MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. Ty2 chromosome

Total Repeats: 17242

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7501	NC_004631	TCT	2	6	2114740	2114745	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7502	NC_004631	T	6	6	2114791	2114796	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7503	NC_004631	CAGG	2	8	2114806	2114813	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
7504	NC_004631	AATA	2	8	2116461	2116468	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7505	NC_004631	TCC	2	6	2116469	2116474	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7506	NC_004631	CT	3	6	2116511	2116516	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7507	NC_004631	TTAC	2	8	2116570	2116577	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7508	NC_004631	TTG	2	6	2117049	2117054	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7509	NC_004631	TAA	2	6	2117107	2117112	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7510	NC_004631	A	8	8	2117172	2117179	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7511	NC_004631	TTTTCA	2	12	2117199	2117210	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
7512	NC_004631	AAGT	2	8	2117756	2117763	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7513	NC_004631	AT	3	6	2117776	2117781	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7514	NC_004631	CAT	2	6	2117877	2117882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7515	NC_004631	AAT	2	6	2117902	2117907	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7516	NC_004631	ATT	2	6	2117936	2117941	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7517	NC_004631	T	9	9	2118000	2118008	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7518	NC_004631	T	6	6	2118071	2118076	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7519	NC_004631	ATG	2	6	2118991	2118996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7520	NC_004631	TAT	2	6	2119036	2119041	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7521	NC_004631	T	6	6	2119060	2119065	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7522	NC_004631	T	6	6	2119072	2119077	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7523	NC_004631	T	6	6	2119082	2119087	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7524	NC_004631	ATT	2	6	2119102	2119107	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7525	NC_004631	ACA	2	6	2119117	2119122	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7526	NC_004631	AAAT	2	8	2119152	2119159	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7527	NC_004631	A	6	6	2119200	2119205	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7528	NC_004631	TA	3	6	2119901	2119906	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7529	NC_004631	CCTG	2	8	2119922	2119929	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
7530	NC_004631	ATT	2	6	2119990	2119995	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7531	NC_004631	TAA	2	6	2119998	2120003	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7532	NC_004631	CA	3	6	2120010	2120015	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7533	NC_004631	TTAA	2	8	2120020	2120027	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7534	NC_004631	AAC	2	6	2120038	2120043	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7535	NC_004631	GCA	2	6	2120115	2120120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7536	NC_004631	T	6	6	2120199	2120204	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7537	NC_004631	CCTGC	2	10	2122543	2122552	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
7538	NC_004631	CAT	2	6	2122564	2122569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7539	NC_004631	CATTT	2	10	2122580	2122589	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
7540	NC_004631	TCCC	2	8	2122590	2122597	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
7541	NC_004631	GGA	2	6	2122640	2122645	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7542	NC_004631	GTC	2	6	2124901	2124906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7543	NC_004631	GCTTT	2	10	2124934	2124943	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
7544	NC_004631	T	6	6	2124961	2124966	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7545	NC_004631	CAC	2	6	2124967	2124972	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7546	NC_004631	GGT	2	6	2125010	2125015	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7547	NC_004631	CGC	2	6	2125023	2125028	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7548	NC_004631	CGT	2	6	2125039	2125044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7549	NC_004631	CGG	2	6	2125061	2125066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7550	NC_004631	T	7	7	2125089	2125095	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7551	NC_004631	CGC	2	6	2125110	2125115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7552	NC_004631	CTG	2	6	2125132	2125137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7553	NC_004631	CAT	2	6	2125158	2125163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7554	NC_004631	GCG	2	6	2125183	2125188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7555	NC_004631	CGCT	2	8	2125193	2125200	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
7556	NC_004631	CG	3	6	2125204	2125209	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7557	NC_004631	GCG	3	9	2125214	2125222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7558	NC_004631	AAT	2	6	2125276	2125281	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7559	NC_004631	GCC	2	6	2125295	2125300	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7560	NC_004631	GC	3	6	2125365	2125370	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7561	NC_004631	GCCA	2	8	2125410	2125417	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7562	NC_004631	TGT	2	6	2125495	2125500	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7563	NC_004631	GAT	2	6	2125521	2125526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7564	NC_004631	GT	3	6	2125585	2125590	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7565	NC_004631	CAA	2	6	2125609	2125614	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7566	NC_004631	CGG	2	6	2125671	2125676	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7567	NC_004631	GATAA	2	10	2125684	2125693	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
7568	NC_004631	GCG	2	6	2125725	2125730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7569	NC_004631	AGC	2	6	2125804	2125809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7570	NC_004631	ACC	2	6	2125847	2125852	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7571	NC_004631	CTCG	2	8	2125866	2125873	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
7572	NC_004631	CT	3	6	2125883	2125888	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7573	NC_004631	CG	3	6	2125924	2125929	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7574	NC_004631	T	6	6	2125936	2125941	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7575	NC_004631	ATC	2	6	2126285	2126290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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7577	NC_004631	AAT	2	6	2126401	2126406	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7578	NC_004631	TGT	2	6	2126842	2126847	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7579	NC_004631	TGTT	2	8	2126916	2126923	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
7580	NC_004631	T	7	7	2126956	2126962	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7581	NC_004631	CG	3	6	2126984	2126989	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7582	NC_004631	TCT	2	6	2126998	2127003	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7583	NC_004631	CGC	2	6	2127009	2127014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7584	NC_004631	ACA	2	6	2127033	2127038	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7585	NC_004631	GC	3	6	2127102	2127107	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7586	NC_004631	GCAG	2	8	2127130	2127137	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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7589	NC_004631	ATCA	2	8	2127198	2127205	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7590	NC_004631	A	6	6	2127291	2127296	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7591	NC_004631	GC	3	6	2127392	2127397	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7592	NC_004631	ACGC	2	8	2127402	2127409	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7593	NC_004631	GCG	2	6	2127443	2127448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7594	NC_004631	GC	3	6	2127455	2127460	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7595	NC_004631	CCG	2	6	2127511	2127516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7596	NC_004631	GGGT	2	8	2127521	2127528	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
7597	NC_004631	TAC	2	6	2127594	2127599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7598	NC_004631	GCA	2	6	2127620	2127625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7601	NC_004631	GCGG	2	8	2127706	2127713	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
7602	NC_004631	CTTCGC	2	12	2127767	2127778	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
7603	NC_004631	CG	4	8	2127857	2127864	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7604	NC_004631	ATCCAG	2	12	2127867	2127878	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
7605	NC_004631	TGA	2	6	2127914	2127919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7607	NC_004631	GCT	2	6	2128027	2128032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7608	NC_004631	CAA	2	6	2128085	2128090	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7609	NC_004631	CTG	2	6	2128151	2128156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7610	NC_004631	AATTA	2	10	2128157	2128166	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
7611	NC_004631	CGG	2	6	2128259	2128264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7612	NC_004631	TATGGA	2	12	2128276	2128287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7613	NC_004631	CGC	2	6	2128360	2128365	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7614	NC_004631	CCA	2	6	2128390	2128395	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7615	NC_004631	AGG	2	6	2128425	2128430	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7616	NC_004631	CGCC	2	8	2128472	2128479	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
7617	NC_004631	ATG	2	6	2128505	2128510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7618	NC_004631	T	6	6	2128511	2128516	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7619	NC_004631	TGC	2	6	2128560	2128565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7620	NC_004631	GAGC	2	8	2128715	2128722	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
7621	NC_004631	AAT	2	6	2128742	2128747	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7622	NC_004631	GCT	2	6	2128780	2128785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7623	NC_004631	GC	3	6	2128867	2128872	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7624	NC_004631	T	6	6	2128990	2128995	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7625	NC_004631	TCA	2	6	2129079	2129084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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7627	NC_004631	CCT	2	6	2129179	2129184	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7628	NC_004631	CGG	2	6	2129219	2129224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7629	NC_004631	CCA	2	6	2129260	2129265	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7630	NC_004631	AGG	2	6	2129299	2129304	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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