MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Shewanella oneidensis MR-1 plasmid megaplasmid

Total Repeats: 897

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_004349	ATT	2	6	88226	88231	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
502	NC_004349	A	9	9	88260	88268	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
503	NC_004349	ATG	2	6	88280	88285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
504	NC_004349	TAA	2	6	88294	88299	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
505	NC_004349	ATT	2	6	88379	88384	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
506	NC_004349	TAT	2	6	88385	88390	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
507	NC_004349	TTA	2	6	88391	88396	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
508	NC_004349	TGG	2	6	88409	88414	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
509	NC_004349	ATG	2	6	88452	88457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
510	NC_004349	TG	3	6	88492	88497	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
511	NC_004349	GATG	2	8	88527	88534	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
512	NC_004349	T	6	6	88553	88558	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
513	NC_004349	ATG	2	6	88571	88576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
514	NC_004349	ATG	2	6	88590	88595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
515	NC_004349	TAG	2	6	88610	88615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
516	NC_004349	AT	3	6	88644	88649	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
517	NC_004349	TA	4	8	88691	88698	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
518	NC_004349	AAT	2	6	88699	88704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
519	NC_004349	TTA	2	6	88732	88737	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
520	NC_004349	AT	3	6	89154	89159	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_004349	ACTT	2	8	89926	89933	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
522	NC_004349	A	6	6	89992	89997	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
523	NC_004349	CTA	3	9	90021	90029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
524	NC_004349	GTT	2	6	90031	90036	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
525	NC_004349	ATA	2	6	90049	90054	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
526	NC_004349	TCAT	2	8	90059	90066	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
527	NC_004349	GTT	2	6	94323	94328	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
528	NC_004349	AGA	2	6	94364	94369	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
529	NC_004349	CGT	2	6	94460	94465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
530	NC_004349	AATAA	2	10	94516	94525	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
531	NC_004349	T	6	6	94596	94601	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
532	NC_004349	GTT	2	6	98846	98851	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
533	NC_004349	ACTG	2	8	98914	98921	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
534	NC_004349	TGAT	2	8	98928	98935	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
535	NC_004349	GCA	2	6	98942	98947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
536	NC_004349	GAT	2	6	98957	98962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
537	NC_004349	TTA	2	6	99068	99073	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
538	NC_004349	CTTATT	2	12	99282	99293	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
539	NC_004349	AATAA	2	10	100439	100448	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
540	NC_004349	T	6	6	100519	100524	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
541	NC_004349	GTT	2	6	105088	105093	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
542	NC_004349	TGC	2	6	105156	105161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
543	NC_004349	ATC	2	6	105267	105272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
544	NC_004349	GGAA	2	8	106137	106144	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
545	NC_004349	CTGAG	2	10	106159	106168	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
546	NC_004349	GCTC	2	8	106203	106210	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
547	NC_004349	CAA	2	6	106286	106291	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
548	NC_004349	CAAG	2	8	106342	106349	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
549	NC_004349	ACTG	2	8	106399	106406	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
550	NC_004349	ATA	2	6	106443	106448	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
551	NC_004349	AGG	2	6	106540	106545	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
552	NC_004349	GACA	2	8	107598	107605	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
553	NC_004349	ATA	2	6	107652	107657	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
554	NC_004349	AAAC	2	8	107714	107721	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
555	NC_004349	GCT	2	6	107728	107733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
556	NC_004349	ACCC	2	8	107743	107750	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
557	NC_004349	TCACG	2	10	107801	107810	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
558	NC_004349	AAC	2	6	107862	107867	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
559	NC_004349	TCA	2	6	107872	107877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
560	NC_004349	AAATT	2	10	108914	108923	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
561	NC_004349	TAA	2	6	108932	108937	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
562	NC_004349	AAAT	2	8	108938	108945	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NC_004349	TAA	2	6	108981	108986	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
564	NC_004349	TTAA	2	8	108991	108998	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
565	NC_004349	TTAATA	2	12	109063	109074	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
566	NC_004349	TAA	2	6	109081	109086	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
567	NC_004349	ACAA	2	8	109100	109107	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
568	NC_004349	ATC	2	6	109498	109503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
569	NC_004349	TTG	2	6	109511	109516	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
570	NC_004349	TAG	2	6	109545	109550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
571	NC_004349	A	6	6	109660	109665	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
572	NC_004349	GTT	2	6	109936	109941	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
573	NC_004349	ATTA	2	8	109988	109995	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
574	NC_004349	TCA	2	6	110036	110041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
575	NC_004349	CTT	2	6	110096	110101	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
576	NC_004349	T	6	6	110250	110255	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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579	NC_004349	CT	3	6	110390	110395	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
580	NC_004349	TGA	2	6	110412	110417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
581	NC_004349	TG	3	6	110423	110428	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
582	NC_004349	CAAAC	2	10	110552	110561	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
583	NC_004349	AAAC	2	8	110603	110610	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
584	NC_004349	GTG	2	6	110637	110642	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
585	NC_004349	ACC	2	6	110669	110674	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
586	NC_004349	ATG	2	6	110675	110680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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588	NC_004349	TTCA	2	8	110856	110863	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
589	NC_004349	CAA	2	6	110870	110875	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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591	NC_004349	TCA	2	6	111131	111136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
592	NC_004349	GTTG	2	8	111190	111197	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
593	NC_004349	AT	3	6	111294	111299	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
594	NC_004349	ATG	2	6	111311	111316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
595	NC_004349	AT	3	6	111348	111353	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
596	NC_004349	ATG	2	6	111389	111394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
597	NC_004349	TCA	2	6	111482	111487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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599	NC_004349	GA	3	6	111774	111779	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
600	NC_004349	TGT	2	6	111799	111804	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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603	NC_004349	TGT	2	6	111944	111949	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
604	NC_004349	TCA	2	6	111977	111982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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606	NC_004349	GTT	2	6	112169	112174	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
607	NC_004349	GA	3	6	112200	112205	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
608	NC_004349	TGC	2	6	112216	112221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
609	NC_004349	CAT	2	6	112295	112300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
610	NC_004349	TGT	2	6	112330	112335	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
611	NC_004349	TTC	2	6	112376	112381	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
612	NC_004349	CAA	2	6	112545	112550	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
613	NC_004349	GATA	2	8	112555	112562	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
614	NC_004349	AGG	2	6	112618	112623	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
615	NC_004349	CATCA	2	10	112630	112639	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
616	NC_004349	ACA	2	6	112666	112671	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
617	NC_004349	CGG	2	6	112677	112682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
618	NC_004349	ATT	2	6	112769	112774	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
619	NC_004349	T	6	6	112773	112778	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
620	NC_004349	ATT	2	6	112779	112784	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
621	NC_004349	A	7	7	112785	112791	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
622	NC_004349	ATTTT	2	10	112797	112806	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
623	NC_004349	TTAG	2	8	113093	113100	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
624	NC_004349	A	6	6	113112	113117	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
625	NC_004349	ACC	2	6	113226	113231	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
626	NC_004349	CCG	2	6	113303	113308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
627	NC_004349	CGA	2	6	113314	113319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
628	NC_004349	GAA	2	6	113347	113352	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
629	NC_004349	A	7	7	113364	113370	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
630	NC_004349	CAT	2	6	113422	113427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
631	NC_004349	TAT	2	6	114291	114296	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
632	NC_004349	TCA	2	6	114333	114338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
633	NC_004349	T	6	6	114364	114369	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
634	NC_004349	T	6	6	114373	114378	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
635	NC_004349	A	7	7	114404	114410	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
636	NC_004349	A	8	8	114413	114420	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
637	NC_004349	TTA	2	6	115762	115767	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
638	NC_004349	GCT	2	6	115956	115961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
639	NC_004349	GAA	2	6	115997	116002	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
640	NC_004349	TAT	2	6	116063	116068	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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674	NC_004349	ATT	2	6	118867	118872	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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676	NC_004349	CCTC	2	8	118952	118959	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
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