MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. Ty2 chromosome

Total Repeats: 17242

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8501	NC_004631	GCC	2	6	2366110	2366115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8502	NC_004631	CG	3	6	2366117	2366122	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8503	NC_004631	CAG	3	9	2366149	2366157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8504	NC_004631	GAC	2	6	2366221	2366226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8505	NC_004631	AGC	3	9	2366282	2366290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8506	NC_004631	GCC	2	6	2366375	2366380	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8507	NC_004631	GAAA	2	8	2366412	2366419	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
8508	NC_004631	GAT	2	6	2366430	2366435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8509	NC_004631	GGC	2	6	2366472	2366477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8510	NC_004631	CG	3	6	2366482	2366487	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8511	NC_004631	GAT	2	6	2366520	2366525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8512	NC_004631	CGCA	2	8	2366581	2366588	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8513	NC_004631	GGC	2	6	2366639	2366644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8514	NC_004631	CAT	2	6	2366769	2366774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8515	NC_004631	TCA	2	6	2366775	2366780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8516	NC_004631	CGA	2	6	2366810	2366815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8517	NC_004631	AG	3	6	2366828	2366833	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8518	NC_004631	TTAT	2	8	2367418	2367425	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8519	NC_004631	TTTC	2	8	2367717	2367724	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
8520	NC_004631	A	8	8	2367771	2367778	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8521	NC_004631	ATT	2	6	2367799	2367804	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8522	NC_004631	A	6	6	2369191	2369196	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8523	NC_004631	T	6	6	2369221	2369226	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8524	NC_004631	AAAT	2	8	2369328	2369335	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8525	NC_004631	CGC	2	6	2370235	2370240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8526	NC_004631	GGCG	2	8	2370242	2370249	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
8527	NC_004631	AC	3	6	2370250	2370255	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8528	NC_004631	CGA	2	6	2370270	2370275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8529	NC_004631	ATG	2	6	2370312	2370317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8530	NC_004631	CAG	2	6	2370326	2370331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8531	NC_004631	GCC	2	6	2370347	2370352	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8532	NC_004631	ATC	2	6	2370354	2370359	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8533	NC_004631	TCA	2	6	2370376	2370381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8534	NC_004631	CTCC	2	8	2370422	2370429	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
8535	NC_004631	AAT	2	6	2370608	2370613	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8536	NC_004631	CAA	2	6	2370651	2370656	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8537	NC_004631	TAT	2	6	2370663	2370668	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8538	NC_004631	TTA	2	6	2370674	2370679	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8539	NC_004631	ATAA	2	8	2370700	2370707	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8540	NC_004631	AC	3	6	2370750	2370755	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8541	NC_004631	GC	3	6	2371102	2371107	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8542	NC_004631	AAC	2	6	2371165	2371170	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8543	NC_004631	TG	3	6	2371229	2371234	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8544	NC_004631	CAG	2	6	2371265	2371270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8545	NC_004631	AAC	2	6	2371286	2371291	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8546	NC_004631	TAA	2	6	2371299	2371304	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8547	NC_004631	ACA	2	6	2371306	2371311	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8548	NC_004631	ATT	2	6	2371337	2371342	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8549	NC_004631	A	6	6	2371357	2371362	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8550	NC_004631	GTA	2	6	2371370	2371375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8551	NC_004631	TAAT	2	8	2374343	2374350	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8552	NC_004631	CCA	2	6	2374359	2374364	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8553	NC_004631	GCG	2	6	2374376	2374381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8554	NC_004631	AAG	2	6	2374431	2374436	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8555	NC_004631	A	6	6	2374458	2374463	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8556	NC_004631	CCA	2	6	2374558	2374563	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8557	NC_004631	CAC	2	6	2374660	2374665	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8558	NC_004631	AG	3	6	2374706	2374711	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8559	NC_004631	GTT	2	6	2374769	2374774	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8560	NC_004631	TAC	2	6	2374819	2374824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8561	NC_004631	AAG	2	6	2374847	2374852	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8562	NC_004631	CTC	2	6	2374864	2374869	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8563	NC_004631	GAT	2	6	2374897	2374902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8564	NC_004631	CCG	2	6	2374914	2374919	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8565	NC_004631	A	7	7	2374965	2374971	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8566	NC_004631	ATGA	2	8	2375003	2375010	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8567	NC_004631	CGT	2	6	2375119	2375124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8568	NC_004631	GA	3	6	2375208	2375213	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8569	NC_004631	CGAG	2	8	2375279	2375286	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
8570	NC_004631	ATC	2	6	2375318	2375323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8571	NC_004631	GAC	2	6	2375414	2375419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8572	NC_004631	TGA	2	6	2375428	2375433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8574	NC_004631	AAG	2	6	2375474	2375479	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8575	NC_004631	GC	3	6	2375503	2375508	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8576	NC_004631	TGAAG	2	10	2375582	2375591	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
8577	NC_004631	GCC	2	6	2375757	2375762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8578	NC_004631	AATC	2	8	2375774	2375781	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8579	NC_004631	T	6	6	2375826	2375831	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8581	NC_004631	T	7	7	2376497	2376503	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8582	NC_004631	ATA	2	6	2376525	2376530	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8583	NC_004631	AT	3	6	2376555	2376560	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8584	NC_004631	CAT	2	6	2376566	2376571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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8587	NC_004631	A	6	6	2377755	2377760	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8588	NC_004631	T	6	6	2377761	2377766	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8589	NC_004631	TCC	2	6	2377784	2377789	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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8591	NC_004631	TTA	2	6	2377826	2377831	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8592	NC_004631	ATT	2	6	2377863	2377868	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8593	NC_004631	ACA	2	6	2377882	2377887	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8594	NC_004631	ACT	2	6	2377894	2377899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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8596	NC_004631	T	6	6	2378056	2378061	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8597	NC_004631	TATT	2	8	2378087	2378094	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8598	NC_004631	TAT	2	6	2378138	2378143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8599	NC_004631	GTGTG	2	10	2378153	2378162	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
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8601	NC_004631	CT	3	6	2383109	2383114	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8602	NC_004631	TCCCT	2	10	2384434	2384443	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
8603	NC_004631	ATT	2	6	2384460	2384465	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8604	NC_004631	AC	4	8	2385032	2385039	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8605	NC_004631	ATT	2	6	2385071	2385076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8606	NC_004631	AGAT	2	8	2385119	2385126	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8607	NC_004631	ATTA	2	8	2385134	2385141	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8608	NC_004631	TAAT	2	8	2385175	2385182	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8609	NC_004631	TAA	2	6	2385210	2385215	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8610	NC_004631	TAAA	2	8	2385230	2385237	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8611	NC_004631	A	6	6	2385235	2385240	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8612	NC_004631	AAG	2	6	2385288	2385293	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8613	NC_004631	GCC	2	6	2385329	2385334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8614	NC_004631	TGA	2	6	2385378	2385383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8615	NC_004631	GC	3	6	2385408	2385413	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8616	NC_004631	ACGG	2	8	2385440	2385447	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
8617	NC_004631	TCT	2	6	2385551	2385556	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8618	NC_004631	CT	3	6	2385555	2385560	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8619	NC_004631	GCA	2	6	2385565	2385570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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8622	NC_004631	GT	3	6	2388769	2388774	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8623	NC_004631	GT	3	6	2388785	2388790	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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8627	NC_004631	AGC	2	6	2390224	2390229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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8629	NC_004631	GCG	2	6	2391843	2391848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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8632	NC_004631	ATTGCA	2	12	2396550	2396561	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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