MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. Ty2 chromosome

Total Repeats: 17242

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_004631	CGC	2	6	1509747	1509752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5502	NC_004631	AAT	2	6	1509819	1509824	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5503	NC_004631	GCC	2	6	1509836	1509841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5504	NC_004631	GTT	2	6	1509946	1509951	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5505	NC_004631	GCG	2	6	1510037	1510042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5506	NC_004631	TTTC	2	8	1510177	1510184	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5507	NC_004631	CCG	2	6	1510196	1510201	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5508	NC_004631	AAT	2	6	1510218	1510223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5509	NC_004631	GAT	2	6	1510228	1510233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5510	NC_004631	CGTG	2	8	1510273	1510280	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5511	NC_004631	TAT	2	6	1510422	1510427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5512	NC_004631	CGG	2	6	1510494	1510499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5513	NC_004631	GTG	2	6	1510688	1510693	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5514	NC_004631	TGT	2	6	1510696	1510701	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5515	NC_004631	TC	3	6	1510707	1510712	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5516	NC_004631	TAT	2	6	1510722	1510727	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5517	NC_004631	ATTA	2	8	1511281	1511288	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5518	NC_004631	ATA	2	6	1511308	1511313	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5519	NC_004631	ACA	2	6	1511314	1511319	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5520	NC_004631	TA	3	6	1511375	1511380	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5521	NC_004631	AT	3	6	1511415	1511420	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5522	NC_004631	GCCA	2	8	1512593	1512600	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5523	NC_004631	CGT	2	6	1512669	1512674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5524	NC_004631	CAT	2	6	1512689	1512694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5525	NC_004631	CAC	2	6	1512770	1512775	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5526	NC_004631	ACG	2	6	1512865	1512870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5527	NC_004631	TTAAT	2	10	1512924	1512933	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5528	NC_004631	GCT	2	6	1513261	1513266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5529	NC_004631	CAT	3	9	1513277	1513285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5530	NC_004631	TAT	2	6	1513301	1513306	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5531	NC_004631	GGC	2	6	1513342	1513347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5532	NC_004631	A	6	6	1513364	1513369	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5533	NC_004631	ATTC	2	8	1514543	1514550	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5534	NC_004631	TAC	3	9	1514567	1514575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5535	NC_004631	AAG	2	6	1514615	1514620	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5536	NC_004631	TGT	2	6	1514664	1514669	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5537	NC_004631	TTG	2	6	1514672	1514677	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5538	NC_004631	CAT	2	6	1514692	1514697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5539	NC_004631	CTT	2	6	1514726	1514731	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5540	NC_004631	CCG	2	6	1514776	1514781	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5541	NC_004631	GCGTT	2	10	1514791	1514800	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
5542	NC_004631	GCC	2	6	1514811	1514816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5543	NC_004631	GCA	3	9	1514835	1514843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5544	NC_004631	GTT	2	6	1514853	1514858	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5545	NC_004631	CGACT	2	10	1514897	1514906	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
5546	NC_004631	ACT	2	6	1514931	1514936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5547	NC_004631	GAC	2	6	1514966	1514971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5548	NC_004631	GCC	2	6	1514991	1514996	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5549	NC_004631	TTATC	2	10	1515002	1515011	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
5550	NC_004631	CGC	2	6	1515046	1515051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5551	NC_004631	CAT	2	6	1515065	1515070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5552	NC_004631	GCC	2	6	1515116	1515121	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5553	NC_004631	TCA	2	6	1515208	1515213	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5554	NC_004631	A	6	6	1516541	1516546	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5555	NC_004631	TGC	2	6	1516612	1516617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5556	NC_004631	TTC	2	6	1516640	1516645	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5557	NC_004631	CTG	2	6	1516661	1516666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5558	NC_004631	GTC	2	6	1516680	1516685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5559	NC_004631	GCC	2	6	1516700	1516705	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5560	NC_004631	ATAC	2	8	1516812	1516819	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5561	NC_004631	TCG	2	6	1516825	1516830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5562	NC_004631	CCAC	2	8	1518674	1518681	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
5563	NC_004631	ATT	2	6	1523158	1523163	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5564	NC_004631	AGA	2	6	1524003	1524008	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5565	NC_004631	AC	3	6	1524054	1524059	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5566	NC_004631	AAT	2	6	1524429	1524434	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5567	NC_004631	TA	3	6	1524435	1524440	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5568	NC_004631	ATA	2	6	1524489	1524494	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5569	NC_004631	CT	3	6	1524501	1524506	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5570	NC_004631	TAT	2	6	1524538	1524543	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5571	NC_004631	TGA	2	6	1524573	1524578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5572	NC_004631	ACA	2	6	1524626	1524631	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5573	NC_004631	TGA	2	6	1524661	1524666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5574	NC_004631	CG	3	6	1524699	1524704	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5575	NC_004631	CCAG	2	8	1524705	1524712	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5576	NC_004631	AACA	2	8	1524730	1524737	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5577	NC_004631	ACC	2	6	1524773	1524778	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5578	NC_004631	ACCA	2	8	1524837	1524844	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5579	NC_004631	TCA	2	6	1524860	1524865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5580	NC_004631	TACAA	2	10	1524886	1524895	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
5581	NC_004631	CA	3	6	1524959	1524964	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5582	NC_004631	TAA	2	6	1525032	1525037	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5583	NC_004631	TAT	2	6	1525044	1525049	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5584	NC_004631	TA	3	6	1525063	1525068	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5585	NC_004631	ATAA	2	8	1525075	1525082	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5586	NC_004631	TTG	2	6	1525116	1525121	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5587	NC_004631	TA	3	6	1525926	1525931	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5588	NC_004631	GA	3	6	1526915	1526920	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5589	NC_004631	A	6	6	1527435	1527440	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5590	NC_004631	GTT	2	6	1527469	1527474	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5591	NC_004631	GATG	2	8	1527481	1527488	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5592	NC_004631	TGT	2	6	1527494	1527499	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5593	NC_004631	CTTT	2	8	1527574	1527581	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5594	NC_004631	AT	3	6	1527587	1527592	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5595	NC_004631	CCT	2	6	1527594	1527599	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5596	NC_004631	TTC	2	6	1527614	1527619	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5597	NC_004631	TCAT	2	8	1527647	1527654	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5598	NC_004631	TATCT	2	10	1527664	1527673	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
5599	NC_004631	TAA	2	6	1527679	1527684	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5600	NC_004631	ATA	2	6	1527765	1527770	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5601	NC_004631	TCT	2	6	1527776	1527781	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5602	NC_004631	AATT	2	8	1527873	1527880	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5603	NC_004631	TAAA	2	8	1527896	1527903	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5604	NC_004631	TTTC	2	8	1528179	1528186	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5605	NC_004631	GAG	2	6	1528225	1528230	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5606	NC_004631	TGG	2	6	1528488	1528493	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5607	NC_004631	AT	3	6	1528500	1528505	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5608	NC_004631	GAT	2	6	1528506	1528511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5609	NC_004631	ACG	2	6	1528514	1528519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5610	NC_004631	CGG	2	6	1530262	1530267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5611	NC_004631	GCC	2	6	1530273	1530278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5612	NC_004631	TCT	2	6	1530290	1530295	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5613	NC_004631	AC	3	6	1530317	1530322	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5614	NC_004631	CTA	2	6	1530353	1530358	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5615	NC_004631	GCC	2	6	1530432	1530437	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5616	NC_004631	TCA	2	6	1530447	1530452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5617	NC_004631	CAC	2	6	1531634	1531639	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5618	NC_004631	CAT	2	6	1531712	1531717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5619	NC_004631	CAT	2	6	1531735	1531740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5620	NC_004631	TCA	2	6	1531816	1531821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5621	NC_004631	GAA	2	6	1531829	1531834	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5622	NC_004631	AGT	2	6	1531852	1531857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5623	NC_004631	TGG	2	6	1531957	1531962	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5624	NC_004631	CCG	2	6	1532022	1532027	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5625	NC_004631	AGC	2	6	1532049	1532054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5626	NC_004631	ATC	2	6	1532061	1532066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5627	NC_004631	CCAGC	2	10	1532108	1532117	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
5628	NC_004631	GC	3	6	1532146	1532151	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5629	NC_004631	CA	3	6	1532170	1532175	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5630	NC_004631	ACG	2	6	1532217	1532222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5631	NC_004631	TGC	2	6	1532244	1532249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5632	NC_004631	CAG	2	6	1532252	1532257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5758	NC_004631	ATT	2	6	1568840	1568845	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5759	NC_004631	CAT	2	6	1568848	1568853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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