MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. Ty2 chromosome

Total Repeats: 17242

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10501	NC_004631	AAT	2	6	2889572	2889577	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10502	NC_004631	TTC	2	6	2889578	2889583	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10503	NC_004631	AAT	2	6	2890884	2890889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10504	NC_004631	CGGA	2	8	2891847	2891854	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10505	NC_004631	TTG	2	6	2894325	2894330	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10506	NC_004631	CAC	2	6	2895926	2895931	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10507	NC_004631	CGC	2	6	2895943	2895948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10508	NC_004631	AGCG	2	8	2895985	2895992	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10509	NC_004631	CAG	2	6	2895995	2896000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10510	NC_004631	TGC	2	6	2896047	2896052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10511	NC_004631	CAGC	2	8	2896060	2896067	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10512	NC_004631	CTGA	2	8	2896115	2896122	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10513	NC_004631	CG	3	6	2896156	2896161	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10514	NC_004631	GC	3	6	2896178	2896183	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10515	NC_004631	TGT	2	6	2896209	2896214	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10516	NC_004631	CTG	2	6	2896229	2896234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10517	NC_004631	CG	3	6	2896271	2896276	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10518	NC_004631	CCG	2	6	2896362	2896367	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10519	NC_004631	TCCT	2	8	2896451	2896458	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10520	NC_004631	TCA	2	6	2896500	2896505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10521	NC_004631	CGC	2	6	2896525	2896530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10522	NC_004631	TGCGCC	2	12	2896539	2896550	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
10523	NC_004631	CGC	2	6	2896617	2896622	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10524	NC_004631	CGC	2	6	2896669	2896674	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10525	NC_004631	CGC	2	6	2896718	2896723	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10526	NC_004631	TCA	2	6	2896786	2896791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10527	NC_004631	GGC	2	6	2896835	2896840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10528	NC_004631	GAC	2	6	2896844	2896849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10529	NC_004631	ACG	2	6	2896869	2896874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10530	NC_004631	CTGGCG	2	12	2896887	2896898	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
10531	NC_004631	C	6	6	2896957	2896962	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
10532	NC_004631	GC	3	6	2896977	2896982	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10533	NC_004631	CCCATT	2	12	2897001	2897012	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
10534	NC_004631	TGT	2	6	2897051	2897056	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10535	NC_004631	GTT	2	6	2897136	2897141	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10536	NC_004631	A	6	6	2897146	2897151	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10537	NC_004631	T	6	6	2897167	2897172	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10538	NC_004631	AAAG	2	8	2897239	2897246	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
10539	NC_004631	T	6	6	2898493	2898498	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10540	NC_004631	ACGA	2	8	2898591	2898598	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10541	NC_004631	GAT	2	6	2900644	2900649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10542	NC_004631	CCG	2	6	2901974	2901979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10543	NC_004631	A	6	6	2903116	2903121	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10544	NC_004631	AAC	2	6	2903129	2903134	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10545	NC_004631	TCA	2	6	2903244	2903249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10547	NC_004631	TTG	2	6	2907349	2907354	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10548	NC_004631	GGT	2	6	2907762	2907767	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10549	NC_004631	T	6	6	2910742	2910747	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10550	NC_004631	TGAA	2	8	2910790	2910797	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10551	NC_004631	AGT	2	6	2910814	2910819	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10552	NC_004631	A	6	6	2910856	2910861	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10553	NC_004631	CAGA	2	8	2912084	2912091	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10554	NC_004631	AC	3	6	2912118	2912123	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10555	NC_004631	CGC	3	9	2912137	2912145	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10556	NC_004631	CCG	2	6	2912211	2912216	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10557	NC_004631	GC	3	6	2912271	2912276	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10558	NC_004631	A	6	6	2912308	2912313	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10559	NC_004631	T	6	6	2912482	2912487	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10560	NC_004631	A	6	6	2912495	2912500	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10561	NC_004631	CCA	2	6	2912502	2912507	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10562	NC_004631	ATT	2	6	2916269	2916274	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10563	NC_004631	TATT	2	8	2918444	2918451	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10564	NC_004631	TACC	2	8	2918469	2918476	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
10565	NC_004631	TAC	2	6	2918528	2918533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10566	NC_004631	ATAA	2	8	2918554	2918561	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10567	NC_004631	T	6	6	2918594	2918599	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10568	NC_004631	A	7	7	2918709	2918715	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10569	NC_004631	TAT	2	6	2918741	2918746	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10570	NC_004631	CCT	2	6	2918765	2918770	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10571	NC_004631	A	6	6	2918775	2918780	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10572	NC_004631	TTA	2	6	2921516	2921521	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10573	NC_004631	TCTA	2	8	2921552	2921559	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10574	NC_004631	TTAA	2	8	2921581	2921588	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10575	NC_004631	ACT	2	6	2921594	2921599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10577	NC_004631	TC	3	6	2921618	2921623	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10578	NC_004631	CCAT	2	8	2921634	2921641	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
10579	NC_004631	A	7	7	2921658	2921664	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10580	NC_004631	GCG	2	6	2921674	2921679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10581	NC_004631	ATC	2	6	2921681	2921686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10583	NC_004631	ACCA	2	8	2921723	2921730	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10584	NC_004631	TC	3	6	2921763	2921768	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10585	NC_004631	GTA	2	6	2921771	2921776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10587	NC_004631	A	6	6	2921794	2921799	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10588	NC_004631	AT	3	6	2921814	2921819	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10589	NC_004631	AAT	2	6	2921836	2921841	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10592	NC_004631	TGCCT	2	10	2923654	2923663	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
10593	NC_004631	AAG	2	6	2927443	2927448	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10594	NC_004631	TTA	2	6	2927497	2927502	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10595	NC_004631	ATTG	2	8	2927523	2927530	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
10596	NC_004631	ATT	2	6	2927534	2927539	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10597	NC_004631	AATT	2	8	2927560	2927567	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10598	NC_004631	A	6	6	2927605	2927610	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10599	NC_004631	T	7	7	2927636	2927642	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10600	NC_004631	TCA	2	6	2927656	2927661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10601	NC_004631	ACG	2	6	2928073	2928078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10602	NC_004631	GC	3	6	2928103	2928108	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10603	NC_004631	TTTAC	2	10	2928954	2928963	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
10604	NC_004631	AGC	2	6	2928972	2928977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10605	NC_004631	GATTAT	2	12	2928993	2929004	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10606	NC_004631	TTG	2	6	2929018	2929023	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10607	NC_004631	AC	3	6	2929094	2929099	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10608	NC_004631	ACT	2	6	2929123	2929128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10609	NC_004631	CAC	2	6	2929138	2929143	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10610	NC_004631	ATA	2	6	2929155	2929160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10611	NC_004631	CAA	2	6	2929162	2929167	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10612	NC_004631	ATT	2	6	2929173	2929178	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10613	NC_004631	A	6	6	2929209	2929214	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10614	NC_004631	T	6	6	2929228	2929233	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10615	NC_004631	ACGGCA	2	12	2929357	2929368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10616	NC_004631	CCGT	2	8	2929371	2929378	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10617	NC_004631	TAA	2	6	2929384	2929389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10619	NC_004631	A	7	7	2930153	2930159	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10620	NC_004631	CCG	2	6	2930161	2930166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10621	NC_004631	CCG	2	6	2931565	2931570	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10622	NC_004631	T	6	6	2931578	2931583	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10623	NC_004631	ATT	2	6	2933310	2933315	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10624	NC_004631	CCT	2	6	2933316	2933321	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10625	NC_004631	CA	3	6	2933340	2933345	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10626	NC_004631	GGGA	2	8	2933346	2933353	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
10627	NC_004631	A	6	6	2933409	2933414	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10628	NC_004631	CA	3	6	2933416	2933421	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10629	NC_004631	TAT	2	6	2934288	2934293	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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