MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. Ty2 chromosome

Total Repeats: 17242

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_004631	TTA	2	6	2217796	2217801	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8002	NC_004631	TAA	2	6	2217870	2217875	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8003	NC_004631	A	6	6	2217874	2217879	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8004	NC_004631	TAT	2	6	2217880	2217885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8005	NC_004631	CAA	2	6	2217889	2217894	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8006	NC_004631	TTC	2	6	2217901	2217906	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8007	NC_004631	ATG	2	6	2217933	2217938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8008	NC_004631	A	7	7	2217947	2217953	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8009	NC_004631	TAC	2	6	2217962	2217967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8010	NC_004631	AAC	2	6	2217974	2217979	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8011	NC_004631	A	6	6	2218006	2218011	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8012	NC_004631	GATG	2	8	2218043	2218050	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
8013	NC_004631	TTA	2	6	2218051	2218056	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8014	NC_004631	A	8	8	2218106	2218113	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8015	NC_004631	AT	4	8	2218177	2218184	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8016	NC_004631	TAA	2	6	2218210	2218215	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8017	NC_004631	CAT	2	6	2218429	2218434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8018	NC_004631	CTT	2	6	2218474	2218479	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8019	NC_004631	TCAT	2	8	2218485	2218492	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8020	NC_004631	GAA	2	6	2218515	2218520	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8021	NC_004631	TTAT	2	8	2218550	2218557	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8022	NC_004631	CCG	2	6	2220722	2220727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8023	NC_004631	AGA	2	6	2221882	2221887	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8024	NC_004631	GAT	2	6	2222006	2222011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8025	NC_004631	ATTT	2	8	2222018	2222025	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8026	NC_004631	CG	3	6	2222071	2222076	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8027	NC_004631	ATG	2	6	2222079	2222084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8028	NC_004631	GTA	2	6	2223192	2223197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8029	NC_004631	CAT	2	6	2223928	2223933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8030	NC_004631	A	6	6	2223954	2223959	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8031	NC_004631	ATCA	2	8	2224152	2224159	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8032	NC_004631	AG	3	6	2224172	2224177	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8033	NC_004631	CTG	2	6	2224252	2224257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8034	NC_004631	TCA	2	6	2224273	2224278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8035	NC_004631	ATA	2	6	2224315	2224320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8036	NC_004631	TAT	2	6	2224321	2224326	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8037	NC_004631	TA	3	6	2224336	2224341	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8038	NC_004631	AGAAC	2	10	2224374	2224383	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
8039	NC_004631	AGC	2	6	2224396	2224401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8040	NC_004631	TAATA	2	10	2224404	2224413	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
8041	NC_004631	TCG	2	6	2224421	2224426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8042	NC_004631	TCG	2	6	2227574	2227579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8043	NC_004631	TTTG	2	8	2227587	2227594	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
8044	NC_004631	A	6	6	2227693	2227698	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8045	NC_004631	TAA	2	6	2227752	2227757	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8046	NC_004631	AAAG	2	8	2227764	2227771	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
8047	NC_004631	A	7	7	2230830	2230836	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8048	NC_004631	GGC	2	6	2230847	2230852	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8049	NC_004631	TAA	2	6	2230879	2230884	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8050	NC_004631	ACT	2	6	2231202	2231207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8051	NC_004631	CAG	2	6	2231236	2231241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8052	NC_004631	AAT	2	6	2231302	2231307	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8053	NC_004631	T	7	7	2231328	2231334	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8054	NC_004631	CCGC	2	8	2231340	2231347	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
8055	NC_004631	A	6	6	2231373	2231378	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8056	NC_004631	ATT	2	6	2238878	2238883	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8057	NC_004631	ATTT	2	8	2238910	2238917	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8058	NC_004631	AAT	2	6	2238929	2238934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8059	NC_004631	ATATT	2	10	2238948	2238957	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
8060	NC_004631	GGA	2	6	2238962	2238967	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8061	NC_004631	A	6	6	2238971	2238976	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8062	NC_004631	ATT	2	6	2239041	2239046	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8063	NC_004631	T	6	6	2239060	2239065	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8064	NC_004631	ATA	2	6	2239152	2239157	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8065	NC_004631	ATG	2	6	2239196	2239201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8066	NC_004631	T	6	6	2239249	2239254	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8067	NC_004631	CAGC	2	8	2239365	2239372	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8068	NC_004631	AGA	2	6	2239390	2239395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8069	NC_004631	GTA	2	6	2239445	2239450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8070	NC_004631	TTA	2	6	2239498	2239503	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8071	NC_004631	T	7	7	2239530	2239536	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8072	NC_004631	T	6	6	2239556	2239561	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8073	NC_004631	GAA	2	6	2239565	2239570	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8074	NC_004631	AC	3	6	2239680	2239685	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8075	NC_004631	TGA	2	6	2239703	2239708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8076	NC_004631	CGA	2	6	2239748	2239753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8077	NC_004631	GCA	2	6	2239923	2239928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8078	NC_004631	CCG	2	6	2239953	2239958	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8079	NC_004631	CG	3	6	2239965	2239970	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8080	NC_004631	TGG	2	6	2239972	2239977	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8081	NC_004631	GCG	2	6	2240026	2240031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8082	NC_004631	CCT	3	9	2240075	2240083	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8083	NC_004631	AAC	2	6	2240143	2240148	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8084	NC_004631	ACC	2	6	2240159	2240164	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8085	NC_004631	ATT	2	6	2240172	2240177	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8086	NC_004631	GGCG	2	8	2240181	2240188	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
8087	NC_004631	CG	3	6	2240211	2240216	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8088	NC_004631	CGG	2	6	2240234	2240239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8089	NC_004631	GAA	2	6	2240259	2240264	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8090	NC_004631	CGC	2	6	2240296	2240301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8091	NC_004631	ACG	2	6	2240356	2240361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8092	NC_004631	ACG	2	6	2240376	2240381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8093	NC_004631	GTC	2	6	2240405	2240410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8094	NC_004631	GAT	2	6	2240482	2240487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8095	NC_004631	CGC	2	6	2240499	2240504	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8096	NC_004631	TGC	2	6	2240505	2240510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8097	NC_004631	ACA	2	6	2240563	2240568	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8098	NC_004631	A	6	6	2240600	2240605	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8099	NC_004631	AAC	2	6	2240654	2240659	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8100	NC_004631	ATG	2	6	2240666	2240671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8101	NC_004631	CCA	2	6	2240679	2240684	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8102	NC_004631	CGC	2	6	2240704	2240709	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8103	NC_004631	TGGA	2	8	2240759	2240766	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
8104	NC_004631	CAC	2	6	2240816	2240821	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8105	NC_004631	TCCG	2	8	2240823	2240830	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
8106	NC_004631	TGAT	2	8	2240844	2240851	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8107	NC_004631	CTT	2	6	2240902	2240907	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8108	NC_004631	CTG	2	6	2240984	2240989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8109	NC_004631	CAC	2	6	2240992	2240997	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8110	NC_004631	AGCG	2	8	2241013	2241020	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
8111	NC_004631	CTG	2	6	2241122	2241127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8112	NC_004631	AGA	2	6	2241136	2241141	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8113	NC_004631	ACA	2	6	2241154	2241159	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8114	NC_004631	CTG	2	6	2241170	2241175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8115	NC_004631	CTG	2	6	2241191	2241196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8116	NC_004631	GCG	2	6	2241408	2241413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8117	NC_004631	CGGAAG	2	12	2241435	2241446	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
8118	NC_004631	CCG	2	6	2241479	2241484	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8119	NC_004631	TG	3	6	2241492	2241497	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8120	NC_004631	GAA	2	6	2241551	2241556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8121	NC_004631	CTG	2	6	2241566	2241571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8122	NC_004631	GAA	2	6	2241608	2241613	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8123	NC_004631	ACG	2	6	2241615	2241620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8124	NC_004631	CTG	2	6	2241674	2241679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8125	NC_004631	AGG	2	6	2241681	2241686	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8126	NC_004631	ATA	2	6	2243069	2243074	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8127	NC_004631	AGCGC	2	10	2243617	2243626	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
8128	NC_004631	A	6	6	2243636	2243641	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8129	NC_004631	TTC	2	6	2243661	2243666	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8130	NC_004631	A	7	7	2245975	2245981	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8131	NC_004631	ATA	2	6	2246029	2246034	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8399	NC_004631	AG	3	6	2335725	2335730	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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