MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Staphylococcus epidermidis ATCC 12228 chromosome

Total Repeats: 11149

< Previous12...11121314151617181920212223Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_004461	TA	3	6	2465679	2465684	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11002	NC_004461	ATC	2	6	2465685	2465690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11003	NC_004461	GAT	2	6	2465737	2465742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11004	NC_004461	AAAT	2	8	2465743	2465750	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11005	NC_004461	AT	3	6	2465749	2465754	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11006	NC_004461	AAAAAG	2	12	2465768	2465779	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11007	NC_004461	ACT	2	6	2465806	2465811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11008	NC_004461	TTC	2	6	2465845	2465850	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11009	NC_004461	TTA	2	6	2465894	2465899	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11010	NC_004461	AATT	2	8	2465911	2465918	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11011	NC_004461	TA	3	6	2465993	2465998	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11012	NC_004461	A	6	6	2466018	2466023	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11013	NC_004461	AT	3	6	2466125	2466130	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11014	NC_004461	ATA	2	6	2466613	2466618	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11015	NC_004461	ATC	2	6	2466637	2466642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11016	NC_004461	GAG	2	6	2466724	2466729	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11017	NC_004461	ATC	2	6	2467286	2467291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11018	NC_004461	GT	3	6	2467385	2467390	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11019	NC_004461	GTA	2	6	2467393	2467398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11020	NC_004461	CTTAA	2	10	2467451	2467460	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
11021	NC_004461	GATA	2	8	2467461	2467468	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11022	NC_004461	ATC	2	6	2467469	2467474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11023	NC_004461	AAC	2	6	2467475	2467480	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11024	NC_004461	T	6	6	2467507	2467512	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11025	NC_004461	AAT	2	6	2467555	2467560	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11026	NC_004461	TTTAT	2	10	2467580	2467589	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
11027	NC_004461	ATA	2	6	2467597	2467602	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11028	NC_004461	ATT	2	6	2467611	2467616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11029	NC_004461	ATT	2	6	2467627	2467632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11030	NC_004461	T	7	7	2467631	2467637	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11031	NC_004461	GGA	2	6	2467670	2467675	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11032	NC_004461	AT	3	6	2469205	2469210	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11033	NC_004461	CAT	2	6	2469233	2469238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11034	NC_004461	CAT	2	6	2469240	2469245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11035	NC_004461	ATGA	2	8	2470964	2470971	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11036	NC_004461	AAAT	2	8	2475900	2475907	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11037	NC_004461	AAT	2	6	2475920	2475925	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11038	NC_004461	AAAAC	2	10	2475994	2476003	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
11039	NC_004461	AAT	2	6	2476004	2476009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11040	NC_004461	T	6	6	2476009	2476014	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11041	NC_004461	A	6	6	2476015	2476020	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11042	NC_004461	TAATA	2	10	2476026	2476035	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
11043	NC_004461	ATT	2	6	2476051	2476056	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11044	NC_004461	TAAA	2	8	2476103	2476110	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11045	NC_004461	TAT	2	6	2476125	2476130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11046	NC_004461	TAA	2	6	2476191	2476196	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11047	NC_004461	CTA	2	6	2476203	2476208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11048	NC_004461	ATT	2	6	2476249	2476254	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11049	NC_004461	ATG	2	6	2476279	2476284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11050	NC_004461	TAA	3	9	2476288	2476296	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11051	NC_004461	ATTT	2	8	2476306	2476313	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11052	NC_004461	AG	3	6	2476363	2476368	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11053	NC_004461	ACC	2	6	2476410	2476415	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11054	NC_004461	AATT	2	8	2476425	2476432	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11055	NC_004461	ATAA	2	8	2476491	2476498	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11056	NC_004461	AGA	2	6	2476538	2476543	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11057	NC_004461	TTTC	2	8	2476651	2476658	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
11058	NC_004461	TTAAG	2	10	2476681	2476690	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
11059	NC_004461	GAA	2	6	2476742	2476747	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11060	NC_004461	TA	3	6	2476807	2476812	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11061	NC_004461	ATA	2	6	2476897	2476902	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11062	NC_004461	CAA	2	6	2476903	2476908	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11063	NC_004461	ATT	2	6	2476941	2476946	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11064	NC_004461	A	6	6	2476956	2476961	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11065	NC_004461	CTTTAA	2	12	2476970	2476981	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11066	NC_004461	TAA	3	9	2476979	2476987	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11067	NC_004461	CA	3	6	2477064	2477069	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11068	NC_004461	GCT	2	6	2477098	2477103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11069	NC_004461	AAC	2	6	2477139	2477144	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11070	NC_004461	T	6	6	2477152	2477157	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11071	NC_004461	TAA	2	6	2477202	2477207	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11072	NC_004461	T	6	6	2477208	2477213	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11073	NC_004461	TTA	2	6	2479324	2479329	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11074	NC_004461	ATA	2	6	2480428	2480433	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11075	NC_004461	AACA	2	8	2480440	2480447	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
11076	NC_004461	ATT	3	9	2480456	2480464	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11077	NC_004461	ATT	2	6	2483335	2483340	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11078	NC_004461	TAA	2	6	2483342	2483347	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11079	NC_004461	ATA	2	6	2483557	2483562	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11080	NC_004461	A	6	6	2485711	2485716	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11081	NC_004461	TTA	2	6	2485746	2485751	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11082	NC_004461	T	7	7	2485753	2485759	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11083	NC_004461	AAT	2	6	2485832	2485837	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11084	NC_004461	ATT	2	6	2485845	2485850	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11085	NC_004461	TTAT	2	8	2485909	2485916	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11086	NC_004461	TAA	2	6	2485917	2485922	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11087	NC_004461	A	6	6	2485944	2485949	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11088	NC_004461	TAA	2	6	2485969	2485974	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11089	NC_004461	TGAGT	2	10	2485989	2485998	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
11090	NC_004461	TA	3	6	2486017	2486022	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11091	NC_004461	AAT	2	6	2486089	2486094	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11092	NC_004461	ACC	2	6	2486119	2486124	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11093	NC_004461	T	6	6	2486158	2486163	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11094	NC_004461	AAT	2	6	2486232	2486237	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11095	NC_004461	TAA	2	6	2486282	2486287	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11096	NC_004461	TCCATA	2	12	2486323	2486334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11097	NC_004461	ATTA	2	8	2486354	2486361	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11098	NC_004461	T	6	6	2486405	2486410	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11099	NC_004461	ATTCA	2	10	2486411	2486420	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
11100	NC_004461	A	6	6	2486423	2486428	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11101	NC_004461	T	6	6	2486429	2486434	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11102	NC_004461	TTC	2	6	2486438	2486443	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11103	NC_004461	TGAT	2	8	2486447	2486454	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
11104	NC_004461	AT	4	8	2486479	2486486	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11105	NC_004461	TAA	2	6	2486533	2486538	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11106	NC_004461	ATT	2	6	2489714	2489719	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11107	NC_004461	A	7	7	2489734	2489740	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11108	NC_004461	AT	3	6	2489763	2489768	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11109	NC_004461	ATCA	2	8	2489770	2489777	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11110	NC_004461	ATTAGT	2	12	2489790	2489801	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11111	NC_004461	TTAA	2	8	2489810	2489817	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11112	NC_004461	TAT	2	6	2489839	2489844	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11113	NC_004461	TAA	2	6	2489846	2489851	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11114	NC_004461	TAA	2	6	2489874	2489879	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11115	NC_004461	AT	3	6	2489889	2489894	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11116	NC_004461	TAT	2	6	2490598	2490603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11117	NC_004461	TGT	2	6	2490605	2490610	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11118	NC_004461	ATT	3	9	2490623	2490631	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11119	NC_004461	ATA	2	6	2490645	2490650	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11120	NC_004461	AAT	2	6	2490651	2490656	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11121	NC_004461	ATT	3	9	2491327	2491335	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11122	NC_004461	AAATC	2	10	2491336	2491345	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
11123	NC_004461	A	6	6	2491474	2491479	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11124	NC_004461	CTC	2	6	2491482	2491487	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11125	NC_004461	TCC	2	6	2492414	2492419	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11126	NC_004461	TCA	2	6	2492937	2492942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11127	NC_004461	TTA	2	6	2493026	2493031	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11128	NC_004461	ATT	2	6	2493047	2493052	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11129	NC_004461	CAT	2	6	2493151	2493156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11130	NC_004461	TC	3	6	2494029	2494034	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11131	NC_004461	ATT	2	6	2494042	2494047	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11132	NC_004461	ATG	2	6	2494057	2494062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11133	NC_004461	CCT	2	6	2498124	2498129	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11134	NC_004461	A	6	6	2498174	2498179	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11135	NC_004461	TAA	2	6	2498182	2498187	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11136	NC_004461	TA	3	6	2498675	2498680	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11137	NC_004461	TAT	2	6	2498723	2498728	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11138	NC_004461	A	8	8	2498735	2498742	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11139	NC_004461	TGA	2	6	2498749	2498754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11140	NC_004461	CCTA	2	8	2498947	2498954	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
11141	NC_004461	TATT	2	8	2498990	2498997	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11142	NC_004461	CT	3	6	2499034	2499039	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11143	NC_004461	TTA	3	9	2499075	2499083	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11144	NC_004461	ACT	2	6	2499103	2499108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11145	NC_004461	TTG	2	6	2499173	2499178	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11146	NC_004461	T	7	7	2499196	2499202	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11147	NC_004461	TAA	3	9	2499215	2499223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11148	NC_004461	ATT	2	6	2499258	2499263	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11149	NC_004461	A	6	6	2499273	2499278	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

< Previous12...11121314151617181920212223Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.