MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shewanella oneidensis MR-1 chromosome

Total Repeats: 16122

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_004347	ATG	2	6	3899816	3899821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12502	NC_004347	T	6	6	3901202	3901207	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12503	NC_004347	TGAA	2	8	3901272	3901279	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
12504	NC_004347	AGC	2	6	3901350	3901355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12505	NC_004347	CCA	2	6	3901363	3901368	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12506	NC_004347	GAT	2	6	3901407	3901412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12507	NC_004347	TAA	2	6	3901591	3901596	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12508	NC_004347	TGAT	2	8	3901721	3901728	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
12509	NC_004347	TCA	2	6	3901800	3901805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12510	NC_004347	CAA	2	6	3901816	3901821	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12511	NC_004347	TAA	2	6	3901859	3901864	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12512	NC_004347	TAC	2	6	3901883	3901888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12513	NC_004347	TGG	2	6	3901899	3901904	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12514	NC_004347	CTC	2	6	3902014	3902019	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12515	NC_004347	TGG	2	6	3902168	3902173	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12516	NC_004347	ATC	2	6	3902183	3902188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12517	NC_004347	ATC	2	6	3902276	3902281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12518	NC_004347	TCA	2	6	3902307	3902312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12519	NC_004347	CAAT	2	8	3902335	3902342	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
12520	NC_004347	CAGT	2	8	3902379	3902386	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12521	NC_004347	CAA	2	6	3902401	3902406	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12522	NC_004347	ATT	2	6	3902428	3902433	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12523	NC_004347	TAA	2	6	3902448	3902453	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12524	NC_004347	GGT	2	6	3902499	3902504	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12525	NC_004347	GTA	2	6	3902539	3902544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12526	NC_004347	TCA	2	6	3902709	3902714	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12527	NC_004347	TCA	2	6	3902732	3902737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12528	NC_004347	AC	3	6	3902753	3902758	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12529	NC_004347	CTT	2	6	3902765	3902770	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12530	NC_004347	TCA	2	6	3904086	3904091	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12531	NC_004347	CAG	2	6	3904122	3904127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12532	NC_004347	T	6	6	3904128	3904133	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12533	NC_004347	AGC	2	6	3904142	3904147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12534	NC_004347	GTT	2	6	3904170	3904175	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12535	NC_004347	ATTT	2	8	3905219	3905226	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12536	NC_004347	TCA	2	6	3905260	3905265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12537	NC_004347	TAAA	2	8	3905274	3905281	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12538	NC_004347	GA	3	6	3905304	3905309	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12539	NC_004347	CAT	2	6	3906315	3906320	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12540	NC_004347	ACT	2	6	3907331	3907336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12541	NC_004347	TTAC	2	8	3907348	3907355	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12542	NC_004347	GT	3	6	3910313	3910318	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12543	NC_004347	ATT	3	9	3910419	3910427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12544	NC_004347	ATA	2	6	3914161	3914166	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12545	NC_004347	T	6	6	3915357	3915362	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12546	NC_004347	AACT	2	8	3915395	3915402	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
12547	NC_004347	CCTAA	2	10	3917523	3917532	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
12548	NC_004347	GAT	2	6	3917541	3917546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12549	NC_004347	TCA	2	6	3919077	3919082	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12550	NC_004347	A	6	6	3919133	3919138	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12551	NC_004347	TA	3	6	3919165	3919170	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12552	NC_004347	T	6	6	3919193	3919198	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12553	NC_004347	A	6	6	3919202	3919207	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12554	NC_004347	GCA	2	6	3921356	3921361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12555	NC_004347	TTGCA	2	10	3921390	3921399	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
12556	NC_004347	TGA	2	6	3921435	3921440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12557	NC_004347	TAAA	2	8	3922049	3922056	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12558	NC_004347	T	6	6	3922086	3922091	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12559	NC_004347	TCAA	2	8	3922093	3922100	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
12560	NC_004347	GC	4	8	3922192	3922199	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12561	NC_004347	C	6	6	3922241	3922246	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
12562	NC_004347	CAA	2	6	3922257	3922262	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12563	NC_004347	AAC	2	6	3922273	3922278	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12564	NC_004347	AATCAA	2	12	3925562	3925573	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12565	NC_004347	AGG	2	6	3925604	3925609	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12566	NC_004347	TCC	2	6	3925623	3925628	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12567	NC_004347	AGCT	2	8	3925727	3925734	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12568	NC_004347	CCAT	2	8	3925737	3925744	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
12569	NC_004347	AG	3	6	3925833	3925838	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12570	NC_004347	CAT	2	6	3925851	3925856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12571	NC_004347	A	6	6	3925871	3925876	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12572	NC_004347	ACCA	2	8	3925906	3925913	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12573	NC_004347	A	6	6	3925922	3925927	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12574	NC_004347	A	6	6	3925938	3925943	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12575	NC_004347	CAT	2	6	3925958	3925963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12576	NC_004347	CAA	2	6	3926001	3926006	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12577	NC_004347	AAC	2	6	3926024	3926029	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12578	NC_004347	AAG	2	6	3926046	3926051	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12579	NC_004347	T	6	6	3926091	3926096	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12580	NC_004347	ATTT	2	8	3926107	3926114	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12581	NC_004347	GACAG	2	10	3927053	3927062	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
12582	NC_004347	GAA	2	6	3927142	3927147	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12583	NC_004347	ACG	2	6	3927338	3927343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12584	NC_004347	GCC	2	6	3927365	3927370	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12585	NC_004347	CAAG	2	8	3927488	3927495	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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12587	NC_004347	TCAA	2	8	3927600	3927607	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
12588	NC_004347	CAAT	2	8	3928448	3928455	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
12589	NC_004347	TGA	2	6	3928668	3928673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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12591	NC_004347	CAA	2	6	3933024	3933029	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12592	NC_004347	CAAA	2	8	3933069	3933076	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
12593	NC_004347	CAA	2	6	3933095	3933100	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12594	NC_004347	CAAT	2	8	3933288	3933295	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
12595	NC_004347	ATA	2	6	3933402	3933407	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12596	NC_004347	AAG	2	6	3935091	3935096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12597	NC_004347	GAG	2	6	3935212	3935217	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12598	NC_004347	T	6	6	3935339	3935344	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12599	NC_004347	ACA	2	6	3935355	3935360	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12600	NC_004347	CGCC	2	8	3935408	3935415	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
12601	NC_004347	CGATG	2	10	3935437	3935446	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
12602	NC_004347	GTC	2	6	3937241	3937246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12603	NC_004347	TATT	2	8	3937294	3937301	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12604	NC_004347	CTG	2	6	3937334	3937339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12605	NC_004347	GAT	2	6	3937386	3937391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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12607	NC_004347	CAA	2	6	3937474	3937479	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12608	NC_004347	GTTC	2	8	3937505	3937512	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
12609	NC_004347	TTG	2	6	3937538	3937543	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12610	NC_004347	TCA	2	6	3937549	3937554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12611	NC_004347	GTT	2	6	3937619	3937624	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12612	NC_004347	CTA	2	6	3939594	3939599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12613	NC_004347	ACA	2	6	3939658	3939663	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12614	NC_004347	T	6	6	3939672	3939677	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12615	NC_004347	ATGG	2	8	3939705	3939712	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
12616	NC_004347	TTA	2	6	3939764	3939769	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12619	NC_004347	AAGG	2	8	3939911	3939918	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12620	NC_004347	AAC	2	6	3939924	3939929	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12621	NC_004347	CCAT	2	8	3939953	3939960	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
12622	NC_004347	TCGT	2	8	3939966	3939973	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
12623	NC_004347	TAA	2	6	3940052	3940057	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12624	NC_004347	ATT	2	6	3940120	3940125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12625	NC_004347	AAC	3	9	3940130	3940138	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12626	NC_004347	CGTGG	2	10	3940196	3940205	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
12627	NC_004347	AGA	2	6	3940255	3940260	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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