MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. Ty2 chromosome

Total Repeats: 17242

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_004631	CCCAA	2	10	139583	139592	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
502	NC_004631	ATC	2	6	139594	139599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
503	NC_004631	T	8	8	139608	139615	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
504	NC_004631	CGG	2	6	140752	140757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
505	NC_004631	CT	4	8	140765	140772	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
506	NC_004631	GCC	2	6	140776	140781	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
507	NC_004631	CAAA	2	8	140784	140791	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
508	NC_004631	AAT	2	6	140817	140822	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
509	NC_004631	ATT	2	6	140827	140832	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
510	NC_004631	T	6	6	140855	140860	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
511	NC_004631	CTTT	2	8	140866	140873	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
512	NC_004631	TTGTT	2	10	140930	140939	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
513	NC_004631	TCG	2	6	140956	140961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
514	NC_004631	CGG	2	6	141136	141141	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
515	NC_004631	T	7	7	141153	141159	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
516	NC_004631	GC	3	6	141191	141196	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
517	NC_004631	T	6	6	141241	141246	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
518	NC_004631	CTTG	2	8	141266	141273	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
519	NC_004631	TCC	2	6	141283	141288	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
520	NC_004631	AAG	2	6	141333	141338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
521	NC_004631	AAT	2	6	152472	152477	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
522	NC_004631	GCC	2	6	157038	157043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
523	NC_004631	GA	4	8	157078	157085	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
524	NC_004631	CCG	2	6	158286	158291	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
525	NC_004631	CT	3	6	159300	159305	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
526	NC_004631	T	10	10	159326	159335	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
527	NC_004631	CTG	2	6	159447	159452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
528	NC_004631	A	6	6	160038	160043	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
529	NC_004631	CGCGG	2	10	160069	160078	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
530	NC_004631	GGTC	2	8	162848	162855	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
531	NC_004631	ATT	2	6	162865	162870	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
532	NC_004631	T	6	6	162938	162943	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
533	NC_004631	GGCA	2	8	164405	164412	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
534	NC_004631	CTA	2	6	167047	167052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
535	NC_004631	A	7	7	167084	167090	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_004631	CTGG	2	8	168238	168245	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
537	NC_004631	ACG	2	6	171445	171450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
538	NC_004631	AGC	2	6	172456	172461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
539	NC_004631	CAC	2	6	172468	172473	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
540	NC_004631	TGC	2	6	173932	173937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
541	NC_004631	GAT	2	6	176372	176377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
542	NC_004631	ATT	2	6	176385	176390	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
543	NC_004631	T	8	8	176402	176409	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
544	NC_004631	CGC	2	6	176424	176429	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
545	NC_004631	AGT	2	6	177946	177951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
546	NC_004631	GT	3	6	177954	177959	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
547	NC_004631	ATTT	2	8	177987	177994	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
548	NC_004631	T	6	6	178004	178009	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
549	NC_004631	AAT	2	6	178043	178048	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
550	NC_004631	TGA	2	6	178086	178091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
551	NC_004631	AAAG	2	8	178104	178111	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
552	NC_004631	CCT	2	6	178124	178129	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
553	NC_004631	ATT	2	6	178167	178172	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
554	NC_004631	CTG	2	6	178195	178200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
555	NC_004631	T	6	6	178221	178226	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_004631	CCT	2	6	178251	178256	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
557	NC_004631	CCT	2	6	178328	178333	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
558	NC_004631	TCAA	2	8	178343	178350	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
559	NC_004631	AGA	2	6	179241	179246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
560	NC_004631	TGT	2	6	179247	179252	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
561	NC_004631	TTA	2	6	179299	179304	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
562	NC_004631	TAGA	2	8	179355	179362	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
563	NC_004631	CGGC	2	8	183963	183970	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
564	NC_004631	T	8	8	183971	183978	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
565	NC_004631	TTA	2	6	184003	184008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
566	NC_004631	TGT	2	6	184035	184040	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
567	NC_004631	GAT	2	6	184093	184098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
568	NC_004631	CCG	2	6	184119	184124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
569	NC_004631	T	7	7	185625	185631	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
570	NC_004631	ATG	2	6	185657	185662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
571	NC_004631	GCA	2	6	185699	185704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
572	NC_004631	TGTC	2	8	185742	185749	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
573	NC_004631	TCA	2	6	185798	185803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
574	NC_004631	ATA	2	6	185828	185833	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
575	NC_004631	TC	3	6	188612	188617	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
576	NC_004631	TGCC	2	8	188647	188654	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
577	NC_004631	T	6	6	188824	188829	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
578	NC_004631	T	6	6	188837	188842	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
579	NC_004631	CTA	2	6	188907	188912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
580	NC_004631	ACT	2	6	188913	188918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
581	NC_004631	CAA	2	6	188950	188955	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
582	NC_004631	GAG	2	6	188982	188987	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
583	NC_004631	TCG	2	6	188991	188996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
584	NC_004631	GGC	2	6	191644	191649	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
585	NC_004631	CTG	2	6	191710	191715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
586	NC_004631	T	7	7	191723	191729	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
587	NC_004631	GCT	2	6	191737	191742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
588	NC_004631	CT	3	6	192146	192151	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
589	NC_004631	CAC	2	6	192211	192216	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
590	NC_004631	T	6	6	192242	192247	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
591	NC_004631	T	6	6	192260	192265	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
592	NC_004631	TTA	2	6	192271	192276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
593	NC_004631	TTGA	2	8	192318	192325	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
594	NC_004631	CAA	2	6	192354	192359	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
595	NC_004631	GTG	2	6	196371	196376	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
596	NC_004631	CCT	2	6	197183	197188	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
597	NC_004631	A	7	7	198084	198090	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
598	NC_004631	CAT	2	6	198099	198104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
599	NC_004631	ATT	2	6	198133	198138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
600	NC_004631	GGA	2	6	198155	198160	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
601	NC_004631	CGA	2	6	198561	198566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
602	NC_004631	TAT	2	6	198571	198576	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
603	NC_004631	TTG	2	6	198603	198608	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
604	NC_004631	T	6	6	202815	202820	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
605	NC_004631	TG	3	6	202848	202853	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
606	NC_004631	TCA	2	6	202858	202863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
607	NC_004631	GAAT	2	8	202892	202899	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
608	NC_004631	GCG	2	6	202936	202941	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
609	NC_004631	TTA	2	6	202942	202947	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
610	NC_004631	ATT	2	6	204309	204314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
611	NC_004631	AT	3	6	204321	204326	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
612	NC_004631	AAGT	2	8	204343	204350	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
613	NC_004631	TCA	2	6	206101	206106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
614	NC_004631	ACT	2	6	206130	206135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
615	NC_004631	AGG	2	6	206145	206150	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
616	NC_004631	GAC	2	6	206609	206614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
617	NC_004631	T	6	6	206636	206641	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
618	NC_004631	TGA	2	6	209246	209251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
619	NC_004631	GCGCT	2	10	209264	209273	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
620	NC_004631	CGCGT	2	10	209316	209325	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
621	NC_004631	ATA	2	6	210158	210163	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
622	NC_004631	TGA	2	6	210165	210170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
623	NC_004631	TTGCG	2	10	210229	210238	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
624	NC_004631	TAA	2	6	211450	211455	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
625	NC_004631	TTC	2	6	215834	215839	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
626	NC_004631	TTC	2	6	215876	215881	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
627	NC_004631	AGA	2	6	216656	216661	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
628	NC_004631	TGAA	2	8	216692	216699	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
629	NC_004631	AAT	2	6	216716	216721	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
630	NC_004631	TTA	2	6	216792	216797	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
631	NC_004631	TAA	2	6	217429	217434	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
632	NC_004631	TAT	2	6	217510	217515	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
633	NC_004631	TTA	2	6	217516	217521	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
634	NC_004631	T	6	6	217529	217534	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
635	NC_004631	TTA	2	6	217590	217595	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
636	NC_004631	GT	3	6	217611	217616	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
637	NC_004631	T	6	6	217641	217646	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
638	NC_004631	AT	3	6	217662	217667	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
639	NC_004631	TA	3	6	217683	217688	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
640	NC_004631	ATT	2	6	217708	217713	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
641	NC_004631	ATTTA	2	10	217726	217735	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
642	NC_004631	TTG	2	6	217769	217774	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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644	NC_004631	TAA	2	6	219695	219700	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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649	NC_004631	ACGC	2	8	221386	221393	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
650	NC_004631	TAA	2	6	221406	221411	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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772	NC_004631	AAC	2	6	251068	251073	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
773	NC_004631	AC	4	8	251072	251079	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
774	NC_004631	GGC	2	6	251938	251943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
775	NC_004631	GTA	2	6	252051	252056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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