	2	6	3500266	3500271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12519	NC_004631	CTC	2	6	3500314	3500319	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12520	NC_004631	A	8	8	3500338	3500345	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12521	NC_004631	T	7	7	3500567	3500573	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12522	NC_004631	T	6	6	3500618	3500623	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12523	NC_004631	TCC	2	6	3500660	3500665	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12524	NC_004631	CTT	2	6	3500696	3500701	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12525	NC_004631	TTC	2	6	3500718	3500723	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12526	NC_004631	A	6	6	3500777	3500782	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12527	NC_004631	TCT	2	6	3500807	3500812	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12528	NC_004631	AGG	2	6	3500834	3500839	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12529	NC_004631	TGG	2	6	3501099	3501104	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12530	NC_004631	GTG	2	6	3501108	3501113	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12531	NC_004631	TTA	2	6	3501115	3501120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12532	NC_004631	AG	3	6	3502188	3502193	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12533	NC_004631	TGTA	2	8	3502203	3502210	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
12534	NC_004631	TTTTA	2	10	3502327	3502336	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
12535	NC_004631	TAA	2	6	3502503	3502508	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12536	NC_004631	A	6	6	3502530	3502535	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12537	NC_004631	TCC	2	6	3502555	3502560	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12538	NC_004631	ATC	2	6	3503233	3503238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12539	NC_004631	CAT	2	6	3503257	3503262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12540	NC_004631	CAT	2	6	3504048	3504053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12541	NC_004631	GCT	2	6	3504061	3504066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12542	NC_004631	AAAGC	2	10	3504070	3504079	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
12543	NC_004631	CCG	2	6	3504815	3504820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12544	NC_004631	TAA	2	6	3508607	3508612	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12545	NC_004631	TGA	2	6	3508630	3508635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12546	NC_004631	A	7	7	3508640	3508646	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12547	NC_004631	ATT	2	6	3508664	3508669	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12548	NC_004631	AGG	2	6	3508724	3508729	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12549	NC_004631	GTT	2	6	3508993	3508998	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12550	NC_004631	ATT	2	6	3509312	3509317	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12551	NC_004631	AT	4	8	3509355	3509362	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12552	NC_004631	ATT	2	6	3509397	3509402	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12553	NC_004631	A	7	7	3510222	3510228	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12554	NC_004631	AAT	2	6	3510379	3510384	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12555	NC_004631	TTC	2	6	3510429	3510434	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12556	NC_004631	CTG	2	6	3510443	3510448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12557	NC_004631	GT	3	6	3510534	3510539	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12558	NC_004631	TCATG	2	10	3510587	3510596	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
12559	NC_004631	TGC	2	6	3510605	3510610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12560	NC_004631	TCATG	2	10	3510676	3510685	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
12561	NC_004631	GC	4	8	3510737	3510744	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12562	NC_004631	TA	3	6	3510761	3510766	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12563	NC_004631	TTGAT	2	10	3510767	3510776	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
12564	NC_004631	ATC	2	6	3510804	3510809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12565	NC_004631	TAA	2	6	3510810	3510815	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12566	NC_004631	CCA	2	6	3512553	3512558	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12567	NC_004631	TTA	2	6	3512573	3512578	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12568	NC_004631	TGAA	2	8	3515398	3515405	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
12569	NC_004631	TG	3	6	3515426	3515431	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12570	NC_004631	T	6	6	3515499	3515504	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12571	NC_004631	GGC	2	6	3518106	3518111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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12574	NC_004631	GCA	2	6	3521356	3521361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12575	NC_004631	GCC	2	6	3521364	3521369	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12576	NC_004631	TTC	2	6	3521371	3521376	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12577	NC_004631	CACGC	2	10	3526403	3526412	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
12578	NC_004631	CTGA	2	8	3526472	3526479	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12579	NC_004631	ACTG	2	8	3526497	3526504	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12580	NC_004631	AT	3	6	3526591	3526596	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12592	NC_004631	A	6	6	3534706	3534711	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12593	NC_004631	AGC	2	6	3534797	3534802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12595	NC_004631	TTA	2	6	3536123	3536128	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12598	NC_004631	GGA	2	6	3536761	3536766	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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12601	NC_004631	AAAAC	2	10	3537181	3537190	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
12602	NC_004631	AAT	2	6	3537209	3537214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12603	NC_004631	A	9	9	3538132	3538140	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12604	NC_004631	ATT	2	6	3538160	3538165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12605	NC_004631	GA	3	6	3538179	3538184	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12606	NC_004631	ACGG	2	8	3538259	3538266	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
12607	NC_004631	CAGG	2	8	3538294	3538301	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
12608	NC_004631	ACC	2	6	3538476	3538481	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12609	NC_004631	GCC	2	6	3538490	3538495	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12610	NC_004631	TC	3	6	3538569	3538574	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12611	NC_004631	AC	3	6	3538656	3538661	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12612	NC_004631	CGT	3	9	3538674	3538682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12615	NC_004631	ACG	2	6	3538909	3538914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12627	NC_004631	CAGC	2	8	3539735	3539742	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
12628	NC_004631	TC	3	6	3539851	3539856	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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