MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. Ty2 chromosome

Total Repeats: 17242

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_004631	AAAT	2	8	2740347	2740354	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10002	NC_004631	A	6	6	2740358	2740363	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10003	NC_004631	T	6	6	2740384	2740389	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10004	NC_004631	A	6	6	2740435	2740440	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10005	NC_004631	C	6	6	2740473	2740478	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
10006	NC_004631	CGGA	2	8	2740526	2740533	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10007	NC_004631	T	6	6	2740582	2740587	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10008	NC_004631	T	7	7	2740982	2740988	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10009	NC_004631	GGA	2	6	2742277	2742282	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10010	NC_004631	T	7	7	2744992	2744998	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10011	NC_004631	AATCA	2	10	2745108	2745117	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
10012	NC_004631	A	9	9	2745117	2745125	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10013	NC_004631	T	6	6	2745127	2745132	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10014	NC_004631	TG	3	6	2745138	2745143	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10015	NC_004631	GAT	2	6	2745155	2745160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10016	NC_004631	GAA	2	6	2745201	2745206	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10017	NC_004631	ATT	2	6	2745228	2745233	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10018	NC_004631	CAC	2	6	2745234	2745239	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10019	NC_004631	A	8	8	2745299	2745306	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10020	NC_004631	T	6	6	2745307	2745312	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10021	NC_004631	TTTCA	2	10	2745350	2745359	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
10022	NC_004631	CAATA	2	10	2745437	2745446	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
10023	NC_004631	AAAT	2	8	2745472	2745479	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10024	NC_004631	T	6	6	2745506	2745511	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10025	NC_004631	GGC	2	6	2745522	2745527	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10026	NC_004631	GGC	2	6	2745533	2745538	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10027	NC_004631	CTA	2	6	2745562	2745567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10028	NC_004631	AGCGCA	2	12	2746530	2746541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10029	NC_004631	CTAA	2	8	2746547	2746554	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10030	NC_004631	A	6	6	2746557	2746562	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10031	NC_004631	AAC	2	6	2746564	2746569	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10032	NC_004631	AAT	2	6	2747010	2747015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10033	NC_004631	ATT	2	6	2747024	2747029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10034	NC_004631	GAA	2	6	2747061	2747066	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10035	NC_004631	CCT	2	6	2753914	2753919	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10036	NC_004631	CA	3	6	2753993	2753998	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10037	NC_004631	AAT	2	6	2754026	2754031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10038	NC_004631	AAT	2	6	2754035	2754040	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10039	NC_004631	GAT	2	6	2754640	2754645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10040	NC_004631	GTTC	2	8	2754763	2754770	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
10041	NC_004631	TAC	2	6	2754835	2754840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10042	NC_004631	GCC	2	6	2754920	2754925	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10043	NC_004631	TAC	2	6	2754961	2754966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10044	NC_004631	TAA	2	6	2755041	2755046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10045	NC_004631	CG	3	6	2755110	2755115	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10046	NC_004631	CTC	2	6	2755153	2755158	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10047	NC_004631	A	6	6	2755176	2755181	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10048	NC_004631	TCA	2	6	2755182	2755187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10049	NC_004631	TATT	2	8	2755203	2755210	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10050	NC_004631	ATT	2	6	2755237	2755242	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10051	NC_004631	GA	4	8	2755280	2755287	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10052	NC_004631	GGC	2	6	2756436	2756441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10053	NC_004631	AGG	2	6	2756483	2756488	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10054	NC_004631	AAAG	2	8	2760173	2760180	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
10055	NC_004631	GCG	2	6	2762495	2762500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10056	NC_004631	AAT	2	6	2764699	2764704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10057	NC_004631	TA	3	6	2764756	2764761	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10058	NC_004631	ATT	2	6	2764765	2764770	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10059	NC_004631	ATA	2	6	2764785	2764790	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10060	NC_004631	CT	3	6	2764874	2764879	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10061	NC_004631	ATAAA	2	10	2764962	2764971	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
10062	NC_004631	ATA	2	6	2764994	2764999	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10063	NC_004631	TGT	2	6	2765294	2765299	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10064	NC_004631	T	6	6	2765355	2765360	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10065	NC_004631	TCC	2	6	2765393	2765398	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10066	NC_004631	CTTAGG	2	12	2765440	2765451	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
10067	NC_004631	G	8	8	2765450	2765457	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
10068	NC_004631	TAA	3	9	2765614	2765622	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10069	NC_004631	AAT	2	6	2765634	2765639	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10070	NC_004631	CTA	2	6	2765650	2765655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10071	NC_004631	AG	4	8	2766779	2766786	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10072	NC_004631	ACG	2	6	2766877	2766882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10073	NC_004631	AAAT	2	8	2766913	2766920	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10074	NC_004631	AT	3	6	2766919	2766924	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10075	NC_004631	TGC	2	6	2766957	2766962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10076	NC_004631	ACTT	2	8	2766986	2766993	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10077	NC_004631	TCGC	2	8	2767012	2767019	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10078	NC_004631	GCC	2	6	2767022	2767027	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10079	NC_004631	ATT	2	6	2767042	2767047	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10080	NC_004631	ATT	2	6	2767060	2767065	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10081	NC_004631	ATA	2	6	2767070	2767075	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10082	NC_004631	TAC	2	6	2767095	2767100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10086	NC_004631	CTT	2	6	2767206	2767211	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10087	NC_004631	AGT	2	6	2767266	2767271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10088	NC_004631	GTA	2	6	2767278	2767283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10089	NC_004631	TCAT	2	8	2768341	2768348	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10090	NC_004631	ATCTTA	2	12	2768361	2768372	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10091	NC_004631	A	7	7	2768456	2768462	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10092	NC_004631	T	6	6	2769427	2769432	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10093	NC_004631	A	6	6	2769468	2769473	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10094	NC_004631	A	6	6	2769494	2769499	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10095	NC_004631	ACC	2	6	2769507	2769512	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10096	NC_004631	TG	4	8	2769635	2769642	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10097	NC_004631	GAT	3	9	2769666	2769674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10098	NC_004631	TCT	2	6	2769693	2769698	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10099	NC_004631	AAC	2	6	2769795	2769800	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10100	NC_004631	ACA	2	6	2769864	2769869	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10101	NC_004631	ATTAT	2	10	2769910	2769919	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
10102	NC_004631	GAA	2	6	2770044	2770049	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10103	NC_004631	ATCA	2	8	2770119	2770126	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10104	NC_004631	CAA	2	6	2770169	2770174	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10105	NC_004631	AGC	2	6	2770179	2770184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10106	NC_004631	CAT	2	6	2770285	2770290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10107	NC_004631	GCG	2	6	2770344	2770349	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10108	NC_004631	TTATA	2	10	2770357	2770366	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
10109	NC_004631	CGG	2	6	2770453	2770458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10110	NC_004631	ATC	2	6	2770476	2770481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10111	NC_004631	AG	3	6	2770489	2770494	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10112	NC_004631	GCT	2	6	2770509	2770514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10113	NC_004631	CAACC	2	10	2770532	2770541	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
10114	NC_004631	AAACG	2	10	2770611	2770620	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
10115	NC_004631	TCA	2	6	2770639	2770644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10116	NC_004631	CGC	2	6	2770684	2770689	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10117	NC_004631	GCC	2	6	2770708	2770713	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10118	NC_004631	CAG	2	6	2770754	2770759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10119	NC_004631	A	7	7	2770760	2770766	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10120	NC_004631	CAA	2	6	2770843	2770848	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10121	NC_004631	A	7	7	2770891	2770897	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10122	NC_004631	CTG	2	6	2770925	2770930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10123	NC_004631	TGA	2	6	2771040	2771045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10124	NC_004631	AAGA	2	8	2771090	2771097	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
10125	NC_004631	CGT	2	6	2771115	2771120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10126	NC_004631	ATT	2	6	2771129	2771134	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10127	NC_004631	TTAA	2	8	2771159	2771166	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10128	NC_004631	ATG	2	6	2774322	2774327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10130	NC_004631	TGT	2	6	2776446	2776451	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10250	NC_004631	ATT	2	6	2795596	2795601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10255	NC_004631	GAA	2	6	2795816	2795821	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10256	NC_004631	ATT	2	6	2795837	2795842	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10257	NC_004631	G	6	6	2795878	2795883	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
10258	NC_004631	AAC	2	6	2797016	2797021	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10376	NC_004631	A	6	6	2848808	2848813	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10384	NC_004631	ATGT	2	8	2849812	2849819	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
10385	NC_004631	A	7	7	2849898	2849904	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10386	NC_004631	AAT	2	6	2849944	2849949	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10390	NC_004631	T	7	7	2850933	2850939	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10391	NC_004631	ATT	2	6	2850940	2850945	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10392	NC_004631	AAT	2	6	2850952	2850957	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10394	NC_004631	TAA	2	6	2851082	2851087	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10395	NC_004631	AGAT	2	8	2851104	2851111	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10396	NC_004631	ATT	2	6	2851136	2851141	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10397	NC_004631	AT	3	6	2851147	2851152	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10398	NC_004631	G	6	6	2851184	2851189	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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10400	NC_004631	AGC	2	6	2855415	2855420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10491	NC_004631	CCCT	2	8	2885772	2885779	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
10492	NC_004631	TCA	2	6	2885862	2885867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10497	NC_004631	ATGA	2	8	2886592	2886599	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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10499	NC_004631	C	12	12	2889525	2889536	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
10500	NC_004631	CGC	2	6	2889557	2889562	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding

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