MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shewanella oneidensis MR-1 chromosome

Total Repeats: 16122

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_004347	ATT	2	6	3489882	3489887	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11002	NC_004347	AT	3	6	3489905	3489910	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11003	NC_004347	A	6	6	3489919	3489924	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11004	NC_004347	TTAA	2	8	3489976	3489983	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11005	NC_004347	CAA	2	6	3489984	3489989	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11006	NC_004347	T	6	6	3490032	3490037	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11007	NC_004347	TAA	2	6	3490047	3490052	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11008	NC_004347	AAT	2	6	3490074	3490079	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11009	NC_004347	A	7	7	3490126	3490132	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11010	NC_004347	T	6	6	3490147	3490152	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11011	NC_004347	AATGAT	2	12	3490865	3490876	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11012	NC_004347	T	8	8	3491301	3491308	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11013	NC_004347	GTTC	2	8	3491736	3491743	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
11014	NC_004347	ATG	2	6	3491772	3491777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11015	NC_004347	GCA	2	6	3491841	3491846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11016	NC_004347	AGCC	2	8	3491923	3491930	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
11017	NC_004347	TGC	2	6	3491935	3491940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11018	NC_004347	TTA	2	6	3492609	3492614	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11019	NC_004347	A	8	8	3493064	3493071	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11020	NC_004347	CTTATT	2	12	3494741	3494752	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11021	NC_004347	A	7	7	3494786	3494792	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11022	NC_004347	AGC	2	6	3494834	3494839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11023	NC_004347	GCT	2	6	3494848	3494853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11024	NC_004347	CAT	2	6	3497066	3497071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11025	NC_004347	CTG	2	6	3497801	3497806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11026	NC_004347	AGA	2	6	3497811	3497816	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11027	NC_004347	GACT	2	8	3497864	3497871	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11028	NC_004347	T	6	6	3497934	3497939	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11029	NC_004347	CAAA	2	8	3498849	3498856	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
11030	NC_004347	AAG	2	6	3499750	3499755	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11031	NC_004347	CTG	2	6	3500304	3500309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11032	NC_004347	GAT	2	6	3502190	3502195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11033	NC_004347	AT	3	6	3503450	3503455	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11034	NC_004347	A	7	7	3503458	3503464	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11035	NC_004347	CTT	2	6	3503550	3503555	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11036	NC_004347	AATGA	2	10	3505488	3505497	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
11037	NC_004347	A	6	6	3505514	3505519	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11038	NC_004347	T	6	6	3505536	3505541	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11039	NC_004347	TAA	2	6	3505564	3505569	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11040	NC_004347	AAGC	2	8	3505608	3505615	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
11041	NC_004347	AG	3	6	3505645	3505650	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11042	NC_004347	CAT	2	6	3505677	3505682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11043	NC_004347	A	7	7	3505683	3505689	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11044	NC_004347	GAT	2	6	3505730	3505735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11045	NC_004347	CTG	2	6	3505772	3505777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11046	NC_004347	ATC	2	6	3505869	3505874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11047	NC_004347	ACC	2	6	3505876	3505881	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11048	NC_004347	ATCC	2	8	3505909	3505916	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
11049	NC_004347	A	6	6	3505919	3505924	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11050	NC_004347	A	6	6	3505943	3505948	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11051	NC_004347	AATCA	2	10	3505968	3505977	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
11052	NC_004347	AAC	2	6	3506007	3506012	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11053	NC_004347	GCA	2	6	3507062	3507067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11054	NC_004347	CTGA	2	8	3507169	3507176	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11055	NC_004347	AGA	2	6	3508361	3508366	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11056	NC_004347	TAAT	2	8	3508388	3508395	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11057	NC_004347	GAT	2	6	3508423	3508428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11058	NC_004347	A	6	6	3509739	3509744	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11059	NC_004347	A	7	7	3509751	3509757	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11060	NC_004347	CTCGT	2	10	3510489	3510498	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
11061	NC_004347	ACA	2	6	3510501	3510506	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11062	NC_004347	AAG	2	6	3510516	3510521	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11063	NC_004347	GCC	2	6	3510633	3510638	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11064	NC_004347	AAT	2	6	3511762	3511767	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11065	NC_004347	AGT	2	6	3512114	3512119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11066	NC_004347	ATTA	2	8	3513291	3513298	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11067	NC_004347	AAT	2	6	3513299	3513304	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11068	NC_004347	AGT	2	6	3513388	3513393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11069	NC_004347	CGA	2	6	3513465	3513470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11070	NC_004347	A	6	6	3513491	3513496	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11071	NC_004347	CAT	2	6	3513527	3513532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11072	NC_004347	GCA	2	6	3513597	3513602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11073	NC_004347	AGT	2	6	3513620	3513625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11074	NC_004347	TTAGT	2	10	3513636	3513645	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
11075	NC_004347	ATT	2	6	3513722	3513727	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11076	NC_004347	GTA	2	6	3513730	3513735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11077	NC_004347	A	6	6	3513827	3513832	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11078	NC_004347	T	6	6	3513850	3513855	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11079	NC_004347	TCCC	2	8	3513909	3513916	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
11080	NC_004347	CAA	2	6	3514019	3514024	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11081	NC_004347	TGC	2	6	3514049	3514054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11082	NC_004347	CTA	2	6	3514058	3514063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11083	NC_004347	ACT	2	6	3514320	3514325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11084	NC_004347	TTAGT	2	10	3514331	3514340	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
11085	NC_004347	ATT	2	6	3514417	3514422	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11086	NC_004347	GTA	2	6	3514425	3514430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11087	NC_004347	A	6	6	3514522	3514527	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11088	NC_004347	T	6	6	3514545	3514550	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11089	NC_004347	AAATT	2	10	3514920	3514929	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
11090	NC_004347	AGG	2	6	3514993	3514998	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11091	NC_004347	AAAG	2	8	3515660	3515667	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
11092	NC_004347	ATT	2	6	3515668	3515673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11093	NC_004347	AGCCA	2	10	3515674	3515683	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
11094	NC_004347	GCCTA	2	10	3524590	3524599	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
11095	NC_004347	ACC	2	6	3524616	3524621	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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11097	NC_004347	GGC	2	6	3526399	3526404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11098	NC_004347	AAC	2	6	3526427	3526432	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11099	NC_004347	CAT	2	6	3527755	3527760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11100	NC_004347	ATT	2	6	3527780	3527785	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11101	NC_004347	ACTA	2	8	3530430	3530437	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11102	NC_004347	ATC	2	6	3530608	3530613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11103	NC_004347	CAA	2	6	3530689	3530694	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11104	NC_004347	A	6	6	3530734	3530739	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11105	NC_004347	ACGA	2	8	3530750	3530757	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
11106	NC_004347	ACTT	2	8	3530790	3530797	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11107	NC_004347	AACA	2	8	3530828	3530835	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
11108	NC_004347	CAG	2	6	3530852	3530857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11109	NC_004347	ATT	2	6	3530872	3530877	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11110	NC_004347	AAT	2	6	3530936	3530941	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11111	NC_004347	GAA	2	6	3530945	3530950	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11112	NC_004347	ACA	2	6	3533396	3533401	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11113	NC_004347	TTAGC	2	10	3533421	3533430	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
11114	NC_004347	TGTT	2	8	3534602	3534609	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
11115	NC_004347	TAAA	2	8	3535253	3535260	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11116	NC_004347	GCC	2	6	3535285	3535290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11117	NC_004347	AAC	2	6	3535692	3535697	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11118	NC_004347	T	6	6	3535710	3535715	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11119	NC_004347	ATCA	2	8	3535726	3535733	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11120	NC_004347	ATC	2	6	3535778	3535783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11121	NC_004347	TCTATT	2	12	3535832	3535843	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11122	NC_004347	TCA	2	6	3535876	3535881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11123	NC_004347	ACA	2	6	3535882	3535887	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11124	NC_004347	AGT	2	6	3535895	3535900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11125	NC_004347	GTA	2	6	3536054	3536059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11126	NC_004347	TTA	2	6	3536176	3536181	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11127	NC_004347	T	6	6	3536199	3536204	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11128	NC_004347	ATAA	2	8	3536220	3536227	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11392	NC_004347	TA	3	6	3607926	3607931	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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