MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shewanella oneidensis MR-1 chromosome

Total Repeats: 16122

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_004347	CAC	2	6	800373	800378	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2502	NC_004347	A	6	6	800399	800404	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2503	NC_004347	CAT	2	6	800420	800425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2504	NC_004347	TGC	2	6	800439	800444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2505	NC_004347	AGC	2	6	800457	800462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2506	NC_004347	CT	3	6	800466	800471	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2507	NC_004347	CA	3	6	800520	800525	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2508	NC_004347	ATT	2	6	800598	800603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2509	NC_004347	T	6	6	800617	800622	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2510	NC_004347	TAAA	2	8	801253	801260	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2511	NC_004347	AGT	2	6	801305	801310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2512	NC_004347	TTA	2	6	801313	801318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2513	NC_004347	TAG	2	6	801351	801356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2514	NC_004347	TA	3	6	801463	801468	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2515	NC_004347	GCG	2	6	801547	801552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2516	NC_004347	TTA	2	6	801554	801559	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2517	NC_004347	CTA	2	6	801609	801614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2518	NC_004347	AAT	2	6	802083	802088	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2519	NC_004347	GTT	2	6	802091	802096	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2520	NC_004347	TGAAA	2	10	802137	802146	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
2521	NC_004347	TAAA	2	8	802171	802178	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2522	NC_004347	T	8	8	802227	802234	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2523	NC_004347	TTA	2	6	802251	802256	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2524	NC_004347	TTA	2	6	802295	802300	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2525	NC_004347	TTAT	2	8	802403	802410	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2526	NC_004347	CTTTC	2	10	802416	802425	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
2527	NC_004347	TAT	2	6	802480	802485	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2528	NC_004347	A	6	6	802487	802492	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2529	NC_004347	T	6	6	802513	802518	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2530	NC_004347	GAAT	2	8	802535	802542	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2531	NC_004347	T	6	6	802624	802629	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2532	NC_004347	CAA	2	6	802693	802698	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2533	NC_004347	TCA	2	6	802730	802735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2534	NC_004347	G	6	6	802790	802795	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2535	NC_004347	AAC	2	6	802809	802814	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2536	NC_004347	ATCGG	2	10	802820	802829	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
2537	NC_004347	GTT	2	6	802832	802837	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2538	NC_004347	CCG	2	6	803183	803188	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2539	NC_004347	TCAA	2	8	803204	803211	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2540	NC_004347	TCAA	2	8	803932	803939	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2541	NC_004347	ATG	2	6	803966	803971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2542	NC_004347	AGC	2	6	804006	804011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2543	NC_004347	GTTC	2	8	804061	804068	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2544	NC_004347	ATG	2	6	804097	804102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2545	NC_004347	GCT	2	6	804128	804133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2546	NC_004347	GGC	2	6	804180	804185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2547	NC_004347	AGCC	2	8	804263	804270	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2548	NC_004347	TGC	2	6	804275	804280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2549	NC_004347	TGT	2	6	804358	804363	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2550	NC_004347	ATT	2	6	804481	804486	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2551	NC_004347	AGGTT	2	10	804574	804583	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
2552	NC_004347	TTTTG	2	10	804588	804597	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
2553	NC_004347	GGC	2	6	804786	804791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2554	NC_004347	ATT	2	6	804855	804860	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2555	NC_004347	CCA	2	6	804874	804879	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2556	NC_004347	TTA	2	6	804923	804928	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2557	NC_004347	GCA	2	6	804950	804955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2558	NC_004347	TA	3	6	805003	805008	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2559	NC_004347	CAG	2	6	805056	805061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2560	NC_004347	TGC	2	6	805066	805071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2561	NC_004347	TAA	2	6	805183	805188	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2562	NC_004347	GAG	2	6	805192	805197	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2563	NC_004347	ATT	2	6	805212	805217	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2564	NC_004347	GTG	2	6	805222	805227	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2565	NC_004347	GTT	2	6	805269	805274	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2566	NC_004347	T	6	6	805334	805339	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2567	NC_004347	GAGT	2	8	805773	805780	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
2568	NC_004347	AGC	2	6	805848	805853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2570	NC_004347	ATG	2	6	805940	805945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2572	NC_004347	TGGC	2	8	806017	806024	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2573	NC_004347	AGCC	2	8	806091	806098	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2574	NC_004347	TGC	2	6	806103	806108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2575	NC_004347	ATT	2	6	806250	806255	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2576	NC_004347	TG	3	6	806268	806273	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2577	NC_004347	TGCT	2	8	806414	806421	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2578	NC_004347	T	7	7	806448	806454	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2581	NC_004347	AT	3	6	808791	808796	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2582	NC_004347	T	7	7	808822	808828	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2583	NC_004347	AACT	2	8	809771	809778	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2584	NC_004347	TGC	2	6	809995	810000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2588	NC_004347	TGAA	2	8	813376	813383	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2589	NC_004347	TGG	2	6	814388	814393	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2590	NC_004347	GT	3	6	814427	814432	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2591	NC_004347	T	7	7	814477	814483	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2592	NC_004347	TGA	2	6	814567	814572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2593	NC_004347	TCA	2	6	814635	814640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2594	NC_004347	ATA	3	9	816063	816071	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2595	NC_004347	TTCA	2	8	816092	816099	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2596	NC_004347	TTC	2	6	816260	816265	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2598	NC_004347	AGC	2	6	817540	817545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2599	NC_004347	TCT	2	6	817707	817712	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2600	NC_004347	TTG	2	6	819533	819538	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2601	NC_004347	T	7	7	819556	819562	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2602	NC_004347	TTA	2	6	819620	819625	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2603	NC_004347	GCA	2	6	819634	819639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2604	NC_004347	GGT	2	6	819641	819646	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2605	NC_004347	T	8	8	819646	819653	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2606	NC_004347	CGG	2	6	819678	819683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2607	NC_004347	T	6	6	820435	820440	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2608	NC_004347	CGA	2	6	820480	820485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2609	NC_004347	ATC	2	6	820559	820564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2611	NC_004347	TCTT	2	8	820638	820645	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2612	NC_004347	ATG	2	6	820681	820686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2613	NC_004347	CAT	2	6	820722	820727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2614	NC_004347	GAAT	2	8	821715	821722	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2615	NC_004347	TA	3	6	821740	821745	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2616	NC_004347	GGGT	2	8	823739	823746	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
2617	NC_004347	GCT	2	6	823806	823811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2618	NC_004347	ACAA	2	8	823834	823841	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
2619	NC_004347	CAT	2	6	823861	823866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2620	NC_004347	T	6	6	826692	826697	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2621	NC_004347	GC	4	8	826745	826752	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2622	NC_004347	TTG	2	6	826776	826781	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2623	NC_004347	GAT	2	6	826843	826848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2624	NC_004347	GA	3	6	826912	826917	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2625	NC_004347	TGT	2	6	829184	829189	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2626	NC_004347	CT	3	6	829208	829213	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2627	NC_004347	CAG	2	6	829247	829252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2628	NC_004347	ATT	2	6	829279	829284	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2629	NC_004347	ATG	2	6	829321	829326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2630	NC_004347	ATC	2	6	829341	829346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2631	NC_004347	TAA	2	6	829354	829359	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2632	NC_004347	A	6	6	831192	831197	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2633	NC_004347	GGTG	2	8	831217	831224	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
2634	NC_004347	A	7	7	833594	833600	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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