MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shewanella oneidensis MR-1 chromosome

Total Repeats: 16122

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10501	NC_004347	A	7	7	3274018	3274024	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10502	NC_004347	TGC	2	6	3274092	3274097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10503	NC_004347	ATG	2	6	3274138	3274143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10504	NC_004347	A	6	6	3274159	3274164	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10505	NC_004347	TTG	2	6	3274175	3274180	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10506	NC_004347	GAT	2	6	3274216	3274221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10507	NC_004347	TGGA	2	8	3274235	3274242	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
10508	NC_004347	CTA	2	6	3274292	3274297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10509	NC_004347	TCA	2	6	3274439	3274444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10510	NC_004347	CA	3	6	3274679	3274684	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10511	NC_004347	GCT	2	6	3274702	3274707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10512	NC_004347	ACT	2	6	3274723	3274728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10513	NC_004347	AC	3	6	3274876	3274881	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10514	NC_004347	ATCA	2	8	3274899	3274906	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10515	NC_004347	TGA	2	6	3274933	3274938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10516	NC_004347	GTG	3	9	3275014	3275022	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10517	NC_004347	AAAGC	2	10	3275074	3275083	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
10518	NC_004347	GAT	2	6	3275151	3275156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10519	NC_004347	GTC	2	6	3275371	3275376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10520	NC_004347	GC	3	6	3275384	3275389	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10521	NC_004347	ATT	2	6	3275395	3275400	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10522	NC_004347	TTA	2	6	3275439	3275444	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10523	NC_004347	ATG	2	6	3275451	3275456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10524	NC_004347	GTT	2	6	3275492	3275497	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10525	NC_004347	CGT	2	6	3275542	3275547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10526	NC_004347	ATG	2	6	3275577	3275582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10527	NC_004347	GGT	2	6	3275618	3275623	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10528	NC_004347	GTGAA	2	10	3275736	3275745	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
10529	NC_004347	CAA	2	6	3275786	3275791	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10530	NC_004347	GTA	2	6	3275861	3275866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10531	NC_004347	TGC	2	6	3275916	3275921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10532	NC_004347	TGG	2	6	3275943	3275948	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10533	NC_004347	GAA	2	6	3276026	3276031	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10534	NC_004347	ATC	2	6	3276081	3276086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10535	NC_004347	TGAC	2	8	3276090	3276097	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10536	NC_004347	TAA	2	6	3276226	3276231	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10537	NC_004347	GAT	2	6	3278447	3278452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10538	NC_004347	GATA	2	8	3278454	3278461	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10539	NC_004347	A	6	6	3278461	3278466	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10540	NC_004347	CAGC	2	8	3278468	3278475	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10541	NC_004347	GCTG	2	8	3278482	3278489	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
10542	NC_004347	ATG	2	6	3278513	3278518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10543	NC_004347	AG	3	6	3278523	3278528	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10544	NC_004347	TTCA	2	8	3278557	3278564	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10545	NC_004347	GTG	2	6	3278611	3278616	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10546	NC_004347	TTC	2	6	3278725	3278730	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10547	NC_004347	CA	3	6	3278815	3278820	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10548	NC_004347	AAC	2	6	3278828	3278833	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10549	NC_004347	ACAA	2	8	3278871	3278878	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
10550	NC_004347	CCA	2	6	3278938	3278943	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10551	NC_004347	TAA	2	6	3278947	3278952	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10552	NC_004347	ATG	2	6	3278999	3279004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10553	NC_004347	GAC	2	6	3279021	3279026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10554	NC_004347	GCA	2	6	3279100	3279105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10555	NC_004347	CCG	2	6	3279136	3279141	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10556	NC_004347	GCA	2	6	3279148	3279153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10557	NC_004347	AGCG	2	8	3279349	3279356	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10558	NC_004347	CAC	2	6	3279362	3279367	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10559	NC_004347	ACC	2	6	3279375	3279380	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10560	NC_004347	CTT	2	6	3279508	3279513	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10561	NC_004347	CAC	2	6	3279529	3279534	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10562	NC_004347	AAT	2	6	3279578	3279583	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10563	NC_004347	TAA	3	9	3279736	3279744	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10564	NC_004347	GCC	2	6	3279832	3279837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10565	NC_004347	AAT	2	6	3279847	3279852	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10566	NC_004347	TAA	2	6	3279910	3279915	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10567	NC_004347	CGGT	2	8	3279947	3279954	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
10568	NC_004347	CGA	2	6	3279966	3279971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10569	NC_004347	AATA	2	8	3280003	3280010	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10571	NC_004347	TTA	2	6	3280052	3280057	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10572	NC_004347	GC	3	6	3280069	3280074	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10573	NC_004347	TAA	2	6	3280110	3280115	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10574	NC_004347	ATC	2	6	3280124	3280129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10576	NC_004347	TAA	2	6	3280255	3280260	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10577	NC_004347	CCA	2	6	3280329	3280334	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10578	NC_004347	GGC	2	6	3280337	3280342	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10579	NC_004347	AAAG	2	8	3280346	3280353	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
10580	NC_004347	TTC	2	6	3280391	3280396	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10581	NC_004347	TAC	2	6	3280513	3280518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10582	NC_004347	CAG	2	6	3280548	3280553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10583	NC_004347	GATC	2	8	3280598	3280605	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10584	NC_004347	ACT	2	6	3280627	3280632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10585	NC_004347	CATG	2	8	3280666	3280673	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10586	NC_004347	ACC	2	6	3280712	3280717	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10587	NC_004347	TCCT	2	8	3282438	3282445	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10588	NC_004347	TCA	2	6	3282476	3282481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10589	NC_004347	GTTAAC	2	12	3282512	3282523	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
10590	NC_004347	TCAA	2	8	3282525	3282532	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10591	NC_004347	T	6	6	3282552	3282557	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10592	NC_004347	ATA	2	6	3282623	3282628	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10593	NC_004347	TGT	2	6	3282692	3282697	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10594	NC_004347	A	7	7	3283183	3283189	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10595	NC_004347	T	6	6	3283207	3283212	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10596	NC_004347	CCG	2	6	3283227	3283232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10597	NC_004347	A	6	6	3283329	3283334	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10598	NC_004347	GT	3	6	3288159	3288164	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10599	NC_004347	GC	3	6	3288170	3288175	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10600	NC_004347	AAC	2	6	3288198	3288203	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10601	NC_004347	GTT	2	6	3288223	3288228	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10602	NC_004347	ACAGC	2	10	3289664	3289673	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
10603	NC_004347	CTTC	2	8	3289677	3289684	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10604	NC_004347	A	6	6	3289762	3289767	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10605	NC_004347	CAT	2	6	3289816	3289821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10607	NC_004347	TCT	2	6	3291699	3291704	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10608	NC_004347	TAAA	2	8	3291767	3291774	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10609	NC_004347	TTCA	2	8	3291776	3291783	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10610	NC_004347	T	6	6	3291803	3291808	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10611	NC_004347	AGT	2	6	3291811	3291816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10612	NC_004347	TAA	2	6	3291825	3291830	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10613	NC_004347	ATA	2	6	3291835	3291840	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10614	NC_004347	ATT	2	6	3293109	3293114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10615	NC_004347	AGC	2	6	3293119	3293124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10616	NC_004347	T	6	6	3293232	3293237	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10617	NC_004347	GTT	2	6	3293536	3293541	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10618	NC_004347	T	8	8	3293540	3293547	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10619	NC_004347	AT	3	6	3293599	3293604	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10620	NC_004347	ATT	2	6	3293623	3293628	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10621	NC_004347	GCC	2	6	3297536	3297541	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10622	NC_004347	TTTA	2	8	3298100	3298107	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10623	NC_004347	ACCA	2	8	3298266	3298273	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10624	NC_004347	AT	3	6	3298308	3298313	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10625	NC_004347	TGAAT	2	10	3298324	3298333	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
10626	NC_004347	AGCGC	2	10	3298368	3298377	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
10627	NC_004347	ATAA	2	8	3299967	3299974	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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