MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. Ty2 chromosome

Total Repeats: 17242

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_004631	GC	3	6	3186116	3186121	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11502	NC_004631	A	6	6	3186132	3186137	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11503	NC_004631	GAT	2	6	3186144	3186149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11504	NC_004631	CGG	2	6	3186227	3186232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11505	NC_004631	A	6	6	3186246	3186251	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11506	NC_004631	GGCGTA	2	12	3186318	3186329	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
11507	NC_004631	ACG	2	6	3186403	3186408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11508	NC_004631	GATGC	2	10	3186853	3186862	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
11509	NC_004631	GCG	2	6	3186915	3186920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11510	NC_004631	CAA	2	6	3186941	3186946	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11511	NC_004631	ATTG	2	8	3188862	3188869	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
11512	NC_004631	ACG	2	6	3190297	3190302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11513	NC_004631	TAA	2	6	3190304	3190309	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11514	NC_004631	AAT	2	6	3191372	3191377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11515	NC_004631	ATG	2	6	3191384	3191389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11516	NC_004631	GGT	2	6	3191399	3191404	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11517	NC_004631	CTG	2	6	3191408	3191413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11518	NC_004631	ATT	2	6	3191507	3191512	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11519	NC_004631	CAA	2	6	3191546	3191551	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11520	NC_004631	GAA	2	6	3191563	3191568	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11521	NC_004631	GCG	2	6	3193088	3193093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11522	NC_004631	CCG	2	6	3193148	3193153	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11523	NC_004631	TGT	2	6	3193209	3193214	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11524	NC_004631	GAA	2	6	3195993	3195998	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11525	NC_004631	ATG	2	6	3196010	3196015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11526	NC_004631	ATC	2	6	3196019	3196024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11527	NC_004631	AAAT	2	8	3197189	3197196	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11528	NC_004631	GTG	2	6	3197217	3197222	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11529	NC_004631	AAT	2	6	3197229	3197234	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11530	NC_004631	CTA	2	6	3197315	3197320	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11531	NC_004631	ACTC	2	8	3197324	3197331	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
11532	NC_004631	A	6	6	3197340	3197345	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11533	NC_004631	CAT	2	6	3197381	3197386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11534	NC_004631	TAT	2	6	3197421	3197426	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11535	NC_004631	TAT	2	6	3197453	3197458	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11536	NC_004631	TA	3	6	3197471	3197476	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11537	NC_004631	AT	3	6	3197482	3197487	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11538	NC_004631	AAT	2	6	3200724	3200729	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11539	NC_004631	TCG	2	6	3200747	3200752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11540	NC_004631	A	6	6	3200790	3200795	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11541	NC_004631	T	6	6	3200816	3200821	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11542	NC_004631	A	7	7	3201562	3201568	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11543	NC_004631	CTG	2	6	3201652	3201657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11544	NC_004631	TGA	2	6	3201728	3201733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11545	NC_004631	CCG	2	6	3201760	3201765	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11546	NC_004631	CGCCC	2	10	3201777	3201786	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
11547	NC_004631	TCA	2	6	3201826	3201831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11548	NC_004631	CA	3	6	3201854	3201859	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11549	NC_004631	AAT	2	6	3202267	3202272	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11550	NC_004631	CGG	2	6	3202578	3202583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11551	NC_004631	ACG	2	6	3202641	3202646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11552	NC_004631	GGC	2	6	3202746	3202751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11553	NC_004631	GAT	2	6	3203410	3203415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11554	NC_004631	T	7	7	3205129	3205135	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11555	NC_004631	T	6	6	3205139	3205144	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11556	NC_004631	CAG	2	6	3205173	3205178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11557	NC_004631	CGG	2	6	3205213	3205218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11558	NC_004631	CAA	2	6	3205251	3205256	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11559	NC_004631	TAA	2	6	3205311	3205316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11560	NC_004631	ATG	2	6	3205327	3205332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11561	NC_004631	TCA	2	6	3205340	3205345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11562	NC_004631	G	6	6	3205399	3205404	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
11563	NC_004631	CTTTA	2	10	3205429	3205438	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
11564	NC_004631	A	8	8	3205444	3205451	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11565	NC_004631	TGA	2	6	3205533	3205538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11566	NC_004631	GA	3	6	3206991	3206996	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11567	NC_004631	GC	3	6	3207007	3207012	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11568	NC_004631	ATA	2	6	3207014	3207019	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11569	NC_004631	AAT	2	6	3209888	3209893	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11570	NC_004631	GGC	2	6	3209901	3209906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11571	NC_004631	TCA	2	6	3209962	3209967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11572	NC_004631	ATT	2	6	3211347	3211352	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11573	NC_004631	GAT	2	6	3211443	3211448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11574	NC_004631	GAT	2	6	3212181	3212186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11575	NC_004631	GCGCT	2	10	3213480	3213489	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
11576	NC_004631	CGC	2	6	3213529	3213534	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11577	NC_004631	ATC	2	6	3213550	3213555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11578	NC_004631	AT	3	6	3214431	3214436	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11579	NC_004631	A	6	6	3214450	3214455	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11580	NC_004631	ATT	2	6	3214462	3214467	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11581	NC_004631	TAT	2	6	3214887	3214892	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11582	NC_004631	TAAA	2	8	3214905	3214912	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11583	NC_004631	CCG	2	6	3215646	3215651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11584	NC_004631	CG	3	6	3215650	3215655	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11585	NC_004631	CCA	2	6	3215664	3215669	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11586	NC_004631	TGC	2	6	3215710	3215715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11587	NC_004631	TGT	2	6	3215731	3215736	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11588	NC_004631	ATG	2	6	3215775	3215780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11589	NC_004631	CGC	2	6	3215803	3215808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11590	NC_004631	CTCC	2	8	3216897	3216904	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
11591	NC_004631	A	6	6	3216924	3216929	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11592	NC_004631	AGC	3	9	3216948	3216956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11593	NC_004631	GCT	2	6	3217271	3217276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11594	NC_004631	AGTTGT	2	12	3217291	3217302	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11595	NC_004631	TCAT	2	8	3217367	3217374	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11596	NC_004631	GGC	2	6	3217385	3217390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11597	NC_004631	AG	3	6	3217392	3217397	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11598	NC_004631	GAA	2	6	3217465	3217470	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11599	NC_004631	CGC	3	9	3221254	3221262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11600	NC_004631	GGC	2	6	3221265	3221270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11601	NC_004631	T	7	7	3221272	3221278	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11602	NC_004631	CAG	2	6	3222051	3222056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11603	NC_004631	CCA	2	6	3222060	3222065	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11604	NC_004631	T	6	6	3222112	3222117	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11605	NC_004631	AT	3	6	3222937	3222942	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11606	NC_004631	AATGAT	2	12	3222959	3222970	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11607	NC_004631	T	6	6	3222995	3223000	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11608	NC_004631	CAT	2	6	3223099	3223104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11609	NC_004631	AT	3	6	3223120	3223125	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11610	NC_004631	ATG	2	6	3223144	3223149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11611	NC_004631	AAT	2	6	3225404	3225409	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11612	NC_004631	ATT	2	6	3225451	3225456	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11613	NC_004631	TAAT	2	8	3225459	3225466	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11614	NC_004631	TAA	2	6	3225514	3225519	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11615	NC_004631	GAAA	2	8	3225521	3225528	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
11616	NC_004631	TTAT	2	8	3225552	3225559	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11617	NC_004631	AATA	2	8	3225602	3225609	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11618	NC_004631	ATT	2	6	3225614	3225619	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11619	NC_004631	CT	3	6	3225643	3225648	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11620	NC_004631	ATG	2	6	3225649	3225654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11621	NC_004631	TTG	2	6	3225696	3225701	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11622	NC_004631	CTAC	2	8	3225728	3225735	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
11623	NC_004631	GTT	2	6	3227342	3227347	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11624	NC_004631	CGC	3	9	3227491	3227499	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11625	NC_004631	AC	3	6	3227507	3227512	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11626	NC_004631	TGT	2	6	3227573	3227578	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11627	NC_004631	ATT	2	6	3227588	3227593	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11629	NC_004631	CAC	2	6	3229152	3229157	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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