MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shewanella oneidensis MR-1 chromosome

Total Repeats: 16122

< Previous12...21222324252627282930313233Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16001	NC_004347	GAC	2	6	4943432	4943437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16002	NC_004347	CAT	2	6	4943613	4943618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16003	NC_004347	GCC	2	6	4943688	4943693	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16004	NC_004347	CAAT	2	8	4943735	4943742	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
16005	NC_004347	AG	3	6	4943859	4943864	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16006	NC_004347	TCA	2	6	4943871	4943876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16007	NC_004347	TC	3	6	4943940	4943945	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16008	NC_004347	ACC	2	6	4943970	4943975	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16009	NC_004347	CTA	2	6	4943999	4944004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16010	NC_004347	AGA	2	6	4944016	4944021	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16011	NC_004347	ACT	2	6	4944044	4944049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16012	NC_004347	TCA	2	6	4944069	4944074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16013	NC_004347	CACC	2	8	4944110	4944117	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
16014	NC_004347	ACC	2	6	4944119	4944124	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16015	NC_004347	CGC	2	6	4944143	4944148	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16016	NC_004347	CTAGC	2	10	4944150	4944159	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
16017	NC_004347	TC	3	6	4944168	4944173	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16018	NC_004347	CTC	2	6	4944401	4944406	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16019	NC_004347	GGT	2	6	4944443	4944448	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16020	NC_004347	CGACT	2	10	4944481	4944490	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
16021	NC_004347	CTTT	2	8	4944505	4944512	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
16022	NC_004347	ATG	2	6	4944515	4944520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16023	NC_004347	GCT	2	6	4944521	4944526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16024	NC_004347	GTT	2	6	4944611	4944616	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16025	NC_004347	GAC	2	6	4944625	4944630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16026	NC_004347	GTCT	2	8	4944648	4944655	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
16027	NC_004347	AGT	2	6	4944660	4944665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16028	NC_004347	GAG	2	6	4944778	4944783	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16029	NC_004347	TCGGT	2	10	4944856	4944865	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
16030	NC_004347	GTCA	2	8	4945152	4945159	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
16031	NC_004347	GGA	2	6	4945175	4945180	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16032	NC_004347	C	6	6	4945185	4945190	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
16033	NC_004347	TCA	2	6	4945231	4945236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16034	NC_004347	TCGC	2	8	4945332	4945339	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
16035	NC_004347	CTA	2	6	4945342	4945347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16036	NC_004347	ATG	2	6	4945434	4945439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16037	NC_004347	TAC	2	6	4945522	4945527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16038	NC_004347	CGT	2	6	4945615	4945620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16039	NC_004347	AAG	2	6	4945657	4945662	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16040	NC_004347	GT	3	6	4945704	4945709	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16041	NC_004347	T	7	7	4945721	4945727	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16042	NC_004347	GACA	2	8	4945742	4945749	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
16043	NC_004347	TCCCT	2	10	4945824	4945833	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
16044	NC_004347	CAA	2	6	4945845	4945850	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16045	NC_004347	TG	3	6	4945857	4945862	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16046	NC_004347	CAA	2	6	4945869	4945874	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16047	NC_004347	AGG	2	6	4945898	4945903	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16048	NC_004347	GTG	2	6	4945969	4945974	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16049	NC_004347	C	7	7	4945979	4945985	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
16050	NC_004347	CTT	2	6	4946003	4946008	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16051	NC_004347	GT	3	6	4946039	4946044	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16052	NC_004347	ACG	2	6	4946140	4946145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16053	NC_004347	GT	3	6	4946208	4946213	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16054	NC_004347	ATG	2	6	4946233	4946238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16055	NC_004347	CGT	2	6	4946245	4946250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16056	NC_004347	TCC	2	6	4946259	4946264	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16057	NC_004347	CCA	2	6	4946295	4946300	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16058	NC_004347	GAC	2	6	4946373	4946378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16059	NC_004347	GCA	2	6	4946385	4946390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16060	NC_004347	TTC	2	6	4946461	4946466	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16061	NC_004347	GCC	2	6	4946704	4946709	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16062	NC_004347	TCC	2	6	4946724	4946729	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16063	NC_004347	C	6	6	4946768	4946773	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
16064	NC_004347	GCT	2	6	4946914	4946919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16065	NC_004347	CTT	2	6	4946939	4946944	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16066	NC_004347	TCC	2	6	4946988	4946993	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16067	NC_004347	CTT	2	6	4947023	4947028	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16068	NC_004347	CA	3	6	4947029	4947034	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16069	NC_004347	CTG	2	6	4947082	4947087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16070	NC_004347	ATC	2	6	4947132	4947137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16071	NC_004347	TCG	2	6	4947157	4947162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16072	NC_004347	CCG	2	6	4947331	4947336	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16073	NC_004347	TGC	2	6	4947365	4947370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16074	NC_004347	GCC	2	6	4947396	4947401	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16075	NC_004347	TGT	2	6	4947445	4947450	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16076	NC_004347	GAA	2	6	4947455	4947460	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16077	NC_004347	AGA	2	6	4947508	4947513	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16078	NC_004347	TCA	2	6	4947552	4947557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16079	NC_004347	CA	3	6	4947646	4947651	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16080	NC_004347	TCA	2	6	4947688	4947693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16081	NC_004347	CAC	2	6	4947705	4947710	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16082	NC_004347	CTT	2	6	4947791	4947796	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16083	NC_004347	GCA	2	6	4947891	4947896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16084	NC_004347	A	6	6	4947974	4947979	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16085	NC_004347	T	6	6	4947995	4948000	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16086	NC_004347	ACTA	2	8	4948021	4948028	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
16087	NC_004347	TTA	2	6	4949496	4949501	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16088	NC_004347	ATT	2	6	4949967	4949972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16089	NC_004347	TAGA	2	8	4950975	4950982	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
16090	NC_004347	A	6	6	4950982	4950987	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16091	NC_004347	ATC	2	6	4951038	4951043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16092	NC_004347	ATT	2	6	4951046	4951051	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16093	NC_004347	CCA	2	6	4951297	4951302	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16094	NC_004347	A	6	6	4951329	4951334	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16095	NC_004347	T	6	6	4951350	4951355	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16096	NC_004347	AAAAAT	2	12	4953217	4953228	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16097	NC_004347	TTCGA	2	10	4954063	4954072	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
16098	NC_004347	GAAAC	2	10	4954088	4954097	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
16099	NC_004347	T	6	6	4954098	4954103	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16100	NC_004347	ATGGA	2	10	4954139	4954148	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
16101	NC_004347	A	6	6	4954182	4954187	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16102	NC_004347	ATAA	2	8	4956414	4956421	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16103	NC_004347	TTTA	2	8	4956430	4956437	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
16104	NC_004347	AAACAA	2	12	4956485	4956496	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
16105	NC_004347	A	6	6	4956576	4956581	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16106	NC_004347	GCC	2	6	4956598	4956603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16107	NC_004347	GGC	2	6	4958060	4958065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16108	NC_004347	CAA	2	6	4958107	4958112	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16109	NC_004347	A	6	6	4958111	4958116	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16110	NC_004347	A	6	6	4958602	4958607	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16111	NC_004347	ACT	2	6	4958617	4958622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16112	NC_004347	ACCTA	2	10	4960046	4960055	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
16113	NC_004347	T	7	7	4963574	4963580	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16114	NC_004347	ATCTAA	2	12	4963851	4963862	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
16115	NC_004347	TGA	2	6	4963868	4963873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16116	NC_004347	TTC	2	6	4963887	4963892	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16117	NC_004347	TGTA	2	8	4967004	4967011	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
16118	NC_004347	GAG	2	6	4967052	4967057	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16119	NC_004347	GAT	2	6	4967712	4967717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16120	NC_004347	TAT	2	6	4967730	4967735	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16121	NC_004347	TAA	2	6	4969708	4969713	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16122	NC_004347	CAA	2	6	4969725	4969730	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

< Previous12...21222324252627282930313233Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.