MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. Ty2 chromosome

Total Repeats: 17242

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
9001	NC_004631	GCGT	2	8	2530018	2530025	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
9002	NC_004631	CCG	2	6	2530031	2530036	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9003	NC_004631	TCA	2	6	2530070	2530075	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9004	NC_004631	CGAT	2	8	2530094	2530101	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
9005	NC_004631	ATTG	2	8	2530118	2530125	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
9006	NC_004631	CCCT	2	8	2530153	2530160	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
9007	NC_004631	ATT	2	6	2530205	2530210	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9008	NC_004631	T	6	6	2530850	2530855	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9009	NC_004631	TAT	2	6	2530866	2530871	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9010	NC_004631	ACC	2	6	2530874	2530879	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9011	NC_004631	CTA	2	6	2532715	2532720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9012	NC_004631	TCA	2	6	2532760	2532765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9013	NC_004631	TTA	2	6	2532775	2532780	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9014	NC_004631	GAG	2	6	2532784	2532789	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9015	NC_004631	AGG	2	6	2532795	2532800	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9016	NC_004631	AAT	2	6	2534256	2534261	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9017	NC_004631	TCC	2	6	2534267	2534272	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9018	NC_004631	CT	3	6	2534309	2534314	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9019	NC_004631	TTAC	2	8	2534368	2534375	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
9020	NC_004631	TTG	2	6	2534847	2534852	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9021	NC_004631	TAA	2	6	2534905	2534910	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9022	NC_004631	A	6	6	2534970	2534975	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9023	NC_004631	GTG	2	6	2534995	2535000	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9024	NC_004631	TGT	2	6	2536366	2536371	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9025	NC_004631	GGA	2	6	2536397	2536402	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9026	NC_004631	GCG	2	6	2536410	2536415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9027	NC_004631	T	6	6	2536416	2536421	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9028	NC_004631	GCG	2	6	2536455	2536460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9029	NC_004631	A	6	6	2536645	2536650	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9030	NC_004631	GTTA	2	8	2538820	2538827	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
9031	NC_004631	A	9	9	2538871	2538879	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9032	NC_004631	GGC	2	6	2538880	2538885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9033	NC_004631	TGA	2	6	2538899	2538904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9034	NC_004631	CGG	2	6	2538941	2538946	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9035	NC_004631	T	7	7	2538997	2539003	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9036	NC_004631	ATA	2	6	2543400	2543405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9037	NC_004631	GC	3	6	2543495	2543500	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9038	NC_004631	GGT	2	6	2543524	2543529	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9039	NC_004631	A	6	6	2543533	2543538	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9040	NC_004631	T	6	6	2543543	2543548	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9041	NC_004631	CGC	2	6	2543643	2543648	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9042	NC_004631	CGT	2	6	2543679	2543684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9043	NC_004631	GC	3	6	2543690	2543695	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9044	NC_004631	CTG	2	6	2543740	2543745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9045	NC_004631	T	6	6	2543851	2543856	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9046	NC_004631	TTGTC	2	10	2543870	2543879	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
9047	NC_004631	CCG	3	9	2543906	2543914	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9048	NC_004631	TGG	2	6	2543951	2543956	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9049	NC_004631	TCT	2	6	2544053	2544058	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9050	NC_004631	CTT	2	6	2544111	2544116	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9051	NC_004631	CGC	2	6	2544144	2544149	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9052	NC_004631	ATG	2	6	2544205	2544210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9053	NC_004631	TAT	2	6	2544246	2544251	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9054	NC_004631	CGC	2	6	2544317	2544322	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9055	NC_004631	TGAC	2	8	2544338	2544345	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
9056	NC_004631	CT	4	8	2544358	2544365	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9057	NC_004631	TTC	2	6	2544379	2544384	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9058	NC_004631	CTG	2	6	2544423	2544428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9059	NC_004631	CT	3	6	2544445	2544450	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9060	NC_004631	CTG	3	9	2544466	2544474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9061	NC_004631	GGC	2	6	2544487	2544492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9062	NC_004631	CTG	2	6	2544496	2544501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9063	NC_004631	GCG	2	6	2544505	2544510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9064	NC_004631	GCG	2	6	2544557	2544562	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9065	NC_004631	CGC	2	6	2544609	2544614	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9066	NC_004631	GTC	2	6	2544636	2544641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9067	NC_004631	AGC	2	6	2544671	2544676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9068	NC_004631	T	6	6	2545644	2545649	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9069	NC_004631	CCG	2	6	2546683	2546688	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9070	NC_004631	ATT	2	6	2547006	2547011	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9071	NC_004631	AG	3	6	2547102	2547107	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9072	NC_004631	CTG	2	6	2547129	2547134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9073	NC_004631	TGA	2	6	2547154	2547159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9074	NC_004631	CGG	2	6	2547270	2547275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9075	NC_004631	T	6	6	2547294	2547299	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9076	NC_004631	GCC	2	6	2547307	2547312	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9077	NC_004631	TCCA	2	8	2547351	2547358	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
9078	NC_004631	AAT	2	6	2547381	2547386	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9079	NC_004631	CGC	2	6	2547435	2547440	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9080	NC_004631	TCA	2	6	2547446	2547451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9081	NC_004631	TCG	2	6	2547571	2547576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9082	NC_004631	CAG	2	6	2547627	2547632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9083	NC_004631	ATG	2	6	2547636	2547641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9084	NC_004631	TGT	2	6	2547656	2547661	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9085	NC_004631	TCG	2	6	2547662	2547667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9086	NC_004631	ACG	2	6	2547732	2547737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9087	NC_004631	TTA	2	6	2547757	2547762	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9088	NC_004631	TCG	2	6	2547765	2547770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9089	NC_004631	AGC	2	6	2547834	2547839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9090	NC_004631	ATTGT	2	10	2547882	2547891	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
9091	NC_004631	ATCAT	2	10	2548816	2548825	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
9092	NC_004631	ATA	2	6	2548852	2548857	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9093	NC_004631	ATTT	2	8	2548941	2548948	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9094	NC_004631	T	6	6	2548946	2548951	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9095	NC_004631	TCA	2	6	2549449	2549454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9096	NC_004631	AC	3	6	2549513	2549518	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9097	NC_004631	GGAG	2	8	2551514	2551521	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
9098	NC_004631	CGC	2	6	2551569	2551574	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9099	NC_004631	TA	3	6	2551951	2551956	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9100	NC_004631	ACC	2	6	2551981	2551986	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9101	NC_004631	TTAC	2	8	2552001	2552008	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
9102	NC_004631	AT	3	6	2552017	2552022	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9103	NC_004631	ATTG	2	8	2552028	2552035	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
9104	NC_004631	AGA	2	6	2552091	2552096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9105	NC_004631	TTA	2	6	2552118	2552123	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9106	NC_004631	AGA	2	6	2552162	2552167	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9107	NC_004631	AAC	2	6	2552213	2552218	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9108	NC_004631	TGT	2	6	2552221	2552226	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9109	NC_004631	TTA	2	6	2552511	2552516	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9110	NC_004631	GAA	2	6	2552541	2552546	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9111	NC_004631	GAA	2	6	2552587	2552592	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9112	NC_004631	AAT	2	6	2552602	2552607	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9113	NC_004631	CGC	2	6	2552617	2552622	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9114	NC_004631	ATA	2	6	2552655	2552660	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9115	NC_004631	A	6	6	2552668	2552673	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9116	NC_004631	AAT	2	6	2552675	2552680	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9117	NC_004631	TTTAA	2	10	2552746	2552755	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
9118	NC_004631	TTAGC	2	10	2554029	2554038	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
9119	NC_004631	TGG	2	6	2554054	2554059	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9120	NC_004631	TCA	2	6	2554105	2554110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9121	NC_004631	TA	3	6	2554132	2554137	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9122	NC_004631	CAA	2	6	2556312	2556317	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9123	NC_004631	GCGA	2	8	2556341	2556348	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
9124	NC_004631	ATC	2	6	2556539	2556544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9125	NC_004631	CTT	2	6	2559249	2559254	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9126	NC_004631	GCT	2	6	2559267	2559272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9127	NC_004631	CGG	2	6	2559277	2559282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9128	NC_004631	CGA	2	6	2559370	2559375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9129	NC_004631	CAG	2	6	2559386	2559391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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