MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shewanella oneidensis MR-1 chromosome

Total Repeats: 16122

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_004347	A	6	6	3115317	3115322	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10002	NC_004347	GAATC	2	10	3115337	3115346	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
10003	NC_004347	AC	3	6	3115354	3115359	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10004	NC_004347	TAAAA	2	10	3115360	3115369	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
10005	NC_004347	A	6	6	3115366	3115371	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10006	NC_004347	AAC	2	6	3115468	3115473	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10007	NC_004347	CGG	2	6	3115530	3115535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10008	NC_004347	CCCG	2	8	3115663	3115670	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
10009	NC_004347	GTG	2	6	3115767	3115772	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10010	NC_004347	AGCC	2	8	3115842	3115849	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10011	NC_004347	CAG	2	6	3116898	3116903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10012	NC_004347	ACTA	2	8	3116931	3116938	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10013	NC_004347	TAA	2	6	3117026	3117031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10014	NC_004347	AGC	2	6	3117050	3117055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10015	NC_004347	TTA	2	6	3117082	3117087	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10016	NC_004347	TGC	2	6	3117098	3117103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10017	NC_004347	GCC	2	6	3117119	3117124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10018	NC_004347	CCAA	2	8	3117260	3117267	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10019	NC_004347	GCC	2	6	3117995	3118000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10020	NC_004347	CAAGCA	2	12	3118019	3118030	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
10021	NC_004347	TTG	2	6	3118043	3118048	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10022	NC_004347	AAG	2	6	3118062	3118067	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10023	NC_004347	AGAAT	2	10	3126313	3126322	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
10024	NC_004347	AATG	2	8	3126404	3126411	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10025	NC_004347	TCA	2	6	3127879	3127884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10026	NC_004347	CG	3	6	3127912	3127917	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10027	NC_004347	GCG	2	6	3127935	3127940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10028	NC_004347	CAT	2	6	3129588	3129593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10029	NC_004347	ATT	2	6	3129655	3129660	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10030	NC_004347	CTT	2	6	3129690	3129695	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10031	NC_004347	CAT	2	6	3129700	3129705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10032	NC_004347	TGG	3	9	3129707	3129715	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10033	NC_004347	T	6	6	3129801	3129806	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10034	NC_004347	TAA	2	6	3134822	3134827	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10035	NC_004347	AAAT	2	8	3134841	3134848	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10036	NC_004347	AAC	3	9	3136908	3136916	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10037	NC_004347	AAC	3	9	3136926	3136934	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10038	NC_004347	TAA	2	6	3138064	3138069	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10039	NC_004347	TGT	2	6	3138077	3138082	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10040	NC_004347	GCC	2	6	3138231	3138236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10041	NC_004347	AAG	2	6	3138285	3138290	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10042	NC_004347	TGT	2	6	3138316	3138321	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10043	NC_004347	CTT	2	6	3139450	3139455	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10044	NC_004347	ACTA	2	8	3139538	3139545	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10045	NC_004347	A	6	6	3139628	3139633	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10046	NC_004347	ATA	2	6	3139645	3139650	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10047	NC_004347	AAC	2	6	3139655	3139660	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10048	NC_004347	ATA	2	6	3139674	3139679	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10049	NC_004347	TA	3	6	3139682	3139687	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10050	NC_004347	CCTT	2	8	3139711	3139718	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10051	NC_004347	TCG	2	6	3139847	3139852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10052	NC_004347	CATC	2	8	3139954	3139961	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
10053	NC_004347	TGG	2	6	3139968	3139973	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10054	NC_004347	AGG	2	6	3139999	3140004	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10055	NC_004347	AAC	2	6	3144101	3144106	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10056	NC_004347	TCAA	2	8	3144111	3144118	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10057	NC_004347	ATT	2	6	3144143	3144148	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10058	NC_004347	AACC	2	8	3146354	3146361	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10059	NC_004347	ATC	2	6	3146438	3146443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10060	NC_004347	CAA	2	6	3146451	3146456	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10061	NC_004347	CAG	2	6	3147564	3147569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10062	NC_004347	CAA	2	6	3147575	3147580	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10063	NC_004347	C	6	6	3147661	3147666	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
10064	NC_004347	TCT	2	6	3147687	3147692	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10065	NC_004347	ATT	2	6	3147700	3147705	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10066	NC_004347	CTCG	2	8	3149364	3149371	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10067	NC_004347	CTT	2	6	3149377	3149382	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10068	NC_004347	GAGT	2	8	3149427	3149434	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
10069	NC_004347	CGA	2	6	3149476	3149481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10070	NC_004347	GCC	2	6	3149589	3149594	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10071	NC_004347	AGTG	2	8	3149606	3149613	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
10072	NC_004347	GTA	2	6	3149668	3149673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10073	NC_004347	GCA	2	6	3149682	3149687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10074	NC_004347	ATC	2	6	3149716	3149721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10075	NC_004347	TGCA	2	8	3149778	3149785	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10076	NC_004347	AGC	2	6	3149836	3149841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10077	NC_004347	CAA	2	6	3150331	3150336	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10078	NC_004347	TCA	2	6	3150395	3150400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10079	NC_004347	ATA	2	6	3150404	3150409	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10080	NC_004347	CAA	2	6	3150432	3150437	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10081	NC_004347	TGAA	2	8	3150485	3150492	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10082	NC_004347	CAA	2	6	3150499	3150504	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10083	NC_004347	CAA	2	6	3150524	3150529	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10084	NC_004347	CCAT	2	8	3150539	3150546	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
10085	NC_004347	CAA	2	6	3150554	3150559	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10086	NC_004347	TCA	2	6	3150618	3150623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10087	NC_004347	A	6	6	3150650	3150655	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10088	NC_004347	A	6	6	3150671	3150676	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10089	NC_004347	CCA	2	6	3150725	3150730	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10090	NC_004347	CAA	2	6	3150740	3150745	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10091	NC_004347	GTG	2	6	3151850	3151855	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10092	NC_004347	GTTT	2	8	3151857	3151864	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
10093	NC_004347	AGATC	2	10	3151871	3151880	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
10094	NC_004347	CCTT	2	8	3151901	3151908	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10095	NC_004347	CTA	2	6	3151913	3151918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10096	NC_004347	TCA	2	6	3151958	3151963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10097	NC_004347	CCT	2	6	3153085	3153090	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10098	NC_004347	TAG	2	6	3153113	3153118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10099	NC_004347	CGG	2	6	3153174	3153179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10100	NC_004347	TCT	2	6	3153239	3153244	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10101	NC_004347	CTTGC	2	10	3153252	3153261	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
10102	NC_004347	AGC	2	6	3153276	3153281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10103	NC_004347	CA	3	6	3153300	3153305	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10104	NC_004347	CTG	2	6	3153341	3153346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10105	NC_004347	AACT	2	8	3153361	3153368	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10106	NC_004347	AAC	2	6	3153407	3153412	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10107	NC_004347	CAGATG	2	12	3153481	3153492	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
10108	NC_004347	ATA	2	6	3153549	3153554	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10109	NC_004347	GCG	2	6	3153571	3153576	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10110	NC_004347	ATC	2	6	3153604	3153609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10111	NC_004347	CGC	2	6	3153626	3153631	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10112	NC_004347	TAA	2	6	3153653	3153658	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10113	NC_004347	GTT	2	6	3153827	3153832	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10114	NC_004347	CAAC	2	8	3153881	3153888	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10115	NC_004347	TCGG	2	8	3154051	3154058	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
10116	NC_004347	ATC	2	6	3154755	3154760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10117	NC_004347	ATA	2	6	3154919	3154924	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10118	NC_004347	CCCTC	2	10	3156239	3156248	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
10119	NC_004347	T	6	6	3156265	3156270	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10120	NC_004347	CAC	2	6	3156279	3156284	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10121	NC_004347	CATT	2	8	3156291	3156298	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10122	NC_004347	A	6	6	3156375	3156380	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10123	NC_004347	ATA	2	6	3156404	3156409	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10124	NC_004347	TCTT	2	8	3156429	3156436	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
10125	NC_004347	AAAG	2	8	3156448	3156455	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
10126	NC_004347	TTTAT	2	10	3156980	3156989	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
10127	NC_004347	ACCT	2	8	3156998	3157005	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
10128	NC_004347	T	6	6	3157031	3157036	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10129	NC_004347	TTTG	2	8	3157290	3157297	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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10253	NC_004347	AAT	2	6	3210173	3210178	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10255	NC_004347	T	6	6	3210530	3210535	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10256	NC_004347	AAT	2	6	3210583	3210588	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10257	NC_004347	CTAGA	2	10	3210598	3210607	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
10258	NC_004347	T	6	6	3210616	3210621	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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