MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Streptococcus pyogenes SSI-1 chromosome

Total Repeats: 6931

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_004606	GTA	2	6	1086208	1086213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4002	NC_004606	T	7	7	1086223	1086229	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4003	NC_004606	AGA	2	6	1088628	1088633	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4004	NC_004606	T	6	6	1088655	1088660	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4005	NC_004606	ATA	2	6	1088686	1088691	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4006	NC_004606	T	8	8	1088715	1088722	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4007	NC_004606	T	6	6	1088746	1088751	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4008	NC_004606	TAA	2	6	1088772	1088777	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4009	NC_004606	ATG	2	6	1088783	1088788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4010	NC_004606	GAA	2	6	1088799	1088804	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4011	NC_004606	T	7	7	1088805	1088811	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4012	NC_004606	GGAC	2	8	1088865	1088872	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4013	NC_004606	GA	3	6	1088878	1088883	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4014	NC_004606	TTA	2	6	1088886	1088891	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4015	NC_004606	TC	3	6	1088922	1088927	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4016	NC_004606	AGTCTT	2	12	1088970	1088981	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4017	NC_004606	T	6	6	1088980	1088985	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4018	NC_004606	AAAG	2	8	1089023	1089030	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4019	NC_004606	T	6	6	1089038	1089043	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4020	NC_004606	GA	3	6	1089070	1089075	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4021	NC_004606	TAC	2	6	1090414	1090419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4022	NC_004606	TCT	3	9	1090434	1090442	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4023	NC_004606	AAG	2	6	1090452	1090457	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4024	NC_004606	T	6	6	1090464	1090469	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4025	NC_004606	TATAA	2	10	1090489	1090498	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4026	NC_004606	A	7	7	1091841	1091847	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4027	NC_004606	T	7	7	1091882	1091888	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4028	NC_004606	TTA	2	6	1091915	1091920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4029	NC_004606	AGG	2	6	1091925	1091930	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4030	NC_004606	CAT	2	6	1091978	1091983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4032	NC_004606	ACA	2	6	1092105	1092110	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4033	NC_004606	ATT	2	6	1092900	1092905	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4034	NC_004606	CCT	2	6	1092906	1092911	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4035	NC_004606	ATA	2	6	1092916	1092921	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4036	NC_004606	AATT	2	8	1092950	1092957	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4037	NC_004606	TAC	2	6	1092981	1092986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4040	NC_004606	A	6	6	1093159	1093164	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4041	NC_004606	TAA	2	6	1093172	1093177	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4042	NC_004606	A	6	6	1093176	1093181	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4043	NC_004606	TTA	2	6	1093198	1093203	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4044	NC_004606	A	7	7	1093247	1093253	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4045	NC_004606	CCT	2	6	1095406	1095411	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4046	NC_004606	TAT	2	6	1095429	1095434	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4047	NC_004606	T	7	7	1095463	1095469	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4052	NC_004606	AAT	2	6	1097904	1097909	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4053	NC_004606	TA	3	6	1097952	1097957	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4054	NC_004606	A	7	7	1098005	1098011	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4055	NC_004606	TTA	2	6	1098608	1098613	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4056	NC_004606	A	7	7	1098632	1098638	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4057	NC_004606	A	6	6	1098751	1098756	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4058	NC_004606	T	7	7	1100327	1100333	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4059	NC_004606	AAT	2	6	1100337	1100342	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4060	NC_004606	TAAT	2	8	1101398	1101405	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4061	NC_004606	TTA	2	6	1101415	1101420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4062	NC_004606	CATT	2	8	1101426	1101433	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4063	NC_004606	TCC	2	6	1104577	1104582	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4064	NC_004606	TAT	2	6	1104601	1104606	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4065	NC_004606	TC	3	6	1104637	1104642	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4066	NC_004606	T	9	9	1104697	1104705	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4067	NC_004606	CTTT	2	8	1106635	1106642	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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4069	NC_004606	T	7	7	1106675	1106681	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4070	NC_004606	A	6	6	1106700	1106705	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4071	NC_004606	A	7	7	1107405	1107411	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4072	NC_004606	TAGT	2	8	1107424	1107431	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4073	NC_004606	GTT	2	6	1107461	1107466	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4075	NC_004606	GTAA	2	8	1107815	1107822	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4076	NC_004606	T	6	6	1107855	1107860	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4077	NC_004606	TAT	2	6	1107897	1107902	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4078	NC_004606	ATT	2	6	1107928	1107933	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4079	NC_004606	TTAT	2	8	1108160	1108167	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4080	NC_004606	AACT	2	8	1108186	1108193	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4081	NC_004606	ATCA	2	8	1108201	1108208	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4082	NC_004606	TA	3	6	1109053	1109058	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4083	NC_004606	TA	3	6	1109069	1109074	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4084	NC_004606	TTA	2	6	1109128	1109133	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4086	NC_004606	A	6	6	1109157	1109162	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4087	NC_004606	ATA	2	6	1110452	1110457	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4088	NC_004606	A	7	7	1110457	1110463	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4089	NC_004606	TAA	2	6	1111213	1111218	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4090	NC_004606	A	6	6	1111217	1111222	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4092	NC_004606	TTA	2	6	1111266	1111271	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4093	NC_004606	AGTC	2	8	1111396	1111403	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4094	NC_004606	AAT	2	6	1111457	1111462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4095	NC_004606	ACA	2	6	1111512	1111517	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4096	NC_004606	TG	3	6	1111600	1111605	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4097	NC_004606	CT	3	6	1111626	1111631	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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4099	NC_004606	TCC	2	6	1111727	1111732	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4100	NC_004606	CAA	2	6	1111761	1111766	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4101	NC_004606	TATTGC	2	12	1111786	1111797	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4102	NC_004606	TCC	2	6	1115330	1115335	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4103	NC_004606	T	6	6	1116047	1116052	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4104	NC_004606	TAT	2	6	1116130	1116135	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4105	NC_004606	T	7	7	1116143	1116149	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4106	NC_004606	TTA	2	6	1116173	1116178	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4107	NC_004606	TTC	2	6	1116289	1116294	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4108	NC_004606	T	6	6	1116964	1116969	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4109	NC_004606	TTC	2	6	1116984	1116989	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4111	NC_004606	CTT	2	6	1117016	1117021	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4112	NC_004606	CTT	2	6	1117068	1117073	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4113	NC_004606	TCA	2	6	1117327	1117332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4114	NC_004606	TCG	2	6	1117360	1117365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4115	NC_004606	TTC	2	6	1117461	1117466	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4116	NC_004606	TTC	2	6	1117503	1117508	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4117	NC_004606	TTC	2	6	1117563	1117568	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4118	NC_004606	ACA	2	6	1117642	1117647	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4119	NC_004606	GCC	2	6	1117679	1117684	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4120	NC_004606	TTC	2	6	1117686	1117691	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4121	NC_004606	TTC	2	6	1117743	1117748	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4123	NC_004606	GAC	2	6	1117803	1117808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4124	NC_004606	TTTTG	2	10	1117892	1117901	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
4125	NC_004606	GCT	2	6	1117960	1117965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4126	NC_004606	GTA	2	6	1117977	1117982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4127	NC_004606	TGA	2	6	1118099	1118104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4128	NC_004606	CT	3	6	1118125	1118130	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4129	NC_004606	TCT	2	6	1118161	1118166	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4130	NC_004606	CCT	2	6	1118201	1118206	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4131	NC_004606	A	7	7	1118229	1118235	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4132	NC_004606	AGCT	2	8	1118282	1118289	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4133	NC_004606	TCA	2	6	1118335	1118340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4134	NC_004606	T	8	8	1123809	1123816	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4135	NC_004606	CTT	2	6	1123837	1123842	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4136	NC_004606	TCC	2	6	1124480	1124485	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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4151	NC_004606	T	6	6	1131790	1131795	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4260	NC_004606	TC	3	6	1167631	1167636	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4261	NC_004606	T	7	7	1167638	1167644	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4262	NC_004606	T	6	6	1167753	1167758	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4263	NC_004606	TGA	2	6	1167772	1167777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4405	NC_004606	T	6	6	1219386	1219391	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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