MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. Ty2 chromosome

Total Repeats: 17242

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_004631	AAC	2	6	1777119	1777124	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6502	NC_004631	A	7	7	1777250	1777256	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6503	NC_004631	CTC	2	6	1780367	1780372	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6504	NC_004631	ATA	2	6	1781124	1781129	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6505	NC_004631	TTA	2	6	1781219	1781224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6506	NC_004631	A	6	6	1781290	1781295	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6507	NC_004631	CAAG	2	8	1781432	1781439	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6508	NC_004631	CCG	2	6	1781466	1781471	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6509	NC_004631	CCG	2	6	1781492	1781497	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6510	NC_004631	TGCC	2	8	1781537	1781544	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6511	NC_004631	CGA	2	6	1781582	1781587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6512	NC_004631	GAA	2	6	1781608	1781613	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6513	NC_004631	CAG	2	6	1781719	1781724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6514	NC_004631	TGA	2	6	1781744	1781749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6515	NC_004631	CG	3	6	1781807	1781812	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6516	NC_004631	GGT	2	6	1781919	1781924	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6517	NC_004631	TGA	2	6	1781942	1781947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6518	NC_004631	CCA	2	6	1781996	1782001	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6519	NC_004631	AGC	2	6	1782050	1782055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6520	NC_004631	AAT	2	6	1782130	1782135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6521	NC_004631	CTGG	2	8	1782141	1782148	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6522	NC_004631	A	6	6	1782239	1782244	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6523	NC_004631	GCA	2	6	1782296	1782301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6524	NC_004631	CG	4	8	1782316	1782323	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6525	NC_004631	ATAA	2	8	1782361	1782368	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6526	NC_004631	TTC	2	6	1782370	1782375	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6527	NC_004631	AGC	2	6	1782386	1782391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6528	NC_004631	ATG	2	6	1782458	1782463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6529	NC_004631	CGG	2	6	1782535	1782540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6530	NC_004631	CTGG	2	8	1782543	1782550	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6531	NC_004631	ATG	2	6	1782629	1782634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6532	NC_004631	GGC	2	6	1782638	1782643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6533	NC_004631	GAC	2	6	1782698	1782703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6534	NC_004631	TAA	2	6	1783036	1783041	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6535	NC_004631	GCC	2	6	1783077	1783082	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6536	NC_004631	CAC	2	6	1783084	1783089	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6537	NC_004631	CGG	3	9	1783378	1783386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6538	NC_004631	ACG	2	6	1783421	1783426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6539	NC_004631	CAA	2	6	1783525	1783530	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6540	NC_004631	GC	3	6	1783581	1783586	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6541	NC_004631	A	6	6	1783659	1783664	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6542	NC_004631	CAT	2	6	1783697	1783702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6543	NC_004631	G	6	6	1785197	1785202	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6544	NC_004631	GGACA	2	10	1785216	1785225	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
6545	NC_004631	TATT	2	8	1785240	1785247	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6546	NC_004631	AAAT	2	8	1785258	1785265	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6547	NC_004631	TTTG	2	8	1785275	1785282	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
6548	NC_004631	GCTC	2	8	1785361	1785368	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6549	NC_004631	TTA	2	6	1785407	1785412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6550	NC_004631	A	7	7	1785425	1785431	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6551	NC_004631	A	6	6	1789777	1789782	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6552	NC_004631	TGTC	2	8	1789810	1789817	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6553	NC_004631	AGGG	2	8	1791082	1791089	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
6554	NC_004631	TAA	2	6	1791520	1791525	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6555	NC_004631	TA	3	6	1794216	1794221	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6556	NC_004631	GGC	2	6	1794249	1794254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6557	NC_004631	CG	3	6	1795479	1795484	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6558	NC_004631	CTC	2	6	1795668	1795673	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6559	NC_004631	TTAC	2	8	1795711	1795718	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6560	NC_004631	AAT	2	6	1796302	1796307	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6561	NC_004631	CA	3	6	1796311	1796316	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6562	NC_004631	TCA	2	6	1796399	1796404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6563	NC_004631	A	6	6	1796423	1796428	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6564	NC_004631	CA	3	6	1798092	1798097	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6565	NC_004631	TTA	2	6	1798162	1798167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6566	NC_004631	A	6	6	1798190	1798195	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6567	NC_004631	GTC	2	6	1798598	1798603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6568	NC_004631	AAT	2	6	1798612	1798617	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6569	NC_004631	T	8	8	1801870	1801877	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6570	NC_004631	CGGG	2	8	1801943	1801950	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
6571	NC_004631	ATA	2	6	1801951	1801956	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6572	NC_004631	TAAA	2	8	1802012	1802019	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6573	NC_004631	TCC	2	6	1802022	1802027	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6574	NC_004631	CT	3	6	1802064	1802069	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6575	NC_004631	TTAC	2	8	1802123	1802130	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6576	NC_004631	TTG	2	6	1802602	1802607	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6577	NC_004631	TAA	2	6	1802660	1802665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6578	NC_004631	A	6	6	1802725	1802730	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6579	NC_004631	GTT	2	6	1805461	1805466	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6580	NC_004631	CGG	2	6	1808299	1808304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6581	NC_004631	CG	4	8	1812702	1812709	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6582	NC_004631	TATT	2	8	1812741	1812748	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6583	NC_004631	TGCT	2	8	1812756	1812763	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6584	NC_004631	ATG	2	6	1813513	1813518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6585	NC_004631	ATAA	2	8	1813553	1813560	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6586	NC_004631	CAGC	2	8	1815874	1815881	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6587	NC_004631	ATT	2	6	1816050	1816055	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6588	NC_004631	TAT	2	6	1816071	1816076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6589	NC_004631	AT	3	6	1816088	1816093	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6590	NC_004631	ATT	2	6	1816142	1816147	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6591	NC_004631	TAC	2	6	1816177	1816182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6592	NC_004631	ATT	2	6	1816201	1816206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6593	NC_004631	TCCT	2	8	1818406	1818413	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6594	NC_004631	T	6	6	1818486	1818491	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6595	NC_004631	TGC	2	6	1818496	1818501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6596	NC_004631	TGA	2	6	1818509	1818514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6597	NC_004631	A	7	7	1818543	1818549	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6598	NC_004631	A	6	6	1818571	1818576	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6599	NC_004631	CGC	3	9	1818582	1818590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6600	NC_004631	AGA	2	6	1818596	1818601	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6601	NC_004631	TCC	2	6	1819859	1819864	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6602	NC_004631	GGA	2	6	1819892	1819897	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6603	NC_004631	GGC	2	6	1820560	1820565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6604	NC_004631	GCC	2	6	1820577	1820582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6605	NC_004631	T	7	7	1820592	1820598	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6606	NC_004631	GC	3	6	1821244	1821249	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6607	NC_004631	T	7	7	1821258	1821264	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6608	NC_004631	TTA	2	6	1821332	1821337	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6609	NC_004631	TA	3	6	1822405	1822410	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6610	NC_004631	TA	4	8	1822424	1822431	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6611	NC_004631	ATGT	2	8	1822720	1822727	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6612	NC_004631	T	6	6	1822746	1822751	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6613	NC_004631	TGA	2	6	1822763	1822768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6614	NC_004631	AAT	2	6	1822789	1822794	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6615	NC_004631	A	7	7	1822808	1822814	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6616	NC_004631	ATGA	2	8	1822816	1822823	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6617	NC_004631	TCC	2	6	1822868	1822873	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6618	NC_004631	TTA	2	6	1822902	1822907	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6619	NC_004631	AGA	2	6	1822930	1822935	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6620	NC_004631	G	6	6	1822983	1822988	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6621	NC_004631	ATG	2	6	1822990	1822995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6622	NC_004631	CT	3	6	1823263	1823268	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6623	NC_004631	ATC	2	6	1823334	1823339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6624	NC_004631	AG	3	6	1823348	1823353	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6625	NC_004631	TGA	2	6	1823358	1823363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6626	NC_004631	TTA	2	6	1824504	1824509	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6627	NC_004631	TAAC	2	8	1824650	1824657	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6628	NC_004631	AAT	2	6	1824706	1824711	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6629	NC_004631	ACA	2	6	1824778	1824783	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6630	NC_004631	ATT	2	6	1824789	1824794	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6631	NC_004631	AAATAA	2	12	1824796	1824807	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6633	NC_004631	TC	3	6	1824866	1824871	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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